一种结核分枝杆菌利福平耐药突变的检测方法及试剂盒

    公开(公告)号:CN102229988A

    公开(公告)日:2011-11-02

    申请号:CN201110137795.7

    申请日:2011-05-25

    Abstract: 一种结核分枝杆菌利福平耐药突变的检测方法及试剂盒。涉及结核分枝杆菌耐药突变的检测技术提供一种快速、灵敏、特异的结核分枝杆菌利福平耐药突变的检测方法及试剂盒,包括提取结核分枝杆菌样本的DNA;根据结核分枝杆菌利福平耐药决定区(RRDR)所在rpoB基因序列(GenBank:L27989),利用引物设计软件Primer Premier 5设计引物和探针;构建双管双色实时PCR体系,对结核分枝杆菌利福平耐药决定区的突变进行检测,比较所检测样品与阳性对照之间熔解曲线的熔点(Tm值)的差异,判断样品是否发生突变。引物是设计在rpoB基因利福平耐药决定区的两端,具有高度的特异性。

    一种结核分枝杆菌异烟肼耐药突变检测方法及试剂盒

    公开(公告)号:CN102229987A

    公开(公告)日:2011-11-02

    申请号:CN201110137792.3

    申请日:2011-05-25

    Abstract: 一种结核分枝杆菌异烟肼耐药突变检测方法及试剂盒。涉及结核分枝杆菌耐药突变的检测技术,提供一种低成本、高通量、简便和特异的结核分枝杆菌异烟肼耐药突变检测方法,设计引物和探针:根据GenBank中结核分枝杆菌H37Rv基因组核酸序列,利用引物设计软件Primer Premier 5设计引物和探针;提取结核分枝杆菌样本的DNA;建立PCR反应体系;PCR反应结束后,产物通过熔解曲线进行分析,根据熔解峰的熔点和形状的差异,区分野生型和突变型。采用实时PCR熔解曲线法,不仅能够覆盖几乎所有已知的耐药突变类型,而且具有成本低、操作简便、反应快速、通量高等优点。

    用于多重实时核酸扩增检测的探针编码方法

    公开(公告)号:CN1936019A

    公开(公告)日:2007-03-28

    申请号:CN200510113193.2

    申请日:2005-10-18

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 用于多重实时核酸扩增检测的探针编码方法,涉及一种核酸扩增检测,尤其是涉及一种用于多重实时核酸扩增的探针编码方法,提供一种使目前的多重实时核酸扩增可检测的靶序列数目明显多于目前仪器可检测的荧光染料数目的探针编码方法或探针组合方法。先将核酸扩增检测仪器检测的荧光染料作为荧光探针标记的基本元素,称荧光基本元素;荧光基本元素之间的相互组合标记靶序列的特异指示探针,互相组合是指组合编码、排列编码和指数编码。利用好荧光基本元素数目、循环阈值和各荧光基本元素相对强度这三个变量来产生出任意多个基因特异性荧光指纹图谱,以便在荧光基本元素数目有限的情况下仍能同时检测出许许多多不同核酸序列。适合于多种靶序列的检测。

    一种细菌耐药基因检测的方法

    公开(公告)号:CN111100935B

    公开(公告)日:2023-03-31

    申请号:CN201811257679.7

    申请日:2018-10-26

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本申请提供了一种检测细菌耐药基因的方法,所述方法能够同时检测多个细菌耐药基因在样品中的核酸分子中的存在或水平。此外,本申请还提供了一种探针组和包含一种或多种所述探针组的试剂盒,所述探针组和试剂盒可用于实施本发明的方法。此外,本申请还提供了一种试剂盒,其能够在一轮反应中同时检测多个细菌耐药基因在样品中的核酸分子中的存在或水平。

    一种检测呼吸道病原体的方法

    公开(公告)号:CN110273013B

    公开(公告)日:2022-11-01

    申请号:CN201810204483.5

    申请日:2018-03-13

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本申请提供了一种检测吸道病原体的方法,所述方法能够同时检测多种吸道病原体(例如能够感染呼吸道的细菌、衣原体、支原体、立克次氏体、和真菌)在样品中的存在或水平。此外,本申请还提供了一种探针组和包含一种或多种所述探针组的试剂盒,所述探针组和试剂盒可用于实施本发明的方法。此外,本申请还提供了一种试剂盒,其能够在一轮反应中同时检测多种呼吸道病原体(例如能够感染呼吸道的细菌、衣原体、支原体、立克次氏体、和真菌)在样品中的存在或水平。

    用于核酸检测装置的温度控制方法及装置

    公开(公告)号:CN113377140B

    公开(公告)日:2022-10-04

    申请号:CN202110643334.0

    申请日:2021-06-09

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本发明提供了一种用于核酸检测装置的温度控制方法及检测装置,所述温度控制方法包括如下步骤:S1,获取预先设置的多段温度设定值;S2,获取核酸检测装置采集的多点实时温度,计算得到温度平均值;S3,计算所述多段温度设定值与所述温度平均值的差值;S4,通过P I D控制增量式和所述差值计算或者设定PWM并输出占空比,控制温控模块进行升温和降温。本发明本通过优化温度控制系统,并采取分段温度控制方法,获取不同温度段内的温度差值,不同的温度分段采用不同的P I D控制参数,输出不同的PWM占空比,从而提高核酸检测装置温控系统的升降温速率和精度。

    结核分枝杆菌的分子分型方法

    公开(公告)号:CN112501321B

    公开(公告)日:2022-07-15

    申请号:CN202011302347.3

    申请日:2020-11-19

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本发明涉及生物领域,并具体涉及一种对结核分枝杆菌进行分子分型方法。本发明的方案解决了传统方案中PCR扩增稳定性差、检测通量低、对长片段分辨率低、结果判读困难、人工操作步骤多的难题,能够对>98%的标本进行准确的VNTR‑9分型,对>95%的标本进行准确的HV‑3分型,仅需对工作人员进行简单培训即可进行操作。

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