本申请提供了一种船用甲醇燃料调控系统和方法。船用甲醇燃料调控系统包括：供给装置，供给装置用于向发动机输出甲醇；监测装置，监测装置与供给装置连接，用于获取供给装置中的压力；吹扫装置，吹扫装置与供给装置连接，用于吹扫供给装置中的甲醇；泄放装置，泄放装置与吹扫装置连接，用于接收并泄放吹扫装置排出的甲醇；气动装置，气动装置分别与供给装置、监测装置、吹扫装置和泄放装置相连接，用于根据监测装置获取的压力分别控制供给装置、吹扫装置和泄放装置的开启和关闭。本申请提供的船用甲醇燃料调控系统能够为高压甲醇双燃料中速机等设备提供合适压力和流量的甲醇燃料，同时气动装置能够实现系统内部控制，完成相关功能。