一种基于人工蜂群与粒子群混合算法的蛋白质耐热温度的多元线性回归计算方法

    公开(公告)号:CN105740648B

    公开(公告)日:2018-07-06

    申请号:CN201610042186.6

    申请日:2016-01-21

    Applicant: 江南大学

    Inventor: 高晓梅 丁彦蕊

    Abstract: 本发明公开了一种基于人工蜂群与粒子群混合算法的蛋白质耐热温度的多元线性回归计算方法,属于计算机应用技术领域。本发明方法是将人工蜂群算法和粒子群算法结合,利用人工蜂群算法的局部搜索能力优化粒子群算法的粒子速度和位置,以防止粒子群算法陷入局部最优,从而获得全局最优解;粒子群算法基于最优的粒子速度和位置,优化蛋白质耐热温度与氨基酸含量+氨基酸网络拓扑属性之间的多元线性回归模型的参数,从而确定蛋白质的耐热温度。本发明方法利用人工蜂群算法和粒子群算法的高效性、快速性、通用性和鲁棒性,确定了蛋白质耐热温度与氨基酸含量+氨基酸网络拓扑属性的线性回归模型,这为直接用蛋白质序列和结构来预测蛋白质的耐热温度提供了有效的手段。

    一种引入序列信息的残基相互作用网络比对算法SI-MAGNA

    公开(公告)号:CN107679616A

    公开(公告)日:2018-02-09

    申请号:CN201710981020.5

    申请日:2017-10-20

    Applicant: 江南大学

    Inventor: 丁彦蕊 陶斯涵

    CPC classification number: G06N3/002 G06N3/006

    Abstract: 本发明公开了一种引入序列信息的残基相互作用网络比对算法SI-MAGNA,属于计算机应用技术领域。本发明方法是基于完全依靠网络拓扑信息的MAGNA比对算法框架,在其优化函数中引入了蛋白质的序列信息相似性得分并提出SI-MAGNA算法。它计算种群成员适应度值,将两个父代比对通过交叉函数择优产生一个适应度值更高的子代比对,迭代循环,当满足终止条件时,退出循环,输出比对结果。本发明方法利用算法SI-MAGNA的在残基相互作用网络比对上的准确性,可以发现蛋白质结构上的保守区域,从而找到实现相似功能的相似结构和产生差异的独有结构,为从系统角度研究蛋白质空间结构和蛋白质性质、功能的关系提供了有效的手段。

    苝醌化合物在制备防治反刍动物病毒的饲料中的应用

    公开(公告)号:CN102106465B

    公开(公告)日:2015-04-22

    申请号:CN201110022743.5

    申请日:2011-01-20

    Applicant: 江南大学

    Abstract: 苝醌化合物在制备防治反刍动物病毒的饲料中的应用,属于生物工程及农业技术领域。本发明采用苝醌化合物添加到反刍动物饲料中制备用于防治反刍动物病毒的饲料,如口蹄疫病毒、致细胞病变型牛腹泻-粘膜病病毒、蓝舌病病毒、羊痘病毒、马麻疹病毒等。苝醌化合物包括:竹红菌素、痂囊腔菌素、弗来菌素、枝孢素、卡弗他丁、尾孢素等,苝醌化合物具有提取方便、稳定性好、口服无明显副作用和代谢快等一系列优点。制备预防反刍动物病毒饲料,其中的剂量为每天1-10 μmol苝醌化合物/kg体重,制备治疗反刍动物病毒饲料,其中的剂量为10 -100 μmol苝醌化合物/kg体重,防治病毒的效果非常显著,同时苝醌化合物可通过现代生物技术生产得到,可产生良好的经济和社会效益。

    苝醌化合物在制备防治禽类病毒饲料中的应用

    公开(公告)号:CN102138640B

    公开(公告)日:2012-12-05

    申请号:CN201110007627.6

    申请日:2011-01-14

    Applicant: 江南大学

    Abstract: 苝醌化合物在制备防治禽类病毒饲料中的应用,属于生物工程及农业技术领域。本发明涉及采用苝醌化合物添加到禽类饲料中制备用于防治禽类病毒饲料,如马立克氏病病毒、禽J亚群白血病病毒、鸡传染性贫血病病毒、禽呼肠孤病毒、新城疫病毒、传染性法氏囊病病毒、鹅细小病毒,鸭瘟病毒和禽流感病毒等。苝醌化合物包括:竹红菌素、痂囊腔菌素、弗来菌素、枝孢素、卡弗他丁、尾孢素等,苝醌化合物具有提取方便、稳定性好、口服无明显副作用和代谢快等一系列优点。制备预防禽类病毒饲料中的剂量为每天1-50μmol苝醌化合物/kg体重,制备治疗禽类病毒饲料中的剂量为50μmol-200μmol苝醌化合物/kg体重,防治禽类病毒的效果非常显著,同时苝醌化合物可通过现代生物技术生产得到,可产生良好的经济和社会效益。

    一种缬氨酸分离专用大孔吸附树脂的制备方法

    公开(公告)号:CN101721979B

    公开(公告)日:2012-05-23

    申请号:CN200910231735.4

    申请日:2009-12-01

    Applicant: 江南大学

    Abstract: 一种缬氨酸分离专用大孔吸附树脂的制备方法,属于化工和生物制品加工技术领域。本发明在树脂合成过程中控制水相质、交联剂、极性单体、致孔剂的种类和比例,使之能够有效键合上二碳酸二叔丁酯,最终使合成得到的大孔吸附树脂可将缬氨酸、丙氨酸、亮氨酸分离。同时该大孔吸附树脂采用纯水作为流动相,可有效地减小分离过程对于环境的污染。通过本发明方法合成的树脂,可有效地用于缬氨酸发酵液的分离,去除缬氨酸发酵液中的性质相近杂质丙氨酸与亮氨酸,克服了当前缬氨酸分离纯化过程中存在的纯度低、效率低和污染大等缺点,使产品纯度达到99%以上,达到药用标准,并具有较高的回收率和生产强度。

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