公开(公告)号：CN115948521B

公开(公告)日：2024-06-25

申请号：CN202211716471.3

申请日：2022-12-29

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 陈肃 ,  陈嵩 ,  于越 ,  王鑫宇 ,  周妍 ,  何蕊含 ,  刘文轩 ,  刘宣晨

IPC: C12Q1/6869 ,  G16B40/20

Abstract: 本发明公开了一种检测非整倍体缺失染色体信息的方法，包括以下步骤：提取待测生物体的DNA并进行全基因组测序，获得测序序列；将所述测序序列比对至参考基因组上，并获取待测生物体的每条染色体的频率散点图；将所述每条染色体的频率散点图进行拟合，并获取拟合曲线中所有高斯峰对应的测序深度；对所述测序深度进行聚类处理，进而获得待测生物体的染色体倍性。本发明以二代高通量测序技术为基础，在面对大批量的样品时，相较于传统检测方法可大大缩短时间，同时可实现自动化操作，具有标准性和可重复性等优势。

公开(公告)号：CN115948521A

公开(公告)日：2023-04-11

申请号：CN202211716471.3

申请日：2022-12-29

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 陈肃 ,  陈嵩 ,  于越 ,  王鑫宇 ,  周妍 ,  何蕊含 ,  刘文轩 ,  刘宣晨

IPC: C12Q1/6869 ,  G16B40/20

Abstract: 本发明公开了一种检测非整倍体缺失染色体信息的方法，包括以下步骤：提取待测生物体的DNA并进行全基因组测序，获得测序序列；将所述测序序列比对至参考基因组上，并获取待测生物体的每条染色体的频率散点图；将所述每条染色体的频率散点图进行拟合，并获取拟合曲线中所有高斯峰对应的测序深度；对所述测序深度进行聚类处理，进而获得待测生物体的染色体倍性。本发明以二代高通量测序技术为基础，在面对大批量的样品时，相较于传统检测方法可大大缩短时间，同时可实现自动化操作，具有标准性和可重复性等优势。

公开(公告)号：CN115058381A

公开(公告)日：2022-09-16

申请号：CN202210847072.4

申请日：2022-07-07

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 曲冠证 ,  刘彩霞 ,  由香玲 ,  陈肃 ,  樊二勤

IPC: C12N5/04 ,  A01H4/00 ,  C12R1/91

Abstract: 本发明公开一种小黑杨单倍体细胞系的获得方法，以单核靠边期的小黑杨花药为外植体，将消毒处理好的花药放入愈伤组织诱导培养基中诱导出愈伤组织。通过流式细胞仪分析筛选出单倍体愈伤组织，将单倍体愈伤组织转移到增殖培养基中进行增殖培养，生长成适合悬浮培养的状态，将适宜的愈伤组织转移到液体培养基中，成为稳定的悬浮细胞系。本发明以单倍体具有极高的变异率为出发点，结合植物悬浮细胞培养技术，首次在林木中获得生长稳定的悬浮细胞系同时建立植株再生体系，为进一步通过单倍体诱导获得杨树优良品细胞系和新品种提供了技术支持。

公开(公告)号：CN112941077B

公开(公告)日：2021-09-07

申请号：CN202110202177.X

申请日：2021-02-23

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 刘桂丰 ,  王伟 ,  邱志楠 ,  李爽 ,  姜静 ,  陈肃

IPC: C12N15/113 ,  C12N15/87 ,  A01H5/00 ,  A01H6/00

Abstract: 本发明公开了一种靶向敲除GLK基因的CRISPR/Cas9系统及其应用，属于分子生物学技术领域。本发明通过设计、构建、筛选，最终提供一些基于CRISPR/Cas9系统，同时能靶向白桦GLK基因的高效gRNA及靶位点序列，具体以白桦GLK基因为编辑靶基因，将体外纯化的Cas9蛋白与GLK‑gRNA混合后的核糖核蛋白复合体RNP，通过微粒轰击白桦愈伤组织，初步建立无T‑DNA插入基因编辑技术，利用该基因编辑技术获取了白桦黄叶植株，这为丰富白桦品种以及快速创制白桦植物突变体提供了崭新思路。

公开(公告)号：CN110734914B

公开(公告)日：2020-10-27

申请号：CN201911031884.6

申请日：2019-10-28

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 杨蕴力 ,  刘桂丰 ,  姜静 ,  冮慧欣 ,  陈肃 ,  顾宸瑞 ,  李慧玉 ,  黄海娇 ,  董京祥

IPC: C12N15/29 ,  C07K14/415 ,  C12N15/82 ,  A01H5/12 ,  A01H6/00

Abstract: 本发明公开了一种金色裂叶桦的BpGLK基因，所述BpGLK基因的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示；该基因表达的蛋白氨基酸序列如SEQ ID NO：2所示。还公开了一种金色裂叶桦pGLKRNAi干扰表达载体，包含所述的BpGLK基因。还公开了一种金色裂叶桦的创制方法，包括以下步骤：根据所述的BpGLK基因的保守序列，构建pGLKRNAi干扰表达载体，采用农杆菌介导法导入裂叶桦，使得转基因裂叶桦中的BpGLK基因低量表达，叶片呈现黄色。该创制方法通过基因工程育种手段干扰BpGLK基因的表达，进而降低BpGLK在转基因裂叶桦中的表达水平，获取黄色叶片的裂叶桦，是创制裂叶桦新品种的有效方法。

公开(公告)号：CN110734914A

公开(公告)日：2020-01-31

申请号：CN201911031884.6

申请日：2019-10-28

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 杨蕴力 ,  刘桂丰 ,  姜静 ,  冮慧欣 ,  陈肃 ,  顾宸瑞 ,  李慧玉 ,  黄海娇 ,  董京祥

IPC: C12N15/29 ,  C07K14/415 ,  C12N15/82 ,  A01H5/12

Abstract: 本发明公开了一种金色裂叶桦的BpGLK基因，所述BpGLK基因的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示；该基因表达的蛋白氨基酸序列如SEQ ID NO：2所示。还公开了一种金色裂叶桦pGLKRNAi干扰表达载体，包含所述的BpGLK基因。还公开了一种金色裂叶桦的创制方法，包括以下步骤：根据所述的BpGLK基因的保守序列，构建pGLKRNAi干扰表达载体，采用农杆菌介导法导入裂叶桦，使得转基因裂叶桦中的BpGLK基因低量表达，叶片呈现黄色。该创制方法通过基因工程育种手段干扰BpGLK基因的表达，进而降低BpGLK在转基因裂叶桦中的表达水平，获取黄色叶片的裂叶桦，是创制裂叶桦新品种的有效方法。