一种基于特定基序列的高鲁棒性DNA存储方法

    公开(公告)号:CN119727735A

    公开(公告)日:2025-03-28

    申请号:CN202411780895.5

    申请日:2024-12-05

    Abstract: 本发明提出了一种基于特定基序列的高鲁棒性DNA存储方法,用于解决现有存储方案中忽视局部GC稳定性与全局鲁棒性技术问题。本发明的步骤为:构建"0‑1"映射规则和特定基序列;利用"0‑1"映射规则和特定基序列对待编码的二进制序进行DNA编码,生成规则索引序列和数据DNA序列;采用多元霍夫曼编码对规则索引序列进行压缩,并结合多元旋转编码对压缩的序列进行编码生成DNA编码序列;将得到的数据DNA序列多次测序与特定基序列比对来检错和纠错。本发明在保证局部GC含量接近50%的同时提高了纠错能力,优化了DNA存储的可靠性和效率;在平均存储密度为1.33bit/nt的情况下,提高了存储的鲁棒性,为大规模DNA数据可靠存储提供了新思路。

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