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公开(公告)号：CN109545289B
公开(公告)日：2020-10-16
申请号：CN201811597767.1
申请日：2018-12-25
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明的一种基于分级警示结构高通量筛查内分泌干扰物的方法，涉及内分泌干扰物的虚拟筛选与活性预测领域。本发明利用子结构频率分析和子结构占比分析提取活性数据化合物的一级警示结构；利用SARpy软件对满足一级警示结构的化合物进行二级警示结构的提取；利用SARpy软件进行三级警示结构的提取；将一级警示结构和二级警示结构组合构成活性预测模块，在预测模块中先筛查出存在特征结构的化合物，再基于二级警示结构筛查出具有潜在内分泌干扰作用的警示化合物；将三级警示结构作为干扰活性预测模块，而后再基于干扰活性预测模块筛查干扰活性。本发明可以对潜在核受体介导的内分泌干扰物进行高通量筛查。
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公开(公告)号：CN110501510B
公开(公告)日：2020-06-26
申请号：CN201910904152.7
申请日：2019-09-24
Applicant: 南京大学
IPC: G01N33/74
Abstract: 本发明公开了一种基于增强采样分子动力学模拟的混合拟、抗糖皮质激素干扰物的识别方法，基于核受体变构和共调节因子调控机制，采用增强采样分子动力学模拟方法，通过识别局部和全局自由能最低点并进行动态轨迹聚类，提取配体化合物作用下糖皮质激素受体的稳态构象，并根据受体第12号螺旋稳定位置与共调节因子招募/抑制机制的关系，判断受测化合物的内分泌干扰效应，识别和预测拟性、抗性和混合拟、抗糖皮质激素干扰物。相比于传统体外实验方法，此方法成本低廉、效率更高，且避免了混合拟、抗性干扰物的细胞特异性问题；相比于已有的计算机辅助筛选方法，此方法能有效识别稳态构象，实现混合拟、抗糖皮质激素干扰效应的预测。
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公开(公告)号：CN109545289A
公开(公告)日：2019-03-29
申请号：CN201811597767.1
申请日：2018-12-25
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明的一种基于分级警示结构高通量筛查内分泌干扰物的方法，涉及内分泌干扰物的虚拟筛选与活性预测领域。本发明利用子结构频率分析和子结构占比分析提取活性数据化合物的一级警示结构；利用SARpy软件对满足一级警示结构的化合物进行二级警示结构的提取；利用SARpy软件进行三级警示结构的提取；将一级警示结构和二级警示结构组合构成活性预测模块，在预测模块中先筛查出存在特征结构的化合物，再基于二级警示结构筛查出具有潜在内分泌干扰作用的警示化合物；将三级警示结构作为干扰活性预测模块，而后再基于干扰活性预测模块筛查干扰活性。本发明可以对潜在核受体介导的内分泌干扰物进行高通量筛查。
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公开(公告)号：CN105893759B
公开(公告)日：2018-08-24
申请号：CN201610201950.X
申请日：2016-04-01
Applicant: 南京大学
IPC: G06F19/00
CPC classification number: G06F19/12 , G01N2333/723 , G06F19/16 , G06F19/18
Abstract: 本发明公开了一种基于核受体共调节因子的甲状腺激素干扰物虚拟筛选及其干扰活性的定量计算方法，它基于核受体共调节因子调节机制，采用分子动力学模拟和结合自由能计算方法，通过12号螺旋的稳定位置、甲状腺激素的后踢与共激活因子、共抑制因子相互关系判断受测化合物的甲状腺激素干扰效应，区分积极的抗性、消极的抗性和拟性效应，通过计算配体‑受体结合自由能预测相关活性大小。与现有技术相比，本发明相比于传统的体外筛查方法，成本低廉、操作简单、效率更高；相比于其他虚拟筛选方法，此方法更全面地考虑了分子作用机制，可以区分拟性和抗性，定性和定量预测结果更可靠。
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公开(公告)号：CN105891365B
公开(公告)日：2018-07-03
申请号：CN201610252354.4
申请日：2016-04-21
Applicant: 南京大学
CPC classification number: G01N33/5014 , B01D15/00 , G01N33/743 , G06F17/30424 , G06F19/00 , G06F19/326
Abstract: 本发明公开了一种以效应为导向复杂环境样品中目标/非目标雄激素干扰物鉴别方法，其步骤为：样品前处理及初步分离；雄激素活性测试；致毒物质的高通量分离与制备；基于高效液相色谱–飞行时间质谱的活性组分扫描；雄激素干扰物目标性筛选；结合质谱、色谱和毒性特征的雄激素干扰物非目标性鉴别与毒物确认。本发明利用SPE柱和制备分离相串联的方法进行分离，将DMSO作保护剂优化高通量分离浓缩方法，利用目标数据库实现关键毒物目标性鉴别，基于高效液相色谱–飞行时间质谱谱库进行质谱特征鉴别、基于保留时间与化合物物化性质进行色谱特征鉴别、基于分子动力学模拟技术进行毒性特征鉴别，进而实现关键雄激素干扰物的非目标性识别与毒物确认。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN102866225B
