一种追踪土传植物致病菌传播耐药基因的荧光标记方法

    公开(公告)号:CN114807196B

    公开(公告)日:2023-08-15

    申请号:CN202210321403.0

    申请日:2022-03-30

    Abstract: 本发明公开了一种追踪土传植物致病菌传播耐药基因的荧光标记方法,通过荧光标记技术、乳糖操纵子技术和聚合酶链式反应技术结合,在植物致病菌基因组中glms基因后插入调节基因(lacI)和红色荧光基因;将含有LacI阻遏蛋白结合位点的lacZ启动子区域与绿色荧光基因的多重抗性可转移质粒转入至植物致病菌,植物致病菌仅红色荧光表达。通过植物致病菌跨种属传播ARGs评估方法,供体菌株体内抗性质粒转移至受体菌株,质粒荧光表达抑制解除,通过荧光显微镜和高通量流式细胞仪可进行分选回收。这种方法能追踪区分供受体菌株,有利于评价土传植物致病菌与ARGs的互作机制,为土传病害阻控策略的制定提供理论依据。

    一种土壤细菌可移动遗传元件的宏基因组溯源分析方法

    公开(公告)号:CN114974410A

    公开(公告)日:2022-08-30

    申请号:CN202210596560.2

    申请日:2022-05-30

    Abstract: 本发明公开了一种土壤细菌可移动遗传元件的宏基因组溯源分析方法,其步骤为:步骤一、构建MGEs数据库;步骤二、构建非冗余蛋白质集合;步骤三、使用Reads Mapping的方法对非冗余蛋白质集合进行MGEs信息注释,获取MGEs物种溯源信息;步骤四、通过筛选并去除冗余后构建MGEs物种溯源数据库;步骤五、对MGEs物种溯源数据库封装,搭建分析平台;步骤六、采集环境样品进行DNA抽提建库,用Illumina测序技术进行宏基因组测序分析,获取原始数据;步骤七、原始数据使用FastQC进行质控并去除人类基因组污染,获取质控数据Cleandata;步骤八、质控数据输入分析平台,获取MGEs物种溯源丰度表。本发明大大提高了MGEs分析的速度以及准确性,实现了基于宏基因组测序数据进行MGEs物种溯源的快速分析。

    一种追踪土传植物致病菌传播耐药基因的荧光标记方法

    公开(公告)号:CN114807196A

    公开(公告)日:2022-07-29

    申请号:CN202210321403.0

    申请日:2022-03-30

    Abstract: 本发明公开了一种追踪土传植物致病菌传播耐药基因的荧光标记方法,通过荧光标记技术、乳糖操纵子技术和聚合酶链式反应技术结合,在植物致病菌基因组中glms基因后插入调节基因(lacI)和红色荧光基因;将含有LacI阻遏蛋白结合位点的lacZ启动子区域与绿色荧光基因的多重抗性可转移质粒转入至植物致病菌,植物致病菌仅红色荧光表达。通过植物致病菌跨种属传播ARGs评估方法,供体菌株体内抗性质粒转移至受体菌株,质粒荧光表达抑制解除,通过荧光显微镜和高通量流式细胞仪可进行分选回收。这种方法能追踪区分供受体菌株,有利于评价土传植物致病菌与ARGs的互作机制,为土传病害阻控策略的制定提供理论依据。

    一种基于16SrRNA扩增子测序检测土壤致病细菌生物污染的方法

    公开(公告)号:CN114703265A

    公开(公告)日:2022-07-05

    申请号:CN202210309960.0

    申请日:2022-03-28

    Abstract: 本发明公开了一种基于16SrRNA扩增子测序检测土壤致病细菌生物污染的方法,其包括步骤为:步骤一、构建土壤非冗余致病细菌数据库;步骤二、完成对土壤/植物样品DNA的提取;步骤三、完成样品的16S rRNA基因测序,获得测序下机数据;步骤四、采用DADA2分析流程封装土壤非冗余致病细菌库,获得代表性序列;步骤五、将代表性序列与土壤非冗余致病菌数据库比对注释致病细菌,得到最终的ASV物种表,通过R语言对ASV物种表中不同样品的致病细菌组成、多样性特征等进行可视化作图。本发明能快速、精准检测致病菌,且不易受到样品污染的影响,可而可实现快速、全面、准确检测致病菌的目标。

