公开(公告)号：CN116219026A

公开(公告)日：2023-06-06

申请号：CN202211612794.8

申请日：2022-12-15

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 白旭峰 ,  朱玺 ,  熊礼静 ,  任鑫 ,  邢永忠

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于水产动物养殖分子标记筛选与应用领域。具体涉及一种提高克氏原螯虾抗高温能力的SNP标记引物组合及其应用。发明特征为：提取克氏原螯虾血淋巴RNA，反转录为cDNA，根据已知克氏原螯虾抗高温基因HSP70和HSP90基因组序列设计标记引物，以cDNA为模板进行PCR扩增，PCR产物琼脂糖凝胶电泳检测后送测，比对序列信息，确认HSP70基因和HSP90基因的SNP位点及基因型，通过比较不同基因型的抗高温能力(以35℃的死亡时间为标准)，筛选得到抗高温能力最强的基因型及其组合，如HSP70‑1(GCG)、HSP90‑1(CGCG)、HSP70‑1+HSP90‑1(GCG+CGCG)。上述引物组合和基因型及其组合可应用于克氏原螯虾的抗高温育种上。

公开(公告)号：CN113897442A

公开(公告)日：2022-01-07

申请号：CN202111298317.4

申请日：2021-11-04

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 白旭峰 ,  任鑫 ,  李庆 ,  彭国辉 ,  彭波

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于动物分子标记筛选领域，具体涉及克氏原螯虾中一个抗病基因及其抗病优异单倍型标记的应用。从克氏原螯虾Cluster‑48199(R))基因组中获得一个基因片段，该基因片段全长为559bp；该基因片段即是本发明克隆的分子标记，其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO：1所示，在该基因片段的第335位(C/T)，450位(C/T)和469位(G/A)存在一个等位基因的突变位点。本发明还涉及扩增Cluster‑48199(R)基因的引物组合，和用于检测该分子标记应用的引物组合。本发明利用转录组技术挖掘出克氏原螯虾新的抗病基因，并筛选出其抗病SNP单倍型标记。

公开(公告)号：CN112458079A

公开(公告)日：2021-03-09

申请号：CN202011365689.X

申请日：2020-11-28

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 白旭峰 ,  任鑫

IPC: C12N15/10 ,  C12Q1/6806

Abstract: 本发明属于水生动物RNA样品制备技术领域，具体涉及一种提取克氏原螯虾血淋巴总RNA的方法。本发明包括：克氏原螯虾血淋巴提取及血细胞的分离以及血淋巴样品总RNA提取两个主要步骤。本发明只需要少量血淋巴即可完成总RNA的提取，保证了克氏原螯虾个体在抽血后可以继续存活，有助于连续观察研究克氏原螯虾体内基因变化情况。本发明提取的总RNA质量完好，降解极少，可用于高通量测序，本发明成本低廉，操作简便，在提取血淋巴总RNA的同时能保证克氏原螯虾的活性，提取效果稳定。

公开(公告)号：CN113502337A

公开(公告)日：2021-10-15

申请号：CN202110792139.4

申请日：2021-07-13

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 白旭峰 ,  任鑫 ,  彭国辉 ,  谭云飞 ,  彭波

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于水产养殖分子标记筛选技术领域。具体涉及一种提高克氏原螯虾抗病能力的SNP分子标记及应用。发明的特征为：分别提取随机收集的克氏原螯虾RNA，通过反转录获得其cDNA。根据克氏原螯虾抗病基因Crustin基因和ALF基因序列设计引物组合，利用引物组合对克氏原螯虾cDNA样本进行PCR扩增并得到目的片段，利用琼脂糖胶电泳检测并确认目的片段被扩增出。进一步通过一代测序手段获得其cDNA序列并进行序列比对，鉴定克氏原螯虾群体中Crustin和AFL基因编码区中的SNP位点，对两基因及其组合进行分型；比较各基因型之间抗病能力的差异，筛选得到抗病能力最强的基因型及其组合标记引物。可用于辅助选择。

公开(公告)号：CN118326052A

公开(公告)日：2024-07-12

申请号：CN202410459748.1

申请日：2024-04-17

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 白旭峰 ,  刘雪伟 ,  刘甜甜 ,  任鑫 ,  朱鑫涛 ,  谭云飞

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于水产动物分子标记领域。具体涉及一种鉴定克氏原螯虾Toll3、Toll4基因SNP位点优势抗病单倍型的KASP标记及其应用。Toll3‑Hap1和Toll4‑Hap1为抗病优势单倍型，对应SNP位点分别位于NC_059655.1染色体上第5956622、5957405、5958851、5863494、5862294位碱基，对细菌、双基因单倍型组合Toll3‑Hap1+Toll4‑Hap1为一定的抗病优势。本发明KASP标记可满足克氏原螯虾抗病分子辅助选择。

公开(公告)号：CN113897442B

公开(公告)日：2023-02-14

申请号：CN202111298317.4

申请日：2021-11-04

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 白旭峰 ,  任鑫 ,  李庆 ,  彭国辉 ,  彭波

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于动物分子标记筛选领域，具体涉及克氏原螯虾中一个抗病基因及其抗病优异单倍型标记的应用。从克氏原螯虾Cluster‑48199(R))基因组中获得一个基因片段，该基因片段全长为559bp；该基因片段即是本发明克隆的分子标记，其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO：1所示，在该基因片段的第335位(C/T)，450位(C/T)和469位(G/A)存在一个等位基因的突变位点。本发明还涉及扩增Cluster‑48199(R)基因的引物组合，和用于检测该分子标记应用的引物组合。本发明利用转录组技术挖掘出克氏原螯虾新的抗病基因，并筛选出其抗病SNP单倍型标记。

公开(公告)号：CN113502337B

公开(公告)日：2022-03-22

申请号：CN202110792139.4

申请日：2021-07-13

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 白旭峰 ,  任鑫 ,  彭国辉 ,  谭云飞 ,  彭波

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于水产养殖分子标记筛选技术领域。具体涉及一种提高克氏原螯虾抗病能力的SNP分子标记及应用。发明的特征为：分别提取随机收集的克氏原螯虾RNA，通过反转录获得其cDNA。根据克氏原螯虾抗病基因Crustin基因和ALF基因序列设计引物组合，利用引物组合对克氏原螯虾cDNA样本进行PCR扩增并得到目的片段，利用琼脂糖胶电泳检测并确认目的片段被扩增出。进一步通过一代测序手段获得其cDNA序列并进行序列比对，鉴定克氏原螯虾群体中Crustin和AFL基因编码区中的SNP位点，对两基因及其组合进行分型；比较各基因型之间抗病能力的差异，筛选得到抗病能力最强的基因型及其组合标记引物。可用于辅助选择。