一种基于转录组测序开发接骨木SSR引物的方法

    公开(公告)号:CN108998561B

    公开(公告)日:2022-05-03

    申请号:CN201811027099.9

    申请日:2018-09-04

    Abstract: 本发明提供一种基于转录组测序开发接骨木SSR引物的方法,所述方法包括:S1.构建接骨木转录组文库并测序,将测序结果进行拼接与组装成一个完整的转录组,取每条基因中最长的转录本作为Unigene,通过拼接得到混合Unigenes库;S2.对步骤S1中的混合Unigenes库进行SSR检测;S3.进行SSR引物设计,并鉴定SSR引物的多态性。本发明共设计出64148对SSR特异引物,通过试验优化方案得到了西洋接骨木荧光SSR‑PCR最优体系,在合成的100对荧光标记SSR引物中,有25对引物具有良好多态性。本发明基于转录组测序开发接骨木SSR引物的方法快捷、准确。

    一种与竹子耐寒性相关的SSR分子标记、SSR引物及其应用

    公开(公告)号:CN112430683B

    公开(公告)日:2022-07-19

    申请号:CN202011432241.5

    申请日:2020-12-10

    Abstract: 本发明提供一种与竹子耐寒性相关的SSR分子标记、SSR引物及其应用,属于分子标记及其检测技术领域。本发明通过转录组测序结果,进一步筛选ICE1‑CBF‑COR通路相关基因,在相关通路里找到了与抗寒标记相关的38条unigene,根据unigene里SSR位点分布特点,合成38对SSR引物,通过引物筛选,最终得到了9对多态性较好的位点,并进一步进行验证,最终证明上述SSR引物扩增获得的SSR分子标记可用于竹子种质资源耐寒鉴定。本发明检测方法在短时间内即可完成耐寒竹子鉴定,具有高效、准确、低成本、操作简便等优势,可应用于竹子种质资源或品种的耐寒鉴定及分子辅助育种,具有良好的实际生产和应用之价值。

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