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公开(公告)号：CN113470751A
公开(公告)日：2021-10-01
申请号：CN202110739359.0
申请日：2021-06-30
Applicant: 南方科技大学
Abstract: 本发明提供一种蛋白纳米孔氨基酸序列的筛选方法、蛋白纳米孔及其应用。所述筛选方法包括：评估双孔结构的特征序列，利用模型搜索与所述双孔结构的特征序列相匹配的氨基酸序列，去除冗余候选序列后进行定位和筛选，计算候选序列的匹配长度和包络长度，再进行配准得到与已知的蛋白纳米孔的相对失配关系，分析得到最终序列。通过该方法筛选得到的氨基酸序列形成的蛋白纳米孔与已知T2SS、T3SS以及T4SS的分泌素蛋白相似度较低，所述蛋白纳米孔特有的序列缩小了孔的内径，使其通道孔径较小且选择性较高，是一类新型的选择性较好的蛋白纳米孔，能够应用于在物质检测或海水淡化等多个领域。
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公开(公告)号：CN117824636B
公开(公告)日：2025-04-01
申请号：CN202311554867.7
申请日：2023-11-21
Applicant: 南方科技大学
Abstract: 本申请公开了一种针对非浮力热液羽状流的采样路径规划方法及装置，包括按照预设的搜索路径，在指定区域内获取至少两个连续的第一甲烷浓度；基于每个第一甲烷浓度确定出相应的均匀性指数，并当检测到至少两个连续的均匀性指数均超过预设的指数阈值时，根据预设的距离参数以及第一位置得到目标采样位置；其中，第一位置为至少两个连续的均匀性指数中最后一个均匀性指数所对应的位置；基于目标采样位置进行采样处理。通过实时检测甲烷浓度在指定区域内的最大值，来找到热液羽状流的非浮力层中热液物质最为丰富的区域，并在该热液物质最为丰富的区域进行采样处理，以获取较高研究价值的水体样本，且可有效提高采样效率以及精度。
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公开(公告)号：CN113470751B
公开(公告)日：2024-09-20
申请号：CN202110739359.0
申请日：2021-06-30
Applicant: 南方科技大学
Abstract: 本发明提供一种蛋白纳米孔氨基酸序列的筛选方法、蛋白纳米孔及其应用。所述筛选方法包括：评估双孔结构的特征序列，利用模型搜索与所述双孔结构的特征序列相匹配的氨基酸序列，去除冗余候选序列后进行定位和筛选，计算候选序列的匹配长度和包络长度，再进行配准得到与已知的蛋白纳米孔的相对失配关系，分析得到最终序列。通过该方法筛选得到的氨基酸序列形成的蛋白纳米孔与已知T2SS、T3SS以及T4SS的分泌素蛋白相似度较低，所述蛋白纳米孔特有的序列缩小了孔的内径，使其通道孔径较小且选择性较高，是一类新型的选择性较好的蛋白纳米孔，能够应用于在物质检测或海水淡化等多个领域。
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公开(公告)号：CN117824636A
公开(公告)日：2024-04-05
申请号：CN202311554867.7
申请日：2023-11-21
Applicant: 南方科技大学
Abstract: 本申请公开了一种针对非浮力热液羽状流的采样路径规划方法及装置，包括按照预设的搜索路径，在指定区域内获取至少两个连续的第一甲烷浓度；基于每个第一甲烷浓度确定出相应的均匀性指数，并当检测到至少两个连续的均匀性指数均超过预设的指数阈值时，根据预设的距离参数以及第一位置得到目标采样位置；其中，第一位置为至少两个连续的均匀性指数中最后一个均匀性指数所对应的位置；基于目标采样位置进行采样处理。通过实时检测甲烷浓度在指定区域内的最大值，来找到热液羽状流的非浮力层中热液物质最为丰富的区域，并在该热液物质最为丰富的区域进行采样处理，以获取较高研究价值的水体样本，且可有效提高采样效率以及精度。
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公开(公告)号：CN112980832A
公开(公告)日：2021-06-18
申请号：CN202110444181.7
申请日：2021-04-23
Applicant: 南方科技大学
IPC: C12N15/10
Abstract: 本发明公开了一种核酸的提取方法以及用于核酸提取的试剂盒，涉及核酸提取技术领域，该提取方法包括采用裂解液对样本进行裂解，裂解液包括工作浓度为0.5～6M的强离子性离液盐、工作浓度为0.5v/v％～10v/v％的表面活性剂、工作浓度10v/v％～50v/v％的醇溶液；该裂解液在无需采用蛋白酶K的情况下，即可有效稳定地裂解样本，且裂解过程无需加热，在常温反应的条件下即可完成核酸的有效提取，此外，该提取方法通过在裂解样本时加入磁珠，实现裂解和结合一步完成，在保证提取质量的同时，提高了提取效率，简化了操作流程。
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