    一种东方伊萨酵母菌株ZT-C2及其应用

    公开(公告)号:CN109294921B

    公开(公告)日:2021-08-10

    申请号:CN201810822897.4

    申请日:2018-07-25

    Abstract: 本发明公开一种东方伊萨酵母菌株ZT‑C2及其应用,除硫脱氮菌ZT‑C2,于2018年6月25日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心,菌种保藏号为CGMCC NO.16008,分类命名为:东方伊萨酵母(Issatchenkia orientalis),地址为:北京市朝阳区北辰西路1号院3号,中国科学院微生物研究所,邮编:100101。经过试验,该菌株接种到污水中在12小时对水中的硫化氢去除率达到60%以上,24小时对水中的硫化氢去除率达到80%以上,20天后对污水中氨的去除率达到60%左右,23天后对废水中氨的去除率接近70%,进一步说明该菌种活力高,适应性强,除硫脱氮效率高。

    一种巨大芽孢杆菌菌株ZT-P及其应用

    公开(公告)号:CN108676744B

    公开(公告)日:2020-07-28

    申请号:CN201810465041.6

    申请日:2018-05-16

    Abstract: 本发明公开一种巨大芽孢杆菌菌株ZT‑P及其应用,菌株ZT‑P为巨大芽孢杆菌(Bacillus megaterium.),其性质为溶解有机磷无机磷菌,于2018年4月11日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心,菌种保藏号CGMCC NO.15602。本发明提供的菌株ZT‑P活力高,适应性强,可广泛用于土壤中减肥减药的微生物肥料的处理中。菌株ZT‑P制成的微生物肥料经过试验,在第5天的时候摇瓶中的溶磷量达到最大156.7μg/mL。与诱变前相比,菌株的溶磷率提高了20%,缩短了土壤中有机磷和无机磷的溶解速率。说明制成的微生物有机肥缩短了土壤中有机磷和无机磷的溶解周期和溶解量。

    一种东方伊萨酵母菌株ZT-C2及其应用

    公开(公告)号:CN109294921A

    公开(公告)日:2019-02-01

    申请号:CN201810822897.4

    申请日:2018-07-25

    Abstract: 本发明公开一种东方伊萨酵母菌株ZT-C2及其应用,除硫脱氮菌ZT-C2,于2018年6月25日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心,菌种保藏号为CGMCC NO.16008,分类命名为:东方伊萨酵母(Issatchenkia orientalis),地址为:北京市朝阳区北辰西路1号院3号,中国科学院微生物研究所,邮编:100101。经过试验,该菌株接种到污水中在12小时对水中的硫化氢去除率达到60%以上,24小时对水中的硫化氢去除率达到80%以上,20天后对污水中氨的去除率达到60%左右,23天后对废水中氨的去除率接近70%,进一步说明该菌种活力高,适应性强,除硫脱氮效率高。

    一种巨大芽孢杆菌菌株ZT-P及其应用

    公开(公告)号:CN108676744A

    公开(公告)日:2018-10-19

    申请号:CN201810465041.6

    申请日:2018-05-16

    Abstract: 本发明公开一种巨大芽孢杆菌菌株ZT‑P及其应用,菌株ZT‑P为巨大芽孢杆菌(Bacillus megaterium.),其性质为溶解有机磷无机磷菌,于2018年4月11日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心,菌种保藏号CGMCC NO.15602。本发明提供的菌株ZT‑P活力高,适应性强,可广泛用于土壤中减肥减药的微生物肥料的处理中。菌株ZT‑P制成的微生物肥料经过试验,在第5天的时候摇瓶中的溶磷量达到最大156.7μg/mL。与诱变前相比,菌株的溶磷率提高了20%,缩短了土壤中有机磷和无机磷的溶解速率。说明制成的微生物有机肥缩短了土壤中有机磷和无机磷的溶解周期和溶解量。

    一种研究土壤或微生物动态释放VOCs组分和功能的装置

    公开(公告)号:CN222461419U

    公开(公告)日:2025-02-11

    申请号:CN202420683286.7

    申请日:2024-04-03

    Abstract: 本实用新型公开了一种研究土壤或微生物动态释放VOCs组分和功能的装置,包括第一气泵、第二气泵,在第一气泵出气口设有气流分流器,气流分配器分别经处理通道、对照通道与第二气泵的进气口连接;在处理通道上依次设有第一过滤器、第一螺口洗气瓶、第一上下嘴试剂瓶、第一采样器、第一培育瓶、第二采样器,第一上下嘴试剂瓶盛放微生物或土壤,第一培育瓶用于栽培植物;在对照通道上依次设有第二过滤器、第二螺口洗气瓶、第二上下嘴试剂瓶、第二培育瓶、第三采样器,第二上下嘴试剂瓶为空瓶,第二培育瓶用于栽培植物。本实用新型可以实时监测对比有无土壤或微生物产生VOCs的植株形态变化、根际VOCs组分变化及根际微生物组变化。

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