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公开(公告)号：CN104361263B
公开(公告)日：2018-03-27
申请号：CN201410532915.7
申请日：2014-10-10
Applicant: 北京林业大学
IPC: G06F19/18
Abstract: 本发明公开了一种基于基因与蛋白调控网络的林木精准育种方法和系统，其中，所述方法包括：根据表型的形成过程定位表达数量性状位点eQTL、蛋白质数量性状位点pQTL和代谢数量性状位点mQTL，并构建基因与蛋白调控网络系统的系统模型；根据所述eQTL、所述pQTL、所述mQTL和所述系统模型定位影响所述基因与蛋白调控网络系统的网络数量性状位点nQTL；根据所述eQTL、所述pQTL、所述mQTL和所述nQTL生成林木育种应用程序；根据所述林木育种应用程序进行林木育种。本发明实施的基于基因与蛋白调控网络的林木精准育种方法，大大的缩短了育种周期。此外，根据育种目标有意识地整合目标基因，育种方向更加精准，实现了定向高效育种。
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公开(公告)号：CN108765547A
公开(公告)日：2018-11-06
申请号：CN201810367724.8
申请日：2018-04-23
Applicant: 北京林业大学
CPC classification number: G06T17/00 , G06T7/13 , G06T2207/30188
Abstract: 本发明公开了一种叶片形态空间校正的方法，本发明还公开了该方法在校正叶片形态空间中的应用。采用本发明所述的方法可以对植物的叶片进行空间重建，通过三维重建技术对叶片开展空间校准，可以校正叶片形态空间，或者使不同发育时间点的同一张叶片在形态上进行标准化的比较，以研究其生长规律。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN104361262B
公开(公告)日：2017-08-25
申请号：CN201410532492.9
申请日：2014-10-10
Applicant: 北京林业大学
IPC: G06F19/18
Abstract: 本发明公开了一种基于基因调控网络的胡杨无性选育方法，所述方法包括：构建胡杨定位群体；根据胡杨定位群体进行外植体培养，并在培养的过程中获取胡杨生根能力的表型数据、转录组学数据、蛋白质组学数据以及代谢组学数据；分别根据胡杨定位群体的表型数据、转录组学数据、蛋白质组学数据和代谢组学数据定位胡杨生根能力的QTL、eQTL、pQTL以及mQTL；根据胡杨生根能力的QTL、eQTL、pQTL以及mQTL构建胡杨生根过程的基因调控网络，并根据基因调控网络定位胡杨生根能力网络数量性状位点nQTL；根据胡杨生根能力的nQTL进行胡杨无性选育。本发明实施例的方法，能够有效地筛选出生根能力强的胡杨单株，提高胡杨的繁殖率，极大地促进了胡杨抗逆无性系选育。
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公开(公告)号：CN103699815B
公开(公告)日：2017-06-13
申请号：CN201410013164.8
申请日：2014-01-10
Applicant: 北京林业大学
IPC: G06F19/12
Abstract: 本发明提供一种同源四倍体自然群体的连锁不平衡分析模型的构建方法，包括：对来自自然群体中一组同源四倍体植物，设置一个位点A和一个位点B；两个位点产生16单倍型，且分别都具有35种基因型,但在遗传上每个位点能够识别的四倍体基因型有只有15种，因此两个位点共产生225种基因型；从所述自然群体中随机抽取n个同源四倍体个体，得到不同基因型个体数量；根据单体型频率计算相应的配子频率，并根据配子频率计算计算相应的基因型频率；计算基因型频率；计算单倍型基因频率；通过单倍型基因频率获取两个位点的等位基因的估算频率；通过单倍型基因频率计算每两个位点间的连锁不平衡系数；然后进行验证。
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公开(公告)号：CN113345520B
公开(公告)日：2021-12-14
申请号：CN202110629578.3
申请日：2021-06-07
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明提供了一种基于Richards方程的树木数量性状的QTL定位框架的方法，属于生物信息学分析技术领域。所述方法利用Richards生长方程拟合树木数量性状的生长曲线，得到数量性状的Richards估计参数，根据性状表型随时间的相关关系获得SAD(1)模型的结构参数；根据生长参数在基因型之间的差异进行功能作图，筛选调控树木数量性状生长的显著QTL；计算显著QTL遗传效应值以及遗传力，建立QTL之间的调控结构网络，识别解释树木数量性状生长过程的关键调控QTL。本发明所述方法具有很强的生物学意义且定位精度高，建立的遗传效应调控网络为遗传结构分析提供了有效方法，使性状生长分析更加全面。
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公开(公告)号：CN113345520A
公开(公告)日：2021-09-03
申请号：CN202110629578.3
申请日：2021-06-07
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明提供了一种基于Richards方程的树木数量性状的QTL定位框架的方法，属于生物信息学分析技术领域。所述方法利用Richards生长方程拟合树木数量性状的生长曲线，得到数量性状的Richards估计参数，根据性状表型随时间的相关关系获得SAD(1)模型的结构参数；根据生长参数在基因型之间的差异进行功能作图，筛选调控树木数量性状生长的显著QTL；计算显著QTL遗传效应值以及遗传力，建立QTL之间的调控结构网络，识别解释树木数量性状生长过程的关键调控QTL。本发明所述方法具有很强的生物学意义且定位精度高，建立的遗传效应调控网络为遗传结构分析提供了有效方法，使性状生长分析更加全面。
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