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公开(公告)号：CN116564407B
公开(公告)日：2024-03-15
申请号：CN202310372815.1
申请日：2023-04-10
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明公开了一种全基因组选择预测菊花花期模型的筛选方法。本发明还公开了由所述方法筛选的全基因组选择预测模型在预测菊花花期、筛选菊花品种、菊花花期育种中的应用。本发明还公开了基于全基因组选择高效预测菊花花期的方法。本发明发现全基因组关联分析鉴定获得的显著关联位点以及SVM模型可以快速、高效、精准预测菊花动态花期，准确度可达0.90～0.95。本发明可实现菊花现蕾期、显色期、初开期、盛花期、衰败期以及开花早晚的早期预测，无需进行繁琐的田间全生育期观测，既避免了环境因子以及人为主观因素对花期表型鉴定的影响又大大缩短了育种周期，对于菊花花期改良和周年生产具有重要的理论和实践意义。
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公开(公告)号：CN117248070A
公开(公告)日：2023-12-19
申请号：CN202311333774.1
申请日：2023-10-16
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11 , A01H1/04 , G16B20/20 , G16B30/10
Abstract: 本发明公开了一种菊花托桂花型KASP标记开发方法及其应用。本发明通过基于全基因组重测序的BSA‑seq快速鉴定菊花托桂花型关联位点，并将SNP和InDel关联位点转化成KASP标记，与传统基于PCR和电泳的分子标记相比，KASP标记具有转化成功率高、分型准确、开发费用低、灵活性强、易于自动化等明显优势。开发的KASP‑Chr6__179207697‑G/A鉴定准确率可达76～85％，可在较短时间内完成大批量材料的托桂花型筛选，避免了繁琐的田间花期表型观测，减少了环境因对表型鉴定的影响，从而大大缩短育种周期。本发明为实现菊花托桂花型的早期大规模、高通量、自动化检测筛选奠定了重要基础，对菊花花型MAS育种具有重要的理论和实践意义。
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公开(公告)号：CN107041286B
公开(公告)日：2020-08-18
申请号：CN201710228804.0
申请日：2017-04-10
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明公开了一种菊花插穗生根能力的评价方法，属于植物栽培与育种技术领域。一种菊花插穗生根能力的评价方法，包括对扦插苗根数、平均根长、根粗、最长根长、根表面积、根投影面积和根尖数等根系形态指标进行统计，通过主成分分析和隶属函数对7个形态指标的测量值进行转化，建立评价体系，并以最终得分评价不同品种的生根能力。本发明建立了菊花快速、简便的插穗生根能力量化评价体系，便于大规模菊花品种的生根能力评价工作，从而选择出快速生根的品种进行周年生产，也为进一步的菊花新品种选育奠定了良好基础。
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公开(公告)号：CN106446596B
公开(公告)日：2019-04-30
申请号：CN201610562438.8
申请日：2016-07-15
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明属于生物技术领域，公开了一种与菊花耐涝性显著相关的分子标记及其鉴定方法和应用，包括a.连续两年的耐涝性鉴定；b.菊花品种群体结构及亲缘关系分析；c.关联模型的比较和选择；d.与菊花耐涝性显著关联的分子标记的确定；e.优异等位变异挖掘及亲本选拔。本发明采用盆栽模拟淹水法对100个菊花品种进行连续两年的耐涝性鉴定，采用全基因组关联分析方法检测与耐涝性紧密关联的分子标记位点并进行了优异等位变异的挖掘。本发明检测到4个标记位点与菊花耐涝性显著关联，挖掘了2个优异等位变异并筛选了6份优异菊花品种，这不仅为菊花耐涝性杂交育种工作提供了优异亲本材料也为分子标记辅助育种(MAS)选择提供了一定参考。
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公开(公告)号：CN107815502A
公开(公告)日：2018-03-20
申请号：CN201711176758.0
申请日：2017-11-23
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q2600/13 , C12Q2600/156 , C12Q2600/172
Abstract: 本发明涉及一种鉴定菊花耐涝性的dCAPS标记开发方法及应用，属于生物技术领域，该方法包括以下几个步骤：a、通过GWAS方法挖掘与菊花耐涝性显著关联的SNP位点；b、SNP突变位点特异性酶切位点分析及dCAPS引物设计；c、结合基因型与表型数据预期酶切扩增多态性；d、dCAPS标记在自然耐涝极端群体的验证；e、在F1后代耐涝极端群体中对WT-dCAPS1标记进行进一步验证。本发明开发了一个与菊花耐涝性状共分离的dCAPS共显性标记，命名为WT-dCAPS1，在两个群体的平均鉴定准确率为78.9％，初步认为可以应用于菊花耐涝性分子标记辅助育种，大大缩短育种周期，对于培育耐涝性菊花新品种具有重要的理论和实践意义。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN104313155B
公开(公告)日：2017-09-26
申请号：CN201410581350.1
申请日：2014-10-27
