一种适用于木聚糖酶氨基酸相互作用网络聚类的S‑FCM算法

    公开(公告)号:CN106960134A

    公开(公告)日:2017-07-18

    申请号:CN201710177641.8

    申请日:2017-03-23

    Applicant: 江南大学

    Inventor: 丁彦蕊 饶榕

    Abstract: 本发明公开了一种适用于木聚糖酶氨基酸相互作用网络聚类的S‑FCM算法,属于计算机应用技术领域。本发明方法针对FCM算法的参数依赖性强和对初始聚类中心敏感的缺陷作出改进。S‑FCM算法首先引入了基于密度的数据预处理方法,使其可以根据输入的木聚糖酶氨基酸相互作用网络自身的密度特性来获取初始聚类中心以及分类数目,保证聚类结果的可靠性。其次,考虑氨基酸的序列特征对聚类结果的影响,在距离特征的基础上加入了氨基酸的序列特征,这提高了聚类的精确度。本发明方法在FCM算法的基础上,针对该算法的一些缺陷做出改进,并对木聚糖酶氨基酸相互作用网络进行聚类,为从社团的角度研究蛋白质的稳定性提供了一个新的途径。

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