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公开(公告)号:CN103699815B
公开(公告)日:2017-06-13
申请号:CN201410013164.8
申请日:2014-01-10
Applicant: 北京林业大学
IPC: G06F19/12
Abstract: 本发明提供一种同源四倍体自然群体的连锁不平衡分析模型的构建方法,包括:对来自自然群体中一组同源四倍体植物,设置一个位点A和一个位点B;两个位点产生16单倍型,且分别都具有35种基因型,但在遗传上每个位点能够识别的四倍体基因型有只有15种,因此两个位点共产生225种基因型;从所述自然群体中随机抽取n个同源四倍体个体,得到不同基因型个体数量;根据单体型频率计算相应的配子频率,并根据配子频率计算计算相应的基因型频率;计算基因型频率;计算单倍型基因频率;通过单倍型基因频率获取两个位点的等位基因的估算频率;通过单倍型基因频率计算每两个位点间的连锁不平衡系数;然后进行验证。
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公开(公告)号:CN104361262A
公开(公告)日:2015-02-18
申请号:CN201410532492.9
申请日:2014-10-10
Applicant: 北京林业大学
IPC: G06F19/18
Abstract: 本发明公开了一种基于基因调控网络的胡杨无性选育方法,所述方法包括:构建胡杨定位群体;根据胡杨定位群体进行外植体培养,并在培养的过程中获取胡杨生根能力的表型数据、转录组学数据、蛋白质组学数据以及代谢组学数据;分别根据胡杨定位群体的表型数据、转录组学数据、蛋白质组学数据和代谢组学数据定位胡杨生根能力的QTL、eQTL、pQTL以及mQTL;根据胡杨生根能力的QTL、eQTL、pQTL以及mQTL构建胡杨生根过程的基因调控网络,并根据基因调控网络定位胡杨生根能力网络数量性状位点nQTL;根据胡杨生根能力的nQTL进行胡杨无性选育。本发明实施例的方法,能够有效地筛选出生根能力强的胡杨单株,提高胡杨的繁殖率,极大地促进了胡杨抗逆无性系选育。
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公开(公告)号:CN103960128A
公开(公告)日:2014-08-06
申请号:CN201410138425.9
申请日:2014-04-08
Applicant: 北京林业大学
IPC: A01H4/00
Abstract: 本发明提供了培养胡杨离体组织的方法,该方法包括:将胡杨带芽茎段接种于启动培养基,进行启动培养,以便获得胡杨腋芽;将所述胡杨腋芽转接到继代培养基,进行继代培养,以便获得胡杨小苗;将所述胡杨小苗转接到生根培养基,进行生根培养,以便得到胡杨组培苗。利用本发明的方法,能够有效地对胡杨离体组织进行培养,诱导成功率和最终生根率非常高,从而能够在短时间内获得大量的胡杨组培苗,且该方法操作简单方便,适合大规模、快速繁殖胡杨。
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公开(公告)号:CN113345520B
公开(公告)日:2021-12-14
申请号:CN202110629578.3
申请日:2021-06-07
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明提供了一种基于Richards方程的树木数量性状的QTL定位框架的方法,属于生物信息学分析技术领域。所述方法利用Richards生长方程拟合树木数量性状的生长曲线,得到数量性状的Richards估计参数,根据性状表型随时间的相关关系获得SAD(1)模型的结构参数;根据生长参数在基因型之间的差异进行功能作图,筛选调控树木数量性状生长的显著QTL;计算显著QTL遗传效应值以及遗传力,建立QTL之间的调控结构网络,识别解释树木数量性状生长过程的关键调控QTL。本发明所述方法具有很强的生物学意义且定位精度高,建立的遗传效应调控网络为遗传结构分析提供了有效方法,使性状生长分析更加全面。
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公开(公告)号:CN109283278B
公开(公告)日:2021-10-01
申请号:CN201811456435.1
申请日:2018-11-30
Abstract: 本发明公开了一种微量油茶种仁中油脂含量和脂肪酸组成同时测定的方法。采用新型的溶剂体系提取了油茶种仁中的油脂成分,同时加入茶油中不含的脂肪酸为内标,采用气相色谱法建立脂肪酸甲酯‑脂肪酸甲酯/内标物的内标标准曲线,通过内标曲线进行计算,总脂肪酸的含量可以折算为油脂含量,单个脂肪酸的含量即为这种脂肪酸的含量,从而确定油茶种仁中的油脂含量和脂肪酸组成。本发明方法可以实现油脂含量和组成的同步测定,尤其对于微量种仁中的油脂的提取具有明显优势,非常适合微量油茶种仁中油脂的精确提取和脂肪酸的准确测定。
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公开(公告)号:CN113345520A
公开(公告)日:2021-09-03
申请号:CN202110629578.3
申请日:2021-06-07
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明提供了一种基于Richards方程的树木数量性状的QTL定位框架的方法,属于生物信息学分析技术领域。所述方法利用Richards生长方程拟合树木数量性状的生长曲线,得到数量性状的Richards估计参数,根据性状表型随时间的相关关系获得SAD(1)模型的结构参数;根据生长参数在基因型之间的差异进行功能作图,筛选调控树木数量性状生长的显著QTL;计算显著QTL遗传效应值以及遗传力,建立QTL之间的调控结构网络,识别解释树木数量性状生长过程的关键调控QTL。本发明所述方法具有很强的生物学意义且定位精度高,建立的遗传效应调控网络为遗传结构分析提供了有效方法,使性状生长分析更加全面。
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公开(公告)号:CN103745134B
公开(公告)日:2016-11-02
申请号:CN201410009514.3
申请日:2014-01-09
Applicant: 北京林业大学
IPC: G06F19/10
Abstract: 本发明公开一种异源六倍体遗传连锁分析方法,其推导是基于异源多倍体减数分裂过程中染色体的优先配对现象;优先配对包括三种类型;分别获取:六条染色体两两优先配对的1种情况,六条染色体中的两条染色体优先配对且其他四条染色体自由配对的6种情况,六条染色体全部随机配对的8种情况;生成基于异源六倍体优先配对因子的分子标记共分离基础模型,并建立共分离概率矩阵;根据概率矩阵中的每一个元素,构建过渡矩阵;统计实际数据中每一种配子的真实数量,并根据可能的配子情况统计出M矩阵;根据总概率矩阵、过渡矩阵、M矩阵计算异源六倍体减数分裂过程中优先配对因子的估算值;通过不断迭代重新计算重组率r;以此构建异源六倍体遗传连锁图。
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公开(公告)号:CN103745134A
公开(公告)日:2014-04-23
申请号:CN201410009514.3
申请日:2014-01-09
Applicant: 北京林业大学
IPC: G06F19/10
Abstract: 本发明公开一种异源六倍体遗传连锁分析方法,其推导是基于异源多倍体减数分裂过程中染色体的优先配对现象;优先配对包括三种类型;分别获取:六条染色体两两优先配对的1种情况,六条染色体中的两条染色体优先配对且其他四条染色体自由配对的6种情况,六条染色体全部随机配对的8种情况;生成基于异源六倍体优先配对因子的分子标记共分离基础模型,并建立共分离概率矩阵;根据概率矩阵中的每一个元素,构建过渡矩阵;统计实际数据中每一种配子的真实数量,并根据可能的配子情况统计出M矩阵;根据总概率矩阵、过渡矩阵、M矩阵计算异源六倍体减数分裂过程中优先配对因子的估算值;通过不断迭代重新计算重组率r;以此构建异源六倍体遗传连锁图。
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