公开(公告)号：CN103559425B

公开(公告)日：2017-02-15

申请号：CN201310585089.8

申请日：2013-11-19

Applicant: 黑龙江省森林工程与环境研究所

Inventor： 梁素钰 ,  刘滨凡 ,  田松岩 ,  刘延坤 ,  李琳 ,  孙清芳 ,  刘广菊 ,  刘长乐 ,  李云红 ,  贾丹 ,  杜倩 ,  邵英男 ,  王文帆 ,  陈瑶 ,  李东玫 ,  刘玉龙 ,  王刚

IPC: G06F19/22

Abstract: 本发明提供的是高通量基因测序的有效数据分类寻优目标检测系统及检测方法。包括依次相连的测序仪、数据库模块和数据处理模块。测序仪对所需测序基因进行测序并将测序数据存储到所述数据库模块中；数据处理模块包括数据归类模块、目标检测模块、有效数据模块、操作单元分类模块、相似度寻优模块、结果显示模块和无效数据模块。本发明针对高通量基因测序数据序列庞杂的特性，对所测数据序列进行归类参数的选取和效值的赋值或定义，经过数据归类子模块的循环递近归类，配合目标检测模块，判断是否进行数据归类优化，获得有效数据；并进行不同相似度下的操作单元优化分类，计算分类单元出现的频率，从而实现庞杂高通量基因序列的最(56)对比文件聂志扬等.DNA测序技术与仪器的发展《.中国医疗器械信息》.2009,(第10期),13－16.Mattie M D, et al.,.Optimized high-throughput microRNA expression profilingprovides novel biomarker assessment ofclinical prostate and breast cancerbiopsies《.Molecular Cancer》.2006,第5卷(第24期),1－14.Josserand, TM.Classification of geneexpression data using PCA-based faultdetection and identification《.2008 IEEEINTERNATIONAL WORKSHOP ON GENOMIC SIGNALPROCESSING AND STATISTICS》.2008,72-75.Matthias Meyer, et al.,.Targetedhigh-throughput sequencing of taggednucleic acid samples《.Nucleic AcidsResearch》.2007,第35卷(第15期),e97:1-5.张骏.新一代基因测序的数据处理中的相关问《.中国优秀硕士学位论文全文数据库信息科技辑（月刊 ）》.2012,(第7期),I138-1831.Dunbar S A..Applications of LuminexxMAP technology for rapid, high-throughput multiplexed nucleic aciddetection《.Clinica Chimica Acta》.2005,第363卷(第1期),71-82.

公开(公告)号：CN103559425A

公开(公告)日：2014-02-05

申请号：CN201310585089.8

申请日：2013-11-19

Applicant: 黑龙江省森林工程与环境研究所

Inventor： 梁素钰 ,  刘滨凡 ,  田松岩 ,  刘延坤 ,  李琳 ,  孙清芳 ,  刘广菊 ,  刘长乐 ,  李云红 ,  贾丹 ,  杜倩 ,  邵英男 ,  王文帆 ,  陈瑶 ,  李东玫 ,  刘玉龙 ,  王刚

IPC: G06F19/22

Abstract: 本发明提供的是高通量基因测序的有效数据分类寻优目标检测系统及检测方法。包括依次相连的测序仪、数据库模块和数据处理模块。测序仪对所需测序基因进行测序并将测序数据存储到所述数据库模块中；数据处理模块包括数据归类模块、目标检测模块、有效数据模块、操作单元分类模块、相似度寻优模块、结果显示模块和无效数据模块。本发明针对高通量基因测序数据序列庞杂的特性，对所测数据序列进行归类参数的选取和效值的赋值或定义，经过数据归类子模块的循环递近归类，配合目标检测模块，判断是否进行数据归类优化，获得有效数据；并进行不同相似度下的操作单元优化分类，计算分类单元出现的频率，从而实现庞杂高通量基因序列的最优有效序列目标检测。