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明属于生物技术领域，提供一种托桂型菊花花器特性QTL分子标记筛选方法，该种方法可用于托桂型菊花花器性状优良基因的定位和克隆及托桂型菊花新品种的培育。包括：1、试验材料及其表型数据的获得；2、菊花连锁图谱构建；3、结合表型数据和分子遗传图谱，进行托桂型菊花花器性状的QTL分析；4、托桂型菊花花器性状关联分子标记的确定。本发明以托桂型秋菊品种‘QX‑053’为母本和非托桂型秋菊品种‘南农惊艳’为父本杂交获得的160株F1分离群体为试材，获得了多个与托桂型菊花花器性状显著关联的分子标记。托桂型菊花花器性状关联分子标记的获得，可用于托桂型菊花花器性状的优良基因的精细定位和克隆，大大提高选择效率，从而加快托桂型菊花育种进程。
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公开(公告)号：CN106446596A
公开(公告)日：2017-02-22
申请号：CN201610562438.8
申请日：2016-07-15
Applicant: 南京农业大学
CPC classification number: G06F19/10 , C12Q1/6895 , C12Q2600/124 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明属于生物技术领域，公开了一种与菊花耐涝性显著相关的分子标记及其鉴定方法和应用，包括a.连续两年的耐涝性鉴定；b.菊花品种群体结构及亲缘关系分析；c.关联模型的比较和选择；d.与菊花耐涝性显著关联的分子标记的确定；e.优异等位变异挖掘及亲本选拔。本发明采用盆栽模拟淹水法对100个菊花品种进行连续两年的耐涝性鉴定，采用全基因组关联分析方法检测与耐涝性紧密关联的分子标记位点并进行了优异等位变异的挖掘。本发明检测到4个标记位点与菊花耐涝性显著关联，挖掘了2个优异等位变异并筛选了6份优异菊花品种，这不仅为菊花耐涝性杂交育种工作提供了优异亲本材料也为分子标记辅助育种(MAS)选择提供了一定参考。
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公开(公告)号：CN106258936A
公开(公告)日：2017-01-04
申请号：CN201610659849.9
申请日：2016-08-11
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明属于杂交育种领域，涉及一种早花、高产型茶、药兼用菊花品种的杂交选育方法。本发明以早花茶用菊品种‘七月白’为母本，分别以高产的‘杭白菊’和高药效成分的‘滁菊’为父本，配置两个杂交组合，进行人工杂交育种，当年收种，第二年春季播种并分苗定植，开花后以花型、花径、花期等为依据，初步筛选优良单株，第三年再扩繁形成株系后，进一步筛选比较花径、花期、单株与单位面积鲜花、干花产量等，筛选优良株系。通过感官品质鉴定，化学成分测定，再采用模糊综合评价法进行分析评价，以筛选早花、高产型茶、药兼用菊花新品系，本发明能够改善茶用菊花期较晚的现状，提高茶用菊产量，满足市场需求，这将对茶用菊的市场开发具有重要意义。
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公开(公告)号：CN104195249A
公开(公告)日：2014-12-10
申请号：CN201410452747.0
申请日：2014-09-05
Applicant: 南京农业大学
CPC classification number: C12Q1/6895
Abstract: 本发明属于生物技术领域，提供一种快速筛选多倍体植物目的基因克隆产物的引物、方法及二者在菊花上的应用以及该引物在试剂盒上的应用。快速筛选目的基因克隆产物的方法包括：(1)引物设计(2)基因克隆扩增(3)检测引物筛选基因克隆产物，确定克隆产物对应的基因是否为目的基因。本发明解决了现有技术中，筛选菊花等多倍体植物目的基因克隆产物过程复杂、效率低下的问题。通过本发明提供的检测引物，每增加1bp长度，筛选目的基因的准确性即提高4倍。例如检测引物长度为18bp，则在原基础上筛选度提高了418倍。检测引物为复杂基因组基因的分子克隆提供思路，大大提高了基因克隆的效率。
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公开(公告)号：CN116469466B
公开(公告)日：2024-02-09
申请号：CN202310379493.3
申请日：2023-04-11
Applicant: 南京农业大学
IPC: G16B30/00 , C12Q1/6895 , G16B30/10 , G16B40/00 , G06F18/2135 , G06N5/01 , G06N20/10 , G06N7/01
Abstract: 涝性分子育种领域具有广阔的应用前景，同时本本发明公开了一种高效预测菊花耐涝性的 发明也可为菊花其他重要性状的分子育种提供方法及其应用。本发明通过全基因组关联分析鉴 依据。定菊花耐涝性显著相关的SNP位点，并在此基础上，比较了不同统计模型和不同密度SNP标记对全基因组预测效果的影响，建立了一种快速、高效、精准筛选优异耐涝菊花品种的方法，预测准确度可达0.949。基于本发明的方法预测出的体系在选育耐涝菊花品种时，不仅能够实现菊花耐涝性的早期选择，缩短育种周期，还有效克服了(56)对比文件Zhiwu Zhang等.Mixed linear modelapproach adapted for genome-wideassociation studies《.nature genetics》.2010,第1-9页.Jiangshuo Su等.Genome-wideassociation study identifies favorableSNP alleles and candidate genes forwaterlogging tolerance in chrysanthemums.《Horticulture Research》.2019,第6卷(第2019期),第1-13页.
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