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公开(公告)号：CN115064205B
公开(公告)日：2025-02-11
申请号：CN202210709529.5
申请日：2022-06-21
Applicant: 西安电子科技大学
Abstract: 本发明提供的一种癌症类型特异的基因调控网络构建方法，依靠计算机高性能计算的特点，通过数据挖掘技术高效地进行转录因子与基因的相互作用预测，在考虑转录因子调控基因组线性近邻基因的同时，也考虑到染色质三维结构对调控的影响，将空间近邻所形成的调控关系进行整合，获得更全面的转录因子与基因调控关系，进而构建出更完整的癌症类型特异的基因调控网络。本发明可以实现染色质的状态与结构信息与基因表达功能信息的融合，遵循结构决定功能这一基础规律，既可以避免单一类型数据的信息不足问题，又可以避免过多类型数据的信息冗余问题。相比于传统生物实验方法，极大地节约了时间成本和经济开支。
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公开(公告)号：CN115064205A
公开(公告)日：2022-09-16
申请号：CN202210709529.5
申请日：2022-06-21
Applicant: 西安电子科技大学
Abstract: 本发明提供的一种癌症类型特异的基因调控网络构建方法，依靠计算机高性能计算的特点，通过数据挖掘技术高效地进行转录因子与基因的相互作用预测，在考虑转录因子调控基因组线性近邻基因的同时，也考虑到染色质三维结构对调控的影响，将空间近邻所形成的调控关系进行整合，获得更全面的转录因子与基因调控关系，进而构建出更完整的癌症类型特异的基因调控网络。本发明可以实现染色质的状态与结构信息与基因表达功能信息的融合，遵循结构决定功能这一基础规律，既可以避免单一类型数据的信息不足问题，又可以避免过多类型数据的信息冗余问题。相比于传统生物实验方法，极大地节约了时间成本和经济开支。
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