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公开(公告)号:CN107988385B
公开(公告)日:2020-09-29
申请号:CN201711262485.1
申请日:2017-12-04
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测肉牛PLAG1基因Indel标记的方法及其专用试剂盒:基于PCR技术,以肉牛(郏县红牛)的血液基因组DNA池为模板,利用特异引物对P1扩增牛PLAG1基因的Indel位点,然后进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果将不同个体分为缺失型、正常型以及杂合型,本发明提供的方法建立在肉牛PLAG1基因Indel位点与生长性状之间的关联性基础上,方法不仅简单,快速,便于推广应用,而且有利于加快肉牛分子标记辅助选择育种工作。
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公开(公告)号:CN111676273A
公开(公告)日:2020-09-18
申请号:CN202010599560.9
申请日:2020-06-28
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851 , G16B20/30 , G16B40/00
Abstract: 本发明公开了一种检测牛成肌细胞HMGA2基因增强子的方法。根据染色质开放性高通量测序数据分析和序列保守性,并结合双荧光素酶载体报告系统,筛选具备增强子活性的牛HMGA2基因序列片段,根据Hi-C数据分析确定筛选片段中与HMGA2基因启动子产生远距互作的序列,利用CRISPRi系统和实时荧光定量PCR技术验证序列片段功能。本发明从分子和细胞两个水平鉴定出可以促进牛成肌细胞HMGA2基因表达的增强子,可以用于肉牛的基因编辑和转基因育种,从而加快优良肉牛群体选育进程。
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公开(公告)号:CN111560421A
公开(公告)日:2020-08-21
申请号:CN202010550697.5
申请日:2020-06-16
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种夏南牛HMGA2基因Indel标记的检测方法及应用;以夏南牛的基因组DNA为模板,通过PCR扩增夏南牛HMGA2基因部分片段,并利用琼脂糖凝胶电泳对夏南牛个体HMGA2基因chr5:48094736-48094742的7bp插入缺失突变位点快速分型;该检测方法可以在DNA水平上筛查和检测与夏南牛体高密切相关的分子遗传标记,并应用于夏南牛体高的分子标记辅助选择,从而加快夏南牛品种改良的选育进程。
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公开(公告)号:CN107400720B
公开(公告)日:2020-04-21
申请号:CN201710808013.5
申请日:2017-09-08
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种KLF3基因CNV标记辅助检测黄牛生长性状的方法及其专用试剂盒。基于实时荧光定量PCR技术,以黄牛基因组DNA为模板,扩增黄牛KLF3基因的拷贝数变异区域,并扩增牛通用转录因子BTF3基因作为内参,最后利用2‑ΔΔCt方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立牛KLF3基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础,有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单,快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110964838A
公开(公告)日:2020-04-07
申请号:CN202010006026.2
申请日:2020-01-03
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种快速检测绵羊LRRFIP1基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以绵羊血样全基因组DNA为模板,利用一对特异引物扩增绵羊LRRFIP1基因的拷贝数变异区域的部分片段,利用另外一对特异性引物扩增绵羊ANKRD1基因部分片段作为对照,然后利用2*2-ΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型,基于绵羊LRRFIP1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联,本发明提供的方法可用于快速建立茶卡羊等地方绵羊品种的遗传资源优势种群,有利于加快茶卡羊等的分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110964790A
公开(公告)日:2020-04-07
申请号:CN201911404426.2
申请日:2019-12-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊PIGY基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以茶卡羊基因组DNA为模板,利用一对特异引物扩增茶卡羊PIGY基因的拷贝数变异区域部分片段,利用另外一对特异引物扩增茶卡羊的ANKRD1基因部分片段作为参照,然后利用2*2-ΔCt的方法计算个体的拷贝数变异类型,根据对拷贝数变异与茶卡羊生长性状的关联分析结果,本发明提供的方法为利用茶卡羊PIGY基因CNV标记建立生长性状的优势种群奠定了基础,有利于加快分子标记辅助选择育种进程。
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公开(公告)号:CN107475400B
公开(公告)日:2020-03-06
申请号:CN201710802522.7
申请日:2017-09-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/683
Abstract: 本发明公开了一种MYLK4基因辅助检测牛生长性状的方法及其专用试剂盒。以黄牛基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增获得黄牛MYLK4基因;PCR产物经限制性内切酶HhaI消化后,进行琼脂糖凝胶电泳;根据电泳结果鉴定黄牛MYLK4基因第61595位的单核苷酸多态性。本发明所阐述的方法能够检测黄牛MYLK4基因的单核苷酸多态性,可作为与牛生长性状密切相关分子遗传标记,用于牛的辅助选择和分子育种,加快良种牛繁育速度。
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公开(公告)号:CN106755422B
公开(公告)日:2020-02-14
申请号:CN201611219653.4
申请日:2016-12-26
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12Q1/683
Abstract: 本发明公开了一种与黄牛生长性状相关的MEG3基因SNP的检测方法及其应用,根据黄牛MEG3基因外显子区单核苷酸突变位点所在位置,采用PCR‑RFLP、Tetra‑primer ARMS‑PCR技术对黄牛个体进行分型,分型结果与生长数据关联分析。本发明提供的检测方法是在DNA水平上检测与黄牛生产性状密切相关的SNP标记,可用于中国黄牛品种生长性状标记辅助选择中,加快建立优良黄牛种群。
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公开(公告)号:CN110760597A
公开(公告)日:2020-02-07
申请号:CN201911159100.8
申请日:2019-11-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛NCSTN基因拷贝数变异的方法及其应用:基于实时定量PCR,以云岭牛基因组DNA为模板,利用一对特异性PCR引物扩增牛NCSTN基因的拷贝数变异区域部分片段,同时利用另外一对特异性PCR引物扩增牛BTF3基因部分片段作为内参对照,最后利用-ΔΔCt计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立云岭牛NCSTN基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础,有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN106636429B
公开(公告)日:2019-12-13
申请号:CN201710051013.5
申请日:2017-01-23
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/686 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种黄牛ADNCR基因单核苷酸多态性的四引物扩增受阻突变体系PCR检测方法及其应用。以待测黄牛全基因组DNA为模板,通过四引物扩增受阻突变体系PCR扩增长链非编码RNA ADNCR基因片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定长链非编码RNA ADNCR基因在g.1263T>A位点存在不同的基因型。结果发现,长链非编码RNA ADNCR基因g.1263T>A的单核苷酸不同类型与秦川牛的坐骨端宽性状之间存在显著相关,提示长链非编码RNA ADNCR基因单核苷酸多态不同类型可作为提高黄牛生长发育性状的DNA标记,有利于快速建立生长发育性状优良的黄牛遗传资源群体。
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