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公开(公告)号：CN112175954A
公开(公告)日：2021-01-05
申请号：CN202011118638.7
申请日：2020-10-19
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12N15/113 , C12P19/34
Abstract: 本发明提供了一种能够快速水解DNA的脱氧核酶。本发明通过引入特殊末端结构，设计了成环效率较高的DNA文库，进行筛选感应锌离子切割的实验，体外筛选到了另外的IV类脱氧核酶。设计相应的退化库，进行退化再筛选，从而获得快速水解切割DNA的IV脱氧核酶的突变体，从而满足不同DNA水解反应的需求。
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公开(公告)号：CN110699407B
公开(公告)日：2023-08-01
申请号：CN201910989379.6
申请日：2019-10-17
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
Abstract: 本发明公开了一种借助I类和II类水解性脱氧核酶高效制备长单链DNA的方法。该方法主要包括设计并构建重组噬菌粒，获得噬菌粒环状单链DNA步骤，同时采用I类脱氧核酶和II类脱氧核酶突变体切割环状单链DNA，纯化回收酶切得到的所述长单链DNA。利用这两类能快速水解DNA的脱氧核酶，可代替限制性内切酶，低成本的实现对辅助噬菌体法制备出的DNA序列的特异性切割，大量、经济、高纯度制备任意长度和序列的单链DNA。
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公开(公告)号：CN110643606B
公开(公告)日：2023-06-13
申请号：CN201910989374.3
申请日：2019-10-17
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12N15/113 , C12P19/34
Abstract: 本发明公开了多个感应锌离子并能快速水解DNA的II类脱氧核酶突变体，II‑R1a，II‑R1b，II‑R1c，II‑R1d，所述突变体是基于II类脱氧核酶II‑R1的序列，设计“退化”的DNA文库，利用指数富集的配体系统进化技术，体外筛选分离获得的切割位点处碱基分别为G、A、T、C时，水解DNA活性强的II类脱氧核酶突变体。本发明的II类脱氧核酶突变体II‑R1a在50℃下切割反应速率最快，反应1小时切割效率可达80％。
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公开(公告)号：CN112111544A
公开(公告)日：2020-12-22
申请号：CN202011011345.9
申请日：2020-09-23
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12P19/34
Abstract: 本发明提供了一种提高单链DNA连接效率的方法，在单链DNA的5’‑磷酸基末端和单链DNA的3’羟基末端设计二级结构，该二级结构通过末端核苷酸序列的互补配对的方式，将需要连接的单链DNA的5'‑PO4与3'‑OH之间的距离拉近，从而提高长片段DNA的成环效率及两个片段的连接效率。
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公开(公告)号：CN113092209B
公开(公告)日：2023-10-27
申请号：CN202110361337.5
申请日：2021-04-02
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: G01N1/28 , G01N1/40 , G01N33/574 , G01N33/68
Abstract: 本发明公开了一种利用脱氧核酶探针对待测病样中分子标志物的鉴定方法，该方法利用脱氧核酶探针与分子标志物之间的相互作用，结合蛋白纯化技术和磁分离技术，对某一组分中的分子标志物进行特异性地捕获、富集，再通过互补的置换链将目标蛋白洗脱，做后续的身份鉴定。针对三阴性乳腺癌(TNBC)以及其他任何未明确标志物的疾病模型，研究人员都可运用本发明所述方法简单、快速地鉴定出标志物。因此，针对未知靶标分子的研究对象，本发明提供了一种基于“探针富集，探针检测”的简单、快速明确标志物的新方法。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN116103281A
公开(公告)日：2023-05-12
申请号：CN202310091652.X
申请日：2023-02-01
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12N15/10 , C12N15/115
Abstract: 本发明公开了一种筛选紧密结合过渡态金属离子的方法。还公开了通过所述方法筛选获得的两类结合锌离子的DNA，和一类结合镉离子的DNA。将序列优化截短，得到了结合锌离子的Zn(II)‑MZ1a和Zn(II)‑MZ2a，以及结合镉离子的Cd(II)‑TX1a。Zn(II)‑MZ1a在37℃下1小时内，可以结合大量锌离子，并在变性丙烯酰胺凝胶(dPAGE)上显示63％的条带迁移。Zn(II)‑MZ2a在37℃下1小时内，可以结合大量锌离子，并在dPAGE显示53％的条带迁移。Cd(II)‑TX1a在37℃下1小时内，可以结合大量镉离子，并在dPAGE胶上显示56％的条带迁移。
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公开(公告)号：CN112111544B
公开(公告)日：2022-04-01
申请号：CN202011011345.9
申请日：2020-09-23
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12P19/34
Abstract: 本发明提供了一种提高单链DNA连接效率的方法，在单链DNA的5’‑磷酸基末端和单链DNA的3’羟基末端设计二级结构，该二级结构通过末端核苷酸序列的互补配对的方式，将需要连接的单链DNA的5'‑PO4与3'‑OH之间的距离拉近，从而提高长片段DNA的成环效率及两个片段的连接效率。
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公开(公告)号：CN113092209A
公开(公告)日：2021-07-09
申请号：CN202110361337.5
申请日：2021-04-02
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: G01N1/28 , G01N1/40 , G01N33/574 , G01N33/68
Abstract: 本发明公开了一种利用脱氧核酶探针对待测病样中分子标志物的鉴定方法，该方法利用脱氧核酶探针与分子标志物之间的相互作用，结合蛋白纯化技术和磁分离技术，对某一组分中的分子标志物进行特异性地捕获、富集，再通过互补的置换链将目标蛋白洗脱，做后续的身份鉴定。针对三阴性乳腺癌(TNBC)以及其他任何未明确标志物的疾病模型，研究人员都可运用本发明所述方法简单、快速地鉴定出标志物。因此，针对未知靶标分子的研究对象，本发明提供了一种基于“探针富集，探针检测”的简单、快速明确标志物的新方法。
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公开(公告)号：CN112301020A
公开(公告)日：2021-02-02
申请号：CN202011120065.1
申请日：2020-10-19
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
Abstract: 本发明提供了一种能够快速水解DNA的脱氧核酶。本发明通过引入特殊末端结构，设计了成环效率较高的DNA文库，进行筛选感应锌离子切割的实验，体外筛选到了另外一类III类脱氧核酶。设计相应的退化库，进行退化再筛选，从而获得快速水解切割DNA的III类脱氧核酶的突变体，从而满足不同DNA水解反应的需求，获得了能够感应锌离子并能快速水解DNA磷酸二酯键的III类脱氧核酶。
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公开(公告)号：CN110699407A
公开(公告)日：2020-01-17
申请号：CN201910989379.6
申请日：2019-10-17
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
Abstract: 本发明公开了一种借助I类和II类水解性脱氧核酶高效制备长单链DNA的方法。该方法主要包括设计并构建重组噬菌粒，获得噬菌粒环状单链DNA步骤，同时采用I类脱氧核酶和II类脱氧核酶突变体切割环状单链DNA，纯化回收酶切得到的所述长单链DNA。利用这两类能快速水解DNA的脱氧核酶，可代替限制性内切酶，低成本的实现对辅助噬菌体法制备出的DNA序列的特异性切割，大量、经济、高纯度制备任意长度和序列的单链DNA。
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