公开(公告)号：CN103699815A

公开(公告)日：2014-04-02

申请号：CN201410013164.8

申请日：2014-01-10

Applicant: 北京林业大学

Inventor： 邬荣领 ,  冯思思

IPC: G06F19/12

Abstract: 本发明提供一种同源四倍体自然群体的连锁不平衡分析模型的构建方法，包括：对来自自然群体中一组同源四倍体植物，设置一个位点A和一个位点B；两个位点产生16单倍型，且分别都具有35种基因型,但在遗传上每个位点能够识别的四倍体基因型有只有15种，因此两个位点共产生225种基因型；从所述自然群体中随机抽取n个同源四倍体个体，得到不同基因型个体数量；根据单体型频率计算相应的配子频率，并根据配子频率计算计算相应的基因型频率；计算基因型频率；计算单倍型基因频率；通过单倍型基因频率获取两个位点的等位基因的估算频率；通过单倍型基因频率计算每两个位点间的连锁不平衡系数；然后进行验证。

公开(公告)号：CN103699815B

公开(公告)日：2017-06-13

申请号：CN201410013164.8

申请日：2014-01-10

Applicant: 北京林业大学

Inventor： 姜立波 ,  邬荣领 ,  冯思思

IPC: G06F19/12

Abstract: 本发明提供一种同源四倍体自然群体的连锁不平衡分析模型的构建方法，包括：对来自自然群体中一组同源四倍体植物，设置一个位点A和一个位点B；两个位点产生16单倍型，且分别都具有35种基因型,但在遗传上每个位点能够识别的四倍体基因型有只有15种，因此两个位点共产生225种基因型；从所述自然群体中随机抽取n个同源四倍体个体，得到不同基因型个体数量；根据单体型频率计算相应的配子频率，并根据配子频率计算计算相应的基因型频率；计算基因型频率；计算单倍型基因频率；通过单倍型基因频率获取两个位点的等位基因的估算频率；通过单倍型基因频率计算每两个位点间的连锁不平衡系数；然后进行验证。

公开(公告)号：CN102676682A

公开(公告)日：2012-09-19

申请号：CN201210175118.9

申请日：2012-05-31

Applicant: 北京林业大学

Inventor： 杜芳 ,  徐放 ,  冯思思

IPC: C12Q1/68 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种应用8重PCR进行胡杨群体遗传分析和亲子鉴定的方法。在本发明的方法中，使用一组引物进行多重PCR反应，同时对8个位点进行扩增，所述引物由序列为SEQ ID NO：1-SEQ ID NO：8的引物组成。本发明还涉及由序列为SEQ ID NO：1-SEQ ID NO：8的引物组成的引物组，包含所述引物组的试剂盒以及所述引物组的用途。本发明筛选出8对多态性高且两两不发生相互作用的引物，并且通过优化引物浓度和调整DNA模板量进行多重PCR反应。本发明的方法快速高效，适用于极微量DNA，易于自动化，在胡杨遗传学分析、亲子鉴定及品种保护等方面都有着广泛的应用前景。