一种针对序列间重叠检测的方法

    公开(公告)号:CN115641911A

    公开(公告)日:2023-01-24

    申请号:CN202211280417.9

    申请日:2022-10-19

    Abstract: 一种针对序列间重叠检测的方法,具体涉及一种基于第三代测序技术ONT数据的序列间重叠检测的方法,本发明为了解决第三代测序技术在重叠检测时是全部序列进行比对,导致比对速度慢、内存消耗大,且第三代测序技术具有较高的错误率,产生的序列间重叠检测结果准确率不高,可靠性低的问题,它首先将获取的测序序列分为种子序列和映射序列;再构建种子序列的二级哈希索引表;计算种子序列的过滤阈值;最终利用种子序列的二级哈希索引表和过滤阈值将种子序列和映射序列进行比对,得到种子序列和映射序列的重叠信息,再以迭代的方式在每轮迭代开始时重新选取种子序列和映射序列,并重复上述操作,得到测序序列的重叠信息。属于序列重叠检测领域。

    一种基于九绕组电机的单相两级集成充电系统

    公开(公告)号:CN114400750A

    公开(公告)日:2022-04-26

    申请号:CN202111645498.3

    申请日:2021-12-29

    Abstract: 一种基于九绕组电机的单相两级集成充电系统,属于驱动和充电集成技术领域,为解决将九绕组内置式永磁同步电机及驱动逆变器复用为充电模式下对应的网侧滤波电感和功率变换器的单相单级集成充电系统,母线电压存在二次纹波脉动问题。配置构建基于零序电流注入的两级驱动集成充电系统包括:九相电机绕组和三个并联的三相半桥逆变器构建为逆变拓扑结构,为驱动模式;通过切换开关,将两个三相半桥逆变器配置为三相半桥电路,三相半桥电路和六相电机绕组构建为前级AC/DC变换器,一个三相半桥逆变器和三相电机绕组构建为后级DC/DC变换器,前级AC/DC变换器和后级DC/DC变换器构建为充电拓扑结构,为充电模式。用于驱动和充电系统复用。

    一种基于TPBWT自索引结构滑动窗口压缩方法

    公开(公告)号:CN113035278A

    公开(公告)日:2021-06-25

    申请号:CN202110380222.0

    申请日:2021-04-08

    Inventor: 李杨 刘博 王亚东

    Abstract: 一种基于TPBWT自索引结构滑动窗口压缩方法,本发明涉及一种DNA自索引滑动窗口压缩算法。本发明的目的是为了解决现有压缩工具LYZip不能够按照用户需求压缩指定区间数据,压缩耗时长,无法实现多线程压缩问题。一种基于TPBWT自索引结构滑动窗口压缩方法具体过程为:步骤一、数据预处理;步骤二、对步骤一预处理后数据进行分块处理;步骤三、对步骤二分块处理后的每一块进行分流处理;步骤四:将步骤三分流处理后的数据整合为一个压缩文件。本发明用于三代测序DNA数据压缩领域。

    一种阿尔茨海默病发病风险预测模型的构建方法

    公开(公告)号:CN106636398B

    公开(公告)日:2021-01-29

    申请号:CN201611190992.4

    申请日:2016-12-21

    Abstract: 本发明属于医疗检测领域,具体公开了一种阿尔茨海默病发病风险预测模型的构建方法,该方法基于现有的wGRS提出了改进的wGRS方法,计算wGRS时不但考虑了单个SNP的作用,同时也考虑SNP之间的相互作用。该改进的wGRS方法能够对阿尔茨海默病发病风险预测的正确性进一步提高。因此本方法考虑到SNP之间的相互作用对阿尔茨海默病的重要影响,并将SNP之间的相互作用应用到阿尔茨海默病发病风险预测中,进一步提高了阿尔茨海默病发病风险预测的正确率。

    一种个体癌症样本的生物标记物识别方法

    公开(公告)号:CN110675917B

    公开(公告)日:2020-11-13

    申请号:CN201910973485.5

    申请日:2019-10-14

    Inventor: 李杰 王东 王亚东

    Abstract: 本发明是一种个体癌症样本的生物标记物识别方法。本发明先基于两种不同表型的样本数据确定差异表达基因成分,如基因、蛋白质等分子化合物,选取出q个差异表达成分;基于选取的q个差异表达成分,获得平均样本。本发明构建基于平均样本和单体样本的回归模型,对样本进行回归预测,得到样本回归预测的结果;基于样本回归预测的结果和差异表达成分,确定单样本的生物标记。本发明可以针对不同的个体样本选出差异化的生物标记物。

    一种改进的阿尔茨海默病发病风险预测方法

    公开(公告)号:CN106636398A

    公开(公告)日:2017-05-10

    申请号:CN201611190992.4

    申请日:2016-12-21

    CPC classification number: C12Q1/6883 C12Q2600/156 G16B30/00

    Abstract: 本发明属于医疗检测领域,具体公开了一种改进的阿尔茨海默病发病风险预测方法,该方法基于现有的wGRS提出了改进的wGRS方法,计算wGRS时不但考虑了单个SNP的作用,同时也考虑SNP之间的相互作用。该改进的wGRS方法能够对阿尔茨海默病发病风险预测的正确性进一步提高。因此本方法考虑到SNP之间的相互作用对阿尔茨海默病的重要影响,并将SNP之间的相互作用应用到阿尔茨海默病发病风险预测中,进一步提高了阿尔茨海默病发病风险预测的正确率。

    一种基因组结构变异同源性识别方法

    公开(公告)号:CN116343923B

    公开(公告)日:2023-12-08

    申请号:CN202310278479.4

    申请日:2023-03-21

    Abstract: 一种基因组结构变异同源性识别方法,涉及生物信息处理技术领域,针对现有技术中不能对基因组结构变异同源性进行高效识别的问题,本申请建立了一套完整、标准化的基于第三代测序数据的结构变异同源性识别方法。本申请使用设计的结构实现对结构变异同源性的高效识别,并且在整体全面识别的基础上还实现了生物体不同功能区域上的同源性识别。多维度全面的同源性识别有效的促进发现多个体之间结构变异发生的规律与特点等科学问题,从而绘制高精度的人群基因组变异图谱,有助于发现人群基因组变异规律。

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