一种筛选代谢组中差异代谢物的方法

    公开(公告)号:CN113295759A

    公开(公告)日:2021-08-24

    申请号:CN202110618175.9

    申请日:2021-05-31

    Applicant: 西南大学

    Abstract: 本发明公开了一种筛选代谢组中差异代谢物的方法,先使用代谢组检测设备对对照组和实验组的样本中的代谢物进行检测,代谢物即离子,然后对检测到的信息进行提取,根据提取到的信息在数据处理软件中创建数据库,最后在数据库中对离子的信息进行分析处理,筛选出差异离子。其中,在数据库中筛选出分布频率大于或等于50%和80%的离子,然后在上述离子中筛选出差异离子,最后对差异离子进行打分和同位素筛查。本发明的筛选方法能快速、高效筛选出广覆盖且高质量的离子,另外本方法只需检测仪器自带的处理软件和常用的数据处理软件,学习成本低。

    一种筛选代谢组中差异代谢物的方法

    公开(公告)号:CN113295759B

    公开(公告)日:2022-08-05

    申请号:CN202110618175.9

    申请日:2021-05-31

    Applicant: 西南大学

    Abstract: 本发明公开了一种筛选代谢组中差异代谢物的方法,先使用代谢组检测设备对对照组和实验组的样本中的代谢物进行检测,代谢物即离子,然后对检测到的信息进行提取,根据提取到的信息在数据处理软件中创建数据库,最后在数据库中对离子的信息进行分析处理,筛选出差异离子。其中,在数据库中筛选出分布频率大于或等于50%和80%的离子,然后在上述离子中筛选出差异离子,最后对差异离子进行打分和同位素筛查。本发明的筛选方法能快速、高效筛选出广覆盖且高质量的离子,另外本方法只需检测仪器自带的处理软件和常用的数据处理软件,学习成本低。

    基于改进灰狼优化算法的差异代谢物分析方法及系统

    公开(公告)号:CN114091590A

    公开(公告)日:2022-02-25

    申请号:CN202111334354.6

    申请日:2021-11-11

    Applicant: 西南大学

    Abstract: 一种基于改进灰狼优化算法的差异代谢物分析方法及系统,包括以下步骤:一,获取数据源,其中数据源包括离子的质谱信号数据,对数据进行整合;二,通过哈希算法在数据源获取每个离子所需分析的信息;三,将获取离子的质谱信号数据进行组间对比分析,并根据学生t检验算法以及用户需求的离子评判标准,筛选出所需分析的离子;四,使用改进灰狼优化算法对差异离子进行选择;五,获取差异离子数据,并使用KNN方法进行分类模型建模;六,计算分类模型的混淆矩阵、ROC曲线、AUC面积指标,向用户展示差异分析结果。

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