一种稻瘟病抗性基因Pia的SNP分子标记及其方法与应用

    公开(公告)号:CN103789306B

    公开(公告)日:2018-11-16

    申请号:CN201410033115.0

    申请日:2014-01-24

    Abstract: 本发明公开了一种稻瘟病抗性基因Pia的SNP分子标记,所述SNP位点位于水稻基因组11号染色体第6525745位核苷酸,该位点核苷酸由C突变为T,氨基酸由半胱氨酸(Cys)突变为酪氨酸(Tyr),由引物对SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2从水稻基因组DNA中扩增出来的核苷酸序列,经特异性酶切之后电泳检测,与稻瘟病抗性基因Pia呈特异性带型的分子标记。还公开了所述稻瘟病抗性基因Pia的SNP分子标记PiaSNP的检测方法及其应用,本发明的Pia功能特异性分子标记以PCR技术为基础,不仅能区分水稻品种的基因型,而且能够方便、快捷、直接地实现了目标基因Pia在水稻种质资源以及育种后代中的鉴定,特别是等位基因之间的鉴别,且不受环境以及人为因素的影响。

    一种用于水稻品种鉴定的SNP芯片、制备方法及用途

    公开(公告)号:CN104328507B

    公开(公告)日:2016-03-30

    申请号:CN201410535766.X

    申请日:2014-10-11

    Abstract: 本发明提供了一种用于水稻品种鉴定的SNP芯片,该芯片包含3072个分子标记,3072个SNP分子标记是SEQ ID NO.0001~SEQ ID NO.3072;本发明还提供一种上述SNP芯片的制备方法,包括步骤:从水稻栽培品种重测序数据获得SNP分子标记、对SNP分子标记进行筛选和采用筛选后的分子标记设计探针制作SNP芯片;本发明还提供上述SNP芯片在水稻品种真实性和身份鉴定中的应用。本发明提供的3072个SNP分子标记组合的应用将极大提高检测准确度、缩短检测时间、大幅提升我国水稻品种鉴定技术水平。

    一种稻瘟病抗性基因Pia的SNP分子标记及其方法与应用

    公开(公告)号:CN103789306A

    公开(公告)日:2014-05-14

    申请号:CN201410033115.0

    申请日:2014-01-24

    Abstract: 本发明公开了一种稻瘟病抗性基因Pia的SNP分子标记,所述SNP位点位于水稻基因组11号染色体第6525745位核苷酸,该位点核苷酸由C突变为T,氨基酸由半胱氨酸(Cys)突变为酪氨酸(Tyr),由引物对SEQ?ID?NO.1和SEQ?ID?NO.2从水稻基因组DNA中扩增出来的核苷酸序列,经特异性酶切之后电泳检测,与稻瘟病抗性基因Pia呈特异性带型的分子标记。还公开了所述稻瘟病抗性基因Pia的SNP分子标记PiaSNP的检测方法及其应用,本发明的Pia功能特异性分子标记以PCR技术为基础,不仅能区分水稻品种的基因型,而且能够方便、快捷、直接地实现了目标基因Pia在水稻种质资源以及育种后代中的鉴定,特别是等位基因之间的鉴别,且不受环境以及人为因素的影响。

    一种基于先验知识的作物种质资源评价方法及系统

    公开(公告)号:CN119068977A

    公开(公告)日:2024-12-03

    申请号:CN202411105836.8

    申请日:2024-08-13

    Abstract: 本申请公开了一种基于先验知识的作物种质资源评价方法及系统,涉及作物种质资源评价技术领域,该方法包括:采集待测种质资源的基因组数据并对其进行变异检测,得到待测种质资源的全基因组遗传变异信息;根据全基因组遗传变异信息和作物性状变异先验知识库,确定待测种质资源的各表型性状的变异评分,从而基于待测种质资源的各表型性状的变异评分,确定待测种质资源的综合变异评分。本申请方法能够根据待测种质资源的基因型数据快速评价其表型性状得分,并结合各个表型性状得分计算综合评分,应用于农作物种质资源评价领域,可极大程度地提高种质资源表型性状评价效率,节约评价成本,从而更好实现种质资源的高效发掘和利用。

    一种水稻白叶枯病抗性基因Xa1的分子标记、扩增引物及其应用

    公开(公告)号:CN111996284B

    公开(公告)日:2021-08-06

    申请号:CN202011016624.4

    申请日:2020-09-24

    Abstract: 本发明提供了一种水稻白叶枯病抗性基因Xa1的分子标记、扩增引物及其应用,属于分子生物学及作物育种技术领域。水稻白叶枯病抗性基因Xa1的分子标记的核苷酸序列如SEQ ID No:3所示。本发明还提供了用于扩增分子标记的引物。所述分子标记或所述引物在水稻育种、水稻种质资源鉴定、鉴定水稻白叶枯病抗性基因Xa1基因型中的应用。使用该分子标记引物对待测水稻进行PCR扩增,若PCR产物经电泳检测为472bp条带则判定为含有白叶枯病抗性基因Xa1。本发明采用上述鉴定方法具有操作简单、鉴定周期短、检测通量高和成本低的优点。

    一种高通量筛选化感水稻种质资源装置及方法

    公开(公告)号:CN105900822A

    公开(公告)日:2016-08-31

    申请号:CN201610329317.9

    申请日:2016-05-18

    CPC classification number: Y02P60/216 A01G31/02 A01C1/02 A01G7/00

    Abstract: 本发明提供了一种高通量筛选化感水稻种质资源装置及方法。该装置包括具有多个种植隔间的装置基础体,种植隔间敞口且其内能够容纳培养基;不同种植隔间被完全隔开;该装置还设有底部开口的水稻秧苗生长容器,该容器能够被放入种植隔间并置于种植隔间内的培养基上,该容器内能够设置培养基;种植隔间内在供容置水稻秧苗生长容器之外还有种植区,用于种植受体植物。利用本发明装置筛选化感水稻种质资源能够实现高通量筛选水稻化感品种,能够在实验室中进行,挖掘水稻化感种质资源,且能够有效防止部分水稻品种种子污染而影响整个筛选结果。

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