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公开(公告)号：CN116994671A
公开(公告)日：2023-11-03
申请号：CN202311242750.5
申请日：2023-09-25
Applicant: 之江实验室
Abstract: 本说明书公开了一种基于点云数据快速筛选小分子药物的方法及装置。方法包括：获取靶蛋白对应的受体结构模型，并基于受体结构模型中各原子之间的空间几何关系，确定受体结构模型对应的第一点云数据；根据第一点云数据对受体结构模型进行裁剪，得到目标受体结构模型；针对每个药物分子，确定靶蛋白与该药物分子的复合物结构模型；确定复合物结构模型对应的第二点云数据，并根据第二点云数据中的每个原子点对应的位置信息、每个原子点对应原子的类型信息以及每个原子点对应原子的结构信息中的至少一种，构建预测模型的输入数据；将输入数据输入预先训练的预测模型中，确定结合亲和力；根据每个药物分子与靶蛋白之间的结合亲和力进行药物筛选。
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公开(公告)号：CN115312119A
公开(公告)日：2022-11-08
申请号：CN202211226272.4
申请日：2022-10-09
Applicant: 之江实验室
Abstract: 本发明公开了一种基于蛋白质三维结构图像鉴定蛋白质结构域的方法及系统，本发明基于结构相似性鉴定蛋白质结构域，能够有效解决当序列一致性不高时，蛋白质多序列比对错误导致的蛋白质结构域识别错漏；本发明构建基于动态图卷积神经网络的点云分割模型，可通过整合全局结构特征与局部结构特征，同时完成蛋白质结构域的分割和蛋白质结构域语义标签的获取。
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公开(公告)号：CN113053468A
公开(公告)日：2021-06-29
申请号：CN202110599266.2
申请日：2021-05-31
Applicant: 之江实验室
IPC: G16C20/50
Abstract: 本发明公开了一种融合患者画像信息的药物新适应症发现方法及系统，本发明在数据驱动的药物重定位方案中引入真实世界患者用药和患者诊断数据，将药物在更广泛的人群中的实际使用效果加入到新的药物‑疾病关系预测模型中；本发明通过构建患者画像作为患者信息的特征表达，并以此构建患者‑患者网络，作为药物和疾病网络中间的媒介，构建符合实际临床过程的异构网络体系；本发明预测结果更加贴近临床，在后续老药新用验证和新的临床试验中成功的可能性更大。
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公开(公告)号：CN115424741A
公开(公告)日：2022-12-02
申请号：CN202211361950.8
申请日：2022-11-02
Applicant: 之江实验室
Abstract: 本发明公开了一种基于因果发现的药物不良反应信号发现方法及系统。本发明利用电子病历数据发现药物不良反应信号的过程中引入因果关系，最大化的保留真实世界电子病历数据中的数据维度，构建包含因果效应的贝叶斯网络结构，以及同时对用药干预和不良事件发生产生作用的混杂因素集。混杂因素集构建方法从数据出发，无需人工接入和先验知识，最大程度保留真实世界中存在的混杂因素，基于这些混杂因素构建用药干预组与对照组，模拟随机对照实验，使得组间不良反应发生情况的对比具有因果意义，进而生成具有因果关系的药物不良反应信号，在临床指导中具有重要价值。
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公开(公告)号：CN114783524B
公开(公告)日：2022-09-30
申请号：CN202210685472.X
申请日：2022-06-17
Applicant: 之江实验室
Abstract: 本发明公开了一种基于自适应重采样深度编码器网络的通路异常检测系统，包括数据采集模块、数据预处理模块、通路异常检测模型构建模块和通路异常检测模块，本发明利用基于神经网络的深度编码器算法，将个体通路异常情况评估问题转换为异常检测问题，区分异常样本与正常样本，并评估异常样本相较于正常样本的通路异常程度，改进基于主成分曲线的通路异常情况评估算法无法稳定评估通路异常情况的问题。在充分利用先验知识的情况下，富集多个生物功能相近的基因的预后信息，有效评估患者的通路异常情况，可用于肿瘤预后预测准确性的提高，辅助医生制定患者的治疗计划。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN113053468B
公开(公告)日：2021-09-03
申请号：CN202110599266.2
申请日：2021-05-31
Applicant: 之江实验室
IPC: G16C20/50
