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公开(公告)号：CN110592235B
公开(公告)日：2022-08-23
申请号：CN201910945253.9
申请日：2019-09-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测奶牛USP16基因CNV标记的方法及其应用：利用实时定量PCR技术，以中国荷斯坦奶牛基因组DNA为模板，分别用引物对P1、P2扩增牛USP16基因的CNV标记位点和内参基因BTF3的一段区域，最后利用2*2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型，并将结果分为多拷贝型、缺失型和正常型。本发明可在DNA水平上检测与中国荷斯坦奶牛泌乳性状密切相关的CNV标记，可加快奶牛优良产乳性能的选育进程，该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN110093425B
公开(公告)日：2022-08-19
申请号：CN201910355325.4
申请日：2019-04-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测小尾寒羊ORMDL1基因CNV标记的方法及其应用：基于实时荧光定量PCR技术，以小尾寒羊耳组织全基因组DNA为模板，扩增小尾寒羊ORMDL1基因的拷贝数变异区域，并以扩增小尾寒羊ANKRD1基因片段作为内参，然后利用2*2‑ΔΔCt的方法计算个体的拷贝数变异类型。通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析，本发明提供的检测小尾寒羊ORMDL1基因CNV标记的方法为建立小尾寒羊ORMDL1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础，以用于加快小尾寒羊品种改良的选育进程，该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN109943647B
公开(公告)日：2022-08-16
申请号：CN201910354837.9
申请日：2019-04-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛MLLT10基因CNV标记的方法及其应用，基于实时荧光定量PCR技术，以黄牛基因组DNA为模板，利用特异性PCR引物扩增黄牛MLLT10基因拷贝数变异区，并扩增黄牛BTF3基因部分片段作为内参，最后利用2‑ΔΔCt方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立黄牛MLLT10基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础，检测方法简单、快速，可用于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN110029156B
公开(公告)日：2022-07-29
申请号：CN201910379421.2
申请日：2019-05-08
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊KAT6A基因CNV标记的方法及其应用。基于实时荧光定量PCR技术，以茶卡羊的血液全基因组DNA为模板，扩增茶卡羊KAT6A基因拷贝数变异区域，并以扩增的茶卡羊ANKDR1基因片段作为内参，利用2–ΔΔCt的方法计算个体的拷贝数，通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析，该拷贝数变异区域的不同基因型显著影响茶卡羊的生长性状。本发明在DNA水平上检测与茶卡羊生长性状密切相关的分子遗传标记，可用于茶卡羊生长性状的标记辅助选择，以便快速建立遗传资源优良的茶卡羊种群。
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公开(公告)号：CN110964838B
公开(公告)日：2022-07-22
申请号：CN202010006026.2
申请日：2020-01-03
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种快速检测绵羊LRRFIP1基因CNV标记的方法及其应用：基于实时荧光定量PCR技术，以绵羊血样全基因组DNA为模板，利用一对特异引物扩增绵羊LRRFIP1基因的拷贝数变异区域的部分片段，利用另外一对特异性引物扩增绵羊ANKRD1基因部分片段作为对照，然后利用2*2‑ΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型，基于绵羊LRRFIP1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联，本发明提供的方法可用于快速建立茶卡羊等地方绵羊品种的遗传资源优势种群，有利于加快茶卡羊等的分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN113444811A
公开(公告)日：2021-09-28
申请号：CN202110893489.X
申请日：2021-08-04
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种基于山羊GPR157基因CNV标记评估生长性状的分子诊断方法及其应用。基于实时荧光定量PCR技术，以山羊个体基因组DNA为模板，以一对特异性引物扩增GPR157基因拷贝数变异区域的部分片段，以另外一对特异性引物扩增MC1R基因的部分片段作为内参，利用2*2‑ΔΔCt判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法基于GPR157基因拷贝数变异与生长性状之间的关联，可用于快速建立山羊遗传资源优势种群，有利于加快山羊分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN112831576A
公开(公告)日：2021-05-25
申请号：CN202110343708.7
申请日：2021-03-30
Applicant: 西北农林科技大学
Inventor： 黄永震 , 丁晓婷 , 贺花 , 李欣淼 , 刘贤 , 柴亚楠 , 李克丽 , 牛梦晓 , 乔小玉 , 郑中华 , 张子敬 , 施巧婷 , 王二耀 , 茹宝瑞 , 胡沈荣 , 王建钦 , 雷初朝 , 陈宏
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种黄牛DYNC1I2基因CNV标记快速辅助检测生长性状的方法及专用试剂盒，以牛血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR技术，用两对引物P1、P2分别对牛DYNC1I2基因CNV区域、内参基因BTF3的一段区域进行扩增，根据2*2‑ΔΔCt确定个体DYNC1I2基因的拷贝数变异类型为多拷贝型、缺失型或正常型。根据DYNC1I2基因拷贝数变异与生长性状的关联分析结果，本发明可以在DNA水平上检测与牛生长性状密切相关的CNV标记，可用于牛生长性状的标记辅助选择，加速良种选育进程。
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公开(公告)号：CN106947826B
公开(公告)日：2020-06-30
申请号：CN201710289845.0
申请日：2017-04-27
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛SERPINA3基因单核苷酸多态性的方法及其应用，以待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P1为引物，PCR扩增黄牛SERPINA3基因部分片段；利用琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物片段大小；用限制性内切酶BstXI酶切PCR扩增片段之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛SERPINA3基因第648位的单核苷酸多态性位点的基因型；本发明提供的检测方法可用于夏南牛等中国地方黄牛品种肉用生长性状的分子标记辅助选择，进而快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号：CN107619857B
公开(公告)日：2020-06-16
申请号：CN201711003896.9
申请日：2017-10-24
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测肉牛KLF8基因CNV标记的方法及其应用：以肉牛品种郏县牛的血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR方法分别扩增其KLF8基因CNV区域和内参基因BTF3，根据2*log2 2‑ΔΔCt将结果分为插入型、缺失型和正常型，鉴定其KLF8基因的拷贝数变异。与郏县牛生产数据的关联分析显示，KLF8不同拷贝数对郏县牛的生长发育有显著影响，其中缺失型个体的胸宽显著高于插入型和正常型个体。本发明在DNA水平上检测与肉牛生产性状密切相关的CNV，可作为肉牛生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记，快速建立遗传资源优良的肉牛种群。
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公开(公告)号：CN111172295A
公开(公告)日：2020-05-19
申请号：CN202010117701.9
申请日：2020-02-25
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛VAMP7基因CNV标记的方法及专用试剂盒：以黄牛的血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR方法分别扩增黄牛VAMP7基因CNV区域和参考基因BTF3的部分片段，根据2*2-ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型，从而鉴定黄牛VAMP7基因的拷贝数变异类型。与云岭牛、夏南牛、皮南牛和郏县红牛生产数据的关联分析显示，正常型个体的十字部高显著高于插入型和正常型个体。本发明通过在DNA水平上检测与云岭牛生长性状密切相关的CNV标记，可用于快速建立云岭牛等地方黄牛品种的遗传资源优势种群，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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