公开(公告)日：2015-04-01
申请号：CN201210368897.4
申请日：2012-09-27
Applicant: 南京大学
IPC: G01N30/88
Abstract: 本方法提供一种定量检测水样中全氟辛烷磺酸同分异构体的方法，属于全氟辛烷磺酸监测领域。其步骤包括：（1）固相萃取：量取水样，用固相萃取柱萃取；萃取后，进行离心除去萃取柱中水分，然后用缓冲溶液和甲醇净化干燥后的萃取柱，再用碱性甲醇洗脱净化后的萃取柱，收集洗脱液；（2）萃取液化学处理：将洗脱液氮吹至干，加入衍生化试剂氢氧化四丁基铵溶液和甲基叔丁基醚后混匀，并再次将溶液氮吹至干，加入甲基叔丁基醚混匀定容；（3）气相色谱-质谱检测。本发明成功地实现PFOS同分异构体的有效分离，达到对PFOS同分异构体的准确定量检测。与已有的测试技术相比，本发明实现了样品中PFOS同分异构体的定量分析检测，解决了PFOS定量误差的问题。
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公开(公告)号：CN103529145A
公开(公告)日：2014-01-22
申请号：CN201310539205.2
申请日：2013-11-04
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种水样中关键拟/抗雄激素干扰毒物快速鉴别方法。其主要包括以下步骤：水样通过固相萃取柱进行富集，萃取柱负压真空干燥；依次用有机溶剂洗脱萃取柱，将洗脱液浓缩，定容，一半用于拟/抗雄激素总毒性测试，并基于标准物质EC50与稀释倍数计算总毒性当量，另一半用于有毒样品的主要致毒物质鉴别；基于常见拟/抗雄激素活性毒物的质谱特征与毒性当量建立毒物质量平衡数据库，进而基于定性分析与定量分析的结果，进行毒性当量与毒性贡献率计算，确定主要致毒物质。本发明样品需求量少，试剂消耗少，成本低，步骤少，却能较快速的鉴别不同污染水平水体中的拟/抗雄激素毒物。
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公开(公告)号：CN102866225A
公开(公告)日：2013-01-09
申请号：CN201210368897.4
申请日：2012-09-27
Applicant: 南京大学
IPC: G01N30/88
Abstract: 本方法提供一种定量检测水样中全氟辛烷磺酸同分异构体的方法，属于全氟辛烷磺酸监测领域。其步骤包括：（1）固相萃取：量取水样，用固相萃取柱萃取；萃取后，进行离心除去萃取柱中水分，然后用缓冲溶液和甲醇净化干燥后的萃取柱，再用碱性甲醇洗脱净化后的萃取柱，收集洗脱液；（2）萃取液化学处理：将洗脱液氮吹至干，加入衍生化试剂氢氧化四丁基铵溶液和甲基叔丁基醚后混匀，并再次将溶液氮吹至干，加入甲基叔丁基醚混匀定容；（3）气相色谱-质谱检测。本发明成功地实现PFOS同分异构体的有效分离，达到对PFOS同分异构体的准确定量检测。与已有的测试技术相比，本发明实现了样品中PFOS同分异构体的定量分析检测，解决了PFOS定量误差的问题。
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公开(公告)号：CN102841162A
公开(公告)日：2012-12-26
申请号：CN201210377070.X
申请日：2012-10-08
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明提供了一种同时快速测定饮用水中多种有机磷酸酯阻燃剂含量的方法，属于有机磷酸酯阻燃剂的检测领域。主要步骤包括固相小柱萃取、溶剂洗脱、浓缩定容和待测样品使使用高效液相色谱-三重四极杆质谱联用仪进行测定。本发明通过建立并优化超高效液相色谱、串联质谱条件参数，能实现对三大类（无卤代、氯代、溴代）共10种有机磷酸酯的同时测定，且检测方法有很好的选择性和灵敏度，并利用二级质谱在化合物定性上的优势，实现快速、准确定量检测水环境中多种有机磷酸酯的含量，弥补了目前该领域技术的不足。
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公开(公告)号：CN119380859A
公开(公告)日：2025-01-28
申请号：CN202411622127.7
申请日：2024-11-14
Applicant: 南京大学
IPC: G16C20/30 , G16C20/70 , G16C10/00 , G06F18/243 , G06F18/2411 , G06F18/2413
Abstract: 本申请公开了一种内分泌干扰物定量活性的预测方法，涉及内分泌干扰物的虚拟筛查领域，包括：获取核受体体外实验数据，并剔除实验数据中的重复数据，以及剔除不包含简化分子线性输入规范SMILES表示的化合物集；采用分子指纹方法，提取化合物的一级、二级和三级特征结构。针对每一个化合物簇，构建基于机器学习或定量read‑across的定量预测模型，用于预测化合物的定量活性值；针对现有技术中内分泌干扰物定量活性预测效率低，本申请提取化合物的多级结构特征，针对不同规模的化合物结构簇构建相应的定量预测模型。通过分子对接和分子动力学模拟，从结构生物学角度研究内分泌干扰物与核受体的相互作用机制等，提高了效率。
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