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公开(公告)号：CN114496085B
公开(公告)日：2022-07-05
申请号：CN202210392556.4
申请日：2022-04-15
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 广州微远基因科技有限公司
Abstract: 本发明涉及一种病原微生物宏基因组生信分析参考品及其制备方法和应用，属于基因检测技术领域。该方法包括以下步骤：建立丰度分布模型：收集临床样本的宏基因组检测数据，建立自变量为测序序列数目因变量为相对丰度的高斯回归模型；标准化高通量测序数据生成：获取参考基因组序列，模拟生成每种微生物物种预定读长和预定测序错误率的高通量序列数据；Gamma‑泊松分布模型：以Gamma‑泊松分布模型拟合临床样本的宏基因组检测数据；参考品制备：以Gamma‑泊松分布模型随机产生一组模拟样本序列数据，并从标准化高通量测序数据中随机挑选相同数目的测序数据，即得。采用该方法得到的生信分析参考品，可全面地评估生物信息分析流程的灵敏度、特异度、召回率和准确性。
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公开(公告)号：CN114496085A
公开(公告)日：2022-05-13
申请号：CN202210392556.4
申请日：2022-04-15
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 广州微远基因科技有限公司
Abstract: 本发明涉及一种病原微生物宏基因组生信分析参考品及其制备方法和应用，属于基因检测技术领域。该方法包括以下步骤：建立丰度分布模型：收集临床样本的宏基因组检测数据，建立自变量为测序序列数目因变量为相对丰度的高斯回归模型；标准化高通量测序数据生成：获取参考基因组序列，模拟生成每种微生物物种预定读长和预定测序错误率的高通量序列数据；Gamma‑泊松分布模型：以Gamma‑泊松分布模型拟合临床样本的宏基因组检测数据；参考品制备：以Gamma‑泊松分布模型随机产生一组模拟样本序列数据，并从标准化高通量测序数据中随机挑选相同数目的测序数据，即得。采用该方法得到的生信分析参考品，可全面地评估生物信息分析流程的灵敏度、特异度、召回率和准确性。
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公开(公告)号：CN113151598B
公开(公告)日：2022-05-03
申请号：CN202110423087.3
申请日：2021-04-20
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种呼吸道RNA病原体(甲流、乙流、合胞病毒、新冠)NGS引物组及试剂盒，所述引物组由594条引物序列组成。本发明针对甲流、乙流、合胞病毒和新型冠状病毒基因组特定设计了594个引物，覆盖整个病毒基因组，提高了病毒的检测并大大提高了病毒基因组序列全长检测的可能，无需PCR扩增即可快速实现病毒基因组全覆盖。
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公开(公告)号：CN112899384A
公开(公告)日：2021-06-04
申请号：CN202110220226.2
申请日：2021-02-26
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6869 , C12Q1/04 , C12N15/11
Abstract: 本公开涉及用于检测分子标志物的试剂在制备用于检测ST11型高毒力碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的试剂盒中的用途、用于检测ST11型高毒力碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的试剂盒、核酸试剂及系统，其中，所述分子标志物包括plt‑1基因，所述plt‑1基因的核酸序列如SEQ ID NO.1所示。本公开将plt‑1基因作为ST11型Hv‑CRKp检测的特异性新型高毒力基因，将其作为ST11型碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌高毒力检测的分子标志物，通过识别ST11型碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌中是否存在plt‑1基因，能够准确区分ST11型Hv‑CRKp与传统的ST11型碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌。
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公开(公告)号：CN112538541A
公开(公告)日：2021-03-23
申请号：CN202011356488.3
申请日：2020-11-26
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
Abstract: 本公开涉及一种用于胞内分枝杆菌检测的试剂盒及系统，该试剂盒包括用于检测分子标志物的试剂，其中，所述分子标志物包括mnhF1基因、codA基因、dmlR基因、acpM C180G位点和sdhA C348G位点中的至少一种。通过识别上述分子标志物，本公开能够实现胞内分枝杆菌的精确检测。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN107236782A
公开(公告)日：2017-10-10
申请号：CN201710414324.3
申请日：2017-06-05
