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公开(公告)号：CN115954055A
公开(公告)日：2023-04-11
申请号：CN202211130199.0
申请日：2022-11-02
Applicant: 上海交通大学医学院
Abstract: 本发明公开了基于CRISPR的高通量筛选数据分析可视化操作系统，涉及生物医学技术领域。本发明包括文件输入模块、筛选分析模块和结果输出模块，文件输入模块进行输入文件的特征选择，首先进行文件参数填写，参数填写前确认流程运行项目，文件输入模块包括读取测序文件和读取sgRNA文件，分别对测序文件和sgRNA文件进行测序数据比对，筛选分析模块对比对后的测序数据进行筛选分析，并将分析结果上传至结果输出模块，利用结果输出模块对结果数据进行匹配输出，完成可视化分析操作。本发明基于现有的CRISPR筛选分析流程MAGeCKFlute，开发了一套可视化操作系统，能让分析者仅需通过上传数据和调整关键参数实现分析流程，拿到分析结果。
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公开(公告)号：CN111584065A
公开(公告)日：2020-08-25
申请号：CN202010265470.6
申请日：2020-04-07
Applicant: 上海交通大学医学院附属第九人民医院 , 上海交通大学
Abstract: 本申请提供噪声性听力损失预测及易感人群筛选方法、装置、终端和介质，包括：采集噪声暴露人群样本的多种听力特征数据并进行预处理；基于人群样本预处理数据定义高频听阈切迹听力特征数据，构建用于预测个体易感情况的高频听阈切迹面积预测模型；获取待测人群样本中的医学特征数据和听力阈值测量数据；比较所述预测切迹面积值和实际切迹面积值，据以判断待测人群样本的个体易感情况。本发明通过大数据预测和长期的临床经验，辅助判断听力损失情况和筛选易感抵抗个体，达到填补噪声性听力损失早期辅助诊断的空白效果，解决了当前各界对于噪声性听力损失早期诊断没有金标准，帮助患者早期预防，这是防治噪声性听力损失的关键。
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公开(公告)号：CN119274653A
公开(公告)日：2025-01-07
申请号：CN202411152028.7
申请日：2024-08-21
Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院 , 上海交通大学
Abstract: 本发明提供一种基于血浆游离DNA突变检测的胆囊癌预测方法及设备，包括：基因突变特征提取模块利用基因突变分析算法从样本基因测序数据中提取样本基因突变特征；胆囊占位良恶性鉴别模型建立模块，基于基因突变特征从靶向基因中筛选胆囊癌的关键基因，以得到训练完成的胆囊占位良恶性鉴别模型；检测模块从待检测者的血浆游离DNA中获取待检测者的关键基因的基因突变特征，将待检测者的关键基因的基因突变特征输入所述胆囊占位良恶性鉴别模型，以得到胆囊占位性病变的恶性概率。可以采用非侵入性的方式采集患者外周血提取游离DNA，减少对患者的伤害和痛苦，通过胆囊占位良恶性鉴别模型，可以准确高效的得到一个包含有胆囊癌的预测概率的判断结果。
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公开(公告)号：CN111584065B
公开(公告)日：2023-09-19
申请号：CN202010265470.6
申请日：2020-04-07
Applicant: 上海交通大学医学院附属第九人民医院 , 上海交通大学
Abstract: 本申请提供噪声性听力损失预测及易感人群筛选方法、装置、终端和介质，包括：采集噪声暴露人群样本的多种听力特征数据并进行预处理；基于人群样本预处理数据定义高频听阈切迹听力特征数据，构建用于预测个体易感情况的高频听阈切迹面积预测模型；获取待测人群样本中的医学特征数据和听力阈值测量数据；比较所述预测切迹面积值和实际切迹面积值，据以判断待测人群样本的个体易感情况。本发明通过大数据预测和长期的临床经验，辅助判断听力损失情况和筛选易感抵抗个体，达到填补噪声性听力损失早期辅助诊断的空白效果，解决了当前各界对于噪声性听力损失早期诊断没有金标准，帮助患者早期预防，这是防治噪声性听力损失的关键。
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