公开(公告)号：CN105420375A

公开(公告)日：2016-03-23

申请号：CN201510983092.4

申请日：2015-12-24

Applicant: 北京大学

Inventor： 万成 ,  文平 ,  陆祖宏 ,  康玉麟

IPC: C12Q1/68 ,  G06F19/24

Abstract: 本发明公开了一种基于微量细胞全基因组测序的环境微生物基因组草图的构建方法，通过对多个环境微生物微小宏基因组样本分别进行核酸分离，扩增，构建高通测序文库，然后对测序数据进行过滤、从头组装、开放阅读框预测，使用基于隐马尔科夫模型的算法将序列分类，获得微生物基因组草图。该方法根据环境样本微生物群落的复杂度调整平行试验的次数，以获得最优的分析结果，可应用于土壤、空气、水体、人体等各种环境的微生物群落研究。

公开(公告)号：CN104312914A

公开(公告)日：2015-01-28

申请号：CN201410570031.0

申请日：2014-10-23

Applicant: 北京大学

Inventor： 陆祖宏 ,  李清宁 ,  赵清 ,  贾忠伟 ,  万成 ,  康玉麟 ,  丁韬力

IPC: C12M1/34

CPC classification number: B01J19/0046 ,  B01J2219/00277 ,  B01J2219/00608 ,  B01J2219/00853

Abstract: 本发明涉及的是一种基于纳米孔结构的蛋白质分子电子器件，是一种单酶生物传感器，可以用于检测溶液中浓度极低的底物分子,可用于单分子DNA的测序。该发明属于第三代DNA测序器件。一种基于纳米孔结构的蛋白质分子电子器件，其特征在于：1）具有纳米通道的固体结构将溶液分隔为两个部分，固体结构两边的溶液通过纳米通道进行联通；2）在上述纳米通道内固定蛋白质分子或蛋白质复合物分子；3）在上述由固体结构分隔的两个溶液中分别放置电极，通过检测电极间的电流，检测通过纳米通道中蛋白质分子的电阻；4）根据通过蛋白质分子电流值的变化，确定蛋白质构象的动力学特征，获得蛋白质催化反应底物的信息。

公开(公告)号：CN105883838B

公开(公告)日：2018-08-21

申请号：CN201610195641.6

申请日：2016-03-31

Applicant: 北京大学 ,  北京普若博升生物科技有限公司

Inventor： 陆祖宏 ,  李清宁 ,  魏颖颖 ,  丁韬力 ,  严勇 ,  万成 ,  孙利 ,  李成强 ,  孙杰 ,  王磊

IPC: C01B33/42 ,  C04B30/00 ,  G01N27/00 ,  C12M1/34

Abstract: 本发明公布了一种单层云母片及其纳米孔电子器件的制备方法和应用。首先制备超薄的云母单层，将其涂布在合适的支撑基底上，利用高能聚焦电子束或离子束在单层云母片上制备1～5nm纳米孔，得到基于单层云母片的固态纳米孔电子器件。使单链核酸或蛋白质分子在电场驱动下穿过该电子器件的纳米孔，通过实时检测过孔电流的变化，识别过孔单链核酸上的碱基或单链蛋白质上的氨基酸。本发明的电子器件可制备成高通量平行的分子器件，实现快速且超低成本的核酸/蛋白质测序。

公开(公告)号：CN106929565A

公开(公告)日：2017-07-07

申请号：CN201511022939.9

申请日：2015-12-30

Applicant: 北京大学 ,  北京普若博升生物科技有限公司

Inventor： 陆祖宏 ,  李清宁 ,  丁韬力 ,  严勇 ,  万成 ,  魏颖颖 ,  孙利 ,  李成强 ,  孙杰 ,  王磊

IPC: C12Q1/68

Abstract: 本发明公开了一种基于纳米结构的蛋白质单分子电子器件及其制备和应用。将单个蛋白质或其复合物分子固定于纳米孔处的对电极上，通过检测溶液中该蛋白质或其复合物分子的电导率来表征其构象涨落的动力学特征，从而实现对蛋白质的活性及其与底物分子的生化反应过程的检测。本发明可作为一种极具发展潜力的第三代测序方法，无需制备特殊的DNA测序文库，无需对核酸进行标记，可进行超长、连续、快速、精准的碱基阅读，若制备成高通量平行的分子器件，可实现超低成本的DNA测序等。