水稻生长势性状相关的SNP分子标记及应用

    公开(公告)号:CN117467796A

    公开(公告)日:2024-01-30

    申请号:CN202311624800.6

    申请日:2023-11-30

    Abstract: 本发明提供了一种水稻生长势相关的SNP分子标记及其应用。该分子标记来自LOC_Os04g58550基因的启动子,位于水稻第4染色体34813632bp位置,碱基为A或C,所述SNP分子标记与水稻生长势表型显著相关,位点基因型为A/A的水稻品种的生长势显著高于基因型为C/C的水稻品种。同时依据此SNP位点设计了PCR引物SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2,利用该对引物对待测水稻进行PCR扩增,所得PCR产物进行测序检测,若检测结果显示此标记位置碱基类型为A,则判定该水稻品种生长势强;若检测结果为C,则判定为生长势弱。本发明的SNP分子标记可以作为水稻育种过程中生长势性状的辅助选择标记,提高选择的准确性,加快水稻生长势性状相关育种过程。

    与水稻有效穗数相关的SNP分子标记及应用

    公开(公告)号:CN117512198A

    公开(公告)日:2024-02-06

    申请号:CN202311756096.X

    申请日:2023-12-20

    Abstract: 本发明提供了一种与水稻有效穗数相关的SNP分子标记及其应用。该分子标记来自LOC_Os01g07950基因的第七个外显子,位于水稻第1染色体3845189bp位置,碱基为G或T,所述SNP分子标记与水稻有效穗数显著相关,位点基因型为G/G的水稻品种的有效穗数显著高于基因型为T/T的水稻品种。同时依据此SNP位点设计了PCR引物SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2,利用该对引物对待测水稻进行PCR扩增,所得PCR产物进行测序检测,若检测结果显示此标记位置碱基类型为G,则判定该水稻品种有效穗数多;若检测结果为T,则判定为有效穗数少。本发明的SNP分子标记可以作为水稻育种过程中有效穗数性状的辅助选择标记,提高选择的准确性,加快水稻有效穗数性状相关育种过程。

    一种基于频域变换增强的表型预测方法和装置

    公开(公告)号:CN117174161A

    公开(公告)日:2023-12-05

    申请号:CN202311078766.7

    申请日:2023-08-25

    Abstract: 本发明公开了一种基于频域变换增强的表型预测方法,包括:获取不同作物植株的基因数据和表型数据并对其进行预处理;对预处理后的基因数据进行数值映射;对数值映射后的基因序列进行离散傅里叶变换,判断每个窗口是否为蛋白质编码区,并根据判断结果对蛋白质编码区进行特征增强;将特征增强后的基因序列进行处理,采用低频特征、高频去噪后的特征、小波逆变换后的低频特征以及作为标签的预处理后的表型数据对三流网络进行优化训练;将待检测基因序列的特征输入到训练好的三流网络中,输出表型预测结果。本发明还公开了一种基于频域变换增强的表型预测装置。本发明利用基因编码区的先验提高表型预测效果,实现时频上的基因到表型的非线性关系。

    一种水稻白叶枯病抗性基因Xa1的分子标记、扩增引物及其应用

    公开(公告)号:CN111996284A

    公开(公告)日:2020-11-27

    申请号:CN202011016624.4

    申请日:2020-09-24

    Abstract: 本发明提供了一种水稻白叶枯病抗性基因Xa1的分子标记、扩增引物及其应用,属于分子生物学及作物育种技术领域。水稻白叶枯病抗性基因Xa1的分子标记的核苷酸序列如SEQ ID No:3所示。本发明还提供了用于扩增分子标记的引物。所述分子标记或所述引物在水稻育种、水稻种质资源鉴定、鉴定水稻白叶枯病抗性基因Xa1基因型中的应用。使用该分子标记引物对待测水稻进行PCR扩增,若PCR产物经电泳检测为472bp条带则判定为含有白叶枯病抗性基因Xa1。本发明采用上述鉴定方法具有操作简单、鉴定周期短、检测通量高和成本低的优点。

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