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/04
CPC classification number: C12Q1/04 , G01N2333/195
Abstract: 一种革兰氏阴性菌阳性血培养分离胶及化学试剂前处理方法，抽取3.5ml血培养阳性液至3.5ml分离胶管中；把分离胶管放置到离心机中，离心机在4000g的离心力的作用下离心10min；在勿碰触分离胶管中的分离胶的表面菌膜的条件下对血培养阳性液进行吸弃上清；将1ml菌悬液转移至1.5mlEP管中，往EP管中加入200μl且浓度百分比为10％的SDS，把EP管放置在涡旋振荡仪上进行涡旋震荡1min后，再在室温的条件下把EP管静置5min；获得的菌悬液通过化学试剂处理后进行直接MALDI‑TOF质谱鉴定，有效避免了现有技术中整个过程耗时长的缺陷。
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公开(公告)号：CN104749180A
公开(公告)日：2015-07-01
申请号：CN201510132327.9
申请日：2015-03-25
Applicant: 北京浩辰星月科技有限公司 , 中国医学科学院北京协和医院
Abstract: 本发明公开了一种视觉鉴定分析及药敏鉴定系统，包括：光学及数字图像采集装置、数字图像处理装置和药敏鉴定分析装置。光学及数字图像采集装置，用于提供光源并采集数字图像，发送至数字图像处理装置，利用其中设置的起偏器和检偏器增强被测物的数字图像，利用透镜修正数字图像的立体像差；数字图像处理装置，用于接收数字图像，进行运动捕捉，当感知到目标物码放完毕，对图像进行滤波和特征增强，获得目标样本图像后根据目标样本特征和条形码信息确定目标标本类型，选取检测方法，得到检测结果，进行处理后发送至药敏鉴定分析装置；药敏鉴定分析装置，通过模式识别算法并结合其中预置的CLIS鉴定标准进行药敏鉴定，并给出鉴定结论。
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公开(公告)号：CN119360138A
公开(公告)日：2025-01-24
申请号：CN202411918367.1
申请日：2024-12-24
Applicant: 捷仪科技(北京)有限公司 , 中国医学科学院北京协和医院
IPC: G06V10/764 , G01B11/08 , G06N5/01 , G06V10/26 , G06V10/80 , G06V10/82 , G06N3/0455 , G06N3/08 , G06V20/70
Abstract: 本申请公开一种药敏纸片的抑菌圈测量方法、系统及相关装置。涉及生物医学工程领域，包括：获取培养皿的图像并对培养皿的图像进行图像增强处理，获得目标培养皿图像；从目标培养皿图像中获取药敏纸片上记录的药物信息，获取培养实验信息；将药物信息和培养实验信息输入预设决策树模型，获得预设决策树模型输出的目标抑菌圈类别，预设决策树模型中的节点按照预设标准中影响抑菌圈的影响因素进行划分；将目标培养皿图像和目标抑菌圈类别输入预设多模态分割模型中，获取目标抑菌圈图像范围；将目标培养皿图像中的目标抑菌圈图像范围进行换算，获得培养皿中抑菌圈的物理尺寸。本方法选择更符合当前药敏纸片的抑菌圈范围，提高抑菌圈测量的准确性。
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公开(公告)号：CN119320847A
公开(公告)日：2025-01-17
申请号：CN202411648565.0
申请日：2024-11-18
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 武汉明德生物科技股份有限公司
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , C12R1/93
Abstract: 本发明一种用于腺病毒全基因组测序的方法、引物组及其试剂盒，属于DNA检测技术领域。所述一种用于腺病毒全基因组测序的方法包括如下步骤：S1.采用表1的SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.93所示序列的第一轮扩增引物进行第一轮扩增；S2.采用表2的SEQ ID NO.94～SEQ ID NO.285所示序列的第二轮扩增引物进行第二轮扩增。本发明的方法测序的数据平均长度在0.8kb，相比二代平台的短读长，可以极大的提高腺病毒覆盖的均一性，同时覆盖腺病毒型别全面，可广泛推广。
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公开(公告)号：CN119220743A
公开(公告)日：2024-12-31
申请号：CN202411640269.6
申请日：2024-11-15
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 武汉明德生物科技股份有限公司
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , C12R1/93
Abstract: 本发明一种用于呼吸道合胞病毒全基因组测序的方法、引物组及其试剂盒，属于DNA检测技术领域。所述一种用于呼吸道合胞病毒全基因组测序的方法包括如下步骤：S1.采用表1的SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.35所示序列的第一轮扩增引物以呼吸道合胞病毒cDNA为模板进行第一轮扩增；S2.采用表2的SEQ ID NO.36～SEQ ID NO.227所示序列的第二轮扩增引物以第一轮扩增产物为模板进行第二轮扩增。本发明的方法测序的数据平均长度在0.8kb，极大的提高呼吸道合胞病毒覆盖的均一性。
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