Abstract: 本发明公开了一种融合患者画像信息的药物新适应症发现方法及系统，本发明在数据驱动的药物重定位方案中引入真实世界患者用药和患者诊断数据，将药物在更广泛的人群中的实际使用效果加入到新的药物‑疾病关系预测模型中；本发明通过构建患者画像作为患者信息的特征表达，并以此构建患者‑患者网络，作为药物和疾病网络中间的媒介，构建符合实际临床过程的异构网络体系；本发明预测结果更加贴近临床，在后续老药新用验证和新的临床试验中成功的可能性更大。
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公开(公告)号：CN116312915B
公开(公告)日：2023-09-19
申请号：CN202310567874.4
申请日：2023-05-19
Applicant: 之江实验室
IPC: G06F17/00 , G16H10/60 , G06F40/284 , G06F40/295 , G06F16/35 , G06N3/0464 , G06N3/08
Abstract: 本发明公开了一种电子病历中药物术语标准化关联方法及系统，本发明通过同义词挖掘技术对药物术语库进行更新，得到基于同义词挖掘更新的药物术语库，解决了药物术语库中标准药物术语和电子病历中外部药物术语语义相似性低的问题；本发明在电子病历中外部药物术语与基于同义词挖掘更新的药物术语库中标准药物术语关联时，利用的语义信息除中文字符标记外，加入相应药物术语的拼音字符序列，且充分利用药物术语库和电子病历中外部药物术语的图结构信息；构建了基于语义嵌入和结构嵌入的关联预测模型，从而准确建立真实世界电子病历中外部药物术语与药物术语库中标准药物术语的关联。
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公开(公告)号：CN116312915A
公开(公告)日：2023-06-23
申请号：CN202310567874.4
申请日：2023-05-19
Applicant: 之江实验室
IPC: G16H10/60 , G06F40/284 , G06F40/295 , G06F16/35 , G06N3/0464 , G06N3/08
Abstract: 本发明公开了一种电子病历中药物术语标准化关联方法及系统，本发明通过同义词挖掘技术对药物术语库进行更新，得到基于同义词挖掘更新的药物术语库，解决了药物术语库中标准药物术语和电子病历中外部药物术语语义相似性低的问题；本发明在电子病历中外部药物术语与基于同义词挖掘更新的药物术语库中标准药物术语关联时，利用的语义信息除中文字符标记外，加入相应药物术语的拼音字符序列，且充分利用药物术语库和电子病历中外部药物术语的图结构信息；构建了基于语义嵌入和结构嵌入的关联预测模型，从而准确建立真实世界电子病历中外部药物术语与药物术语库中标准药物术语的关联。
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公开(公告)号：CN115312119B
公开(公告)日：2023-04-07
申请号：CN202211226272.4
申请日：2022-10-09
Applicant: 之江实验室
IPC: G16B15/20 , G16B40/00 , G06V10/764 , G06N3/0464 , G06N3/08
Abstract: 本发明公开了一种基于蛋白质三维结构图像鉴定蛋白质结构域的方法及系统，本发明基于结构相似性鉴定蛋白质结构域，能够有效解决当序列一致性不高时，蛋白质多序列比对错误导致的蛋白质结构域识别错漏；本发明构建基于动态图卷积神经网络的点云分割模型，可通过整合全局结构特征与局部结构特征，同时完成蛋白质结构域的分割和蛋白质结构域语义标签的获取。
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公开(公告)号：CN115148375A
公开(公告)日：2022-10-04
申请号：CN202211051408.2
申请日：2022-08-31
Applicant: 之江实验室
Abstract: 本发明公开了一种高通量真实世界药物有效性与安全性评价方法及系统，包括以下步骤：步骤S1：数据集的构建；步骤S2：构建药物有效性/安全性指标表型库；步骤S3：选定目标药物，定义目标事件、结局事件、目标日期、结局日期，并提取患者ID、目标日期和结局日期；步骤S4：在所述药物有效性/安全性指标表型库选定指标，得到目标药物‑有效性/安全性指标对；对所述目标药物‑有效性/安全性指标对利用事件序列对称分析进行高通量信号筛选，得到初筛阳性信号；步骤S5：对所述初筛阳性信号进行因果评估，确定所述目标药物的有效性与安全性。本发明通过高通量信号筛选与基于临床试验模拟的因果评估算法，高通量的完成目标药物的药物效果因果性评价。
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