一种检测淋巴细胞相关基因重排的克隆性的方法

    公开(公告)号:CN108004304B

    公开(公告)日:2021-04-23

    申请号:CN201711382598.5

    申请日:2017-12-20

    Abstract: 本发明公开了一种检测淋巴细胞相关基因重排的克隆性的方法,属于生物技术领域。本发明利用高通量二代测序法检测淋巴组织相关基因的重排克隆性,具体是先利用多功能引物和PCR试剂对待测样本进行扩增,得到多样品基因座增殖子文库;其中增殖子文库指两端连有不同接头的DNA片段,一侧为测序接头(可以含样本标签,以区分不同样本的测序结果),另外一侧为用于连接捕获颗粒的固定接头;然后对增殖子文库进行高通量测序,并根据标签序列将测序结果按照样本及目的基因位点进行分类整理,分析是否存在目的基因的克隆性重排。本发明具备检测通量高、灵敏度高、特异性高的特性,灵敏度可以达到0.01%,样本的DNA浓度可以低至0.1‑1ng/μl。

    基于Sanger测序的HLA分型方法及设备

    公开(公告)号:CN112669903A

    公开(公告)日:2021-04-16

    申请号:CN202011600233.7

    申请日:2020-12-29

    Abstract: 本申请涉及一种基于Sanger测序的HLA分型方法及设备,包括:获取待识别基因的测序数据;根据待识别基因的测序数据,基于预先训练的碱基识别模型,得到待识别基因各位点的正确碱基信号;判读所述待识别基因的核酸序列并与参考序列比对获得差异位点,基于预先整理的等位基因型与所述差异位点,采用位运算比较获得HLA分型结果。由于碱基识别模型以非正常碱基的测序数据作为样本数据进行训练,训练得到的碱基识别模型可以对Sanger测序数据中存在的低质量、杂合碱基和污染信号等非正常碱基进行识别,使用位运算快速获得等位基因型分型结果,解决了人工进行识别速度慢、准确性低的问题。

    一种检测TP53基因突变的多重PCR特异性引物和方法

    公开(公告)号:CN108179189A

    公开(公告)日:2018-06-19

    申请号:CN201810061976.8

    申请日:2018-01-23

    Inventor: 孙颖 刘明坤 叶锋

    Abstract: 本发明涉及一种检测TP53基因突变的多重PCR特异性引物和方法,具体涉及一种基于高通量测序技术检测血液病相关TP53基因突变的多重PCR特异性引物和检测方法,能够同时检测多个样本TP53基因突变。本发明利用高通量基因测序技术突破传统检测技术的限制,提高检测灵敏度;同时还能检测包括已知突变和未知突变位点的变异情况,得到全面准确的检测结果。通过对TP53基因突变位点进行测序,可得到具体的基因序列信息,进而将病人进行预后分型,根据不同分型做出不同的治疗方案,做到因人施药。

    一种从血浆中分离游离核酸的方法

    公开(公告)号:CN106011131A

    公开(公告)日:2016-10-12

    申请号:CN201610617001.X

    申请日:2016-07-29

    Inventor: 叶锋 刘明坤 余荣

    CPC classification number: C12N15/1006 C12Q2523/308 C12Q2527/125

    Abstract: 本申请公开了一种从血浆中分离游离核酸的方法,该方法使用二氧化硅基质膜离心柱分离纯化游离核酸。与现有技术相比,本申请所述的血浆中分离游离核酸的方法,达到了如下效果:1、本发明的使用二氧化硅基质膜吸附柱从血浆样品中分离游离核酸的方法,可以同时将血浆样本,裂解缓冲液,Proteinase K和Acryl Carrier混合后进行吸附柱过滤,不仅简单快速,同时进行小体积洗脱,浓缩核酸。2、使用本发明提取核酸,无需有机提取,完全去除污染物和抑制剂使用既可以保证核酸的纯度,大大简化了从血浆中浓缩和纯化游离DNA和RNA的过程。

    基于Sanger测序的HLA分型方法及设备

    公开(公告)号:CN112669903B

    公开(公告)日:2024-04-02

    申请号:CN202011600233.7

    申请日:2020-12-29

    Abstract: 本申请涉及一种基于Sanger测序的HLA分型方法及设备,包括:获取待识别基因的测序数据;根据待识别基因的测序数据,基于预先训练的碱基识别模型,得到待识别基因各位点的正确碱基信号;判读所述待识别基因的核酸序列并与参考序列比对获得差异位点,基于预先整理的等位基因型与所述差异位点,采用位运算比较获得HLA分型结果。由于碱基识别模型以非正常碱基的测序数据作为样本数据进行训练,训练得到的碱基识别模型可以对Sanger测序数据中存在的低质量、杂合碱基和污染信号等非正常碱基进行识别,使用位运算快速获得等位基因型分型结果,解决了人工进行识别速度慢、准确性低的问题。

    一种检测淋巴细胞相关基因重排的克隆性的方法

    公开(公告)号:CN108004304A

    公开(公告)日:2018-05-08

    申请号:CN201711382598.5

    申请日:2017-12-20

    Abstract: 本发明公开了一种检测淋巴细胞相关基因重排的克隆性的方法,属于生物技术领域。本发明利用高通量二代测序法检测淋巴组织相关基因的重排克隆性,具体是先利用多功能引物和PCR试剂对待测样本进行扩增,得到多样品基因座增殖子文库;其中增殖子文库指两端连有不同接头的DNA片段,一侧为测序接头(可以含样本标签,以区分不同样本的测序结果),另外一侧为用于连接捕获颗粒的固定接头;然后对增殖子文库进行高通量测序,并根据标签序列将测序结果按照样本及目的基因位点进行分类整理,分析是否存在目的基因的克隆性重排。本发明具备检测通量高、灵敏度高、特异性高的特性,灵敏度可以达到0.01%,样本的DNA浓度可以低至0.1-1ng/μl。

    一种体外诊断试剂质控品及其制备方法与应用

    公开(公告)号:CN108048545A

    公开(公告)日:2018-05-18

    申请号:CN201711214422.9

    申请日:2017-11-28

    Abstract: 本发明涉及一种体外诊断试剂质控品及其制备方法与应用。本发明包括如下步骤:步骤1,收集质控细胞;步骤2,将收集的质控细胞沉淀为松散状,聚集并塑形成规则的圆柱形细胞条;步骤3,将步骤2得到的圆柱形细胞条,制作成细胞蜡块;步骤4,将步骤3得到的细胞蜡块按合适厚度切片,形成蜡卷,并将蜡卷置于保存管中。在制备过程中,可以通过改变阳性质控细胞与阴性质控细胞的混合比例,调节其所含待测物的浓度。采用本发明所述方法制备的质控品能够较大程度的减小“基质效应”对检测结果的影响;能与临床待测标本平行进行前处理,对整个检测过程、试剂、设备、交叉污染等环节进行更好的质量控制;并且具有良好的稳定性和重复性。

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