一种利用SSR指纹图谱鉴别白蜡种的方法

    公开(公告)号:CN104164503A

    公开(公告)日:2014-11-26

    申请号:CN201410380064.9

    申请日:2014-08-04

    CPC classification number: C12Q1/6895 C12Q2600/156 C12Q2600/16

    Abstract: 本发明公开了一种利用SSR指纹图谱鉴别白蜡种的方法,步骤包括:(1)白蜡总DNA提取,(2)SSR序列PCR扩增,(3)PCR扩增产物电泳、染色及鉴定;其中:步骤(2)公开的4对SSR引物组合即可将白蜡DNA进行PCR扩增,获得扩增产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳检测条带差异性明显的结果,并以此构建了白蜡种的SSR指纹图谱。本发明方法从分子水平上对白蜡种质资源进行了准确鉴定,解决了白蜡种质鉴定困难的问题,且检测时间短、重复性好、准确性高、在收集的12个种中具有专一性。

    一种基于转录组测序开发接骨木SSR引物的方法

    公开(公告)号:CN108998561B

    公开(公告)日:2022-05-03

    申请号:CN201811027099.9

    申请日:2018-09-04

    Abstract: 本发明提供一种基于转录组测序开发接骨木SSR引物的方法,所述方法包括:S1.构建接骨木转录组文库并测序,将测序结果进行拼接与组装成一个完整的转录组,取每条基因中最长的转录本作为Unigene,通过拼接得到混合Unigenes库;S2.对步骤S1中的混合Unigenes库进行SSR检测;S3.进行SSR引物设计,并鉴定SSR引物的多态性。本发明共设计出64148对SSR特异引物,通过试验优化方案得到了西洋接骨木荧光SSR‑PCR最优体系,在合成的100对荧光标记SSR引物中,有25对引物具有良好多态性。本发明基于转录组测序开发接骨木SSR引物的方法快捷、准确。

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