齐口裂腹鱼细菌性败血症关联的SNP标记及其应用

    公开(公告)号:CN106967831B

    公开(公告)日:2019-06-14

    申请号:CN201710356150.X

    申请日:2017-05-19

    Applicant: 西南大学

    Abstract: 本发明提供了一种齐口裂腹鱼细菌性败血症关联的SNP标记及其应用,所述SNP标记核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,序列自5’端起第779位碱基为C或T。在本发明所述SNP位点处,基因型为CT的齐口裂腹鱼感染细菌性败血症的概率显著高于纯合CC型个体。因此,通过检测齐口裂腹鱼上述SNP,能够有效地确定其是否易患染细菌性败血症。在亲本选育中淘汰CT基因型个体利于提高后代抗细菌性败血症感染的能力,利用本发明标记进行辅助育种,进而加快齐口裂腹鱼抗病优良品种培养进程。

    一种针对维氏气单胞菌的检测试剂盒及其使用方法

    公开(公告)号:CN106399520A

    公开(公告)日:2017-02-15

    申请号:CN201610880396.2

    申请日:2016-10-09

    Applicant: 西南大学

    CPC classification number: C12Q1/689 C12Q1/686 C12Q2600/16 C12Q2537/143

    Abstract: 本发明提供了一种针对维氏气单胞菌的检测试剂盒及其使用方法,该技术方案首先通过实验发现gyrB基因作为单拷贝的看家基因,比常规的16S rRNA在区分和鉴定维氏气单胞菌及其近缘种上具有更显著的优势;同时发现Aha基因稳定存在于维氏气单胞菌中,并与其毒力存在关联。基于以上有益的发现,本发明选用gyrB基因和Aha基因作为靶基因开发了针对维氏气单胞菌双重PCR检测方法,该方法围绕两种靶基因设计了特异性引物,并围绕其确定了PCR反应体系和反应条件。本发明对维氏气单胞菌检测敏感性强、特异性高,可以快速、准确地检测黄颡鱼源致病性维氏气单胞菌,有效避免错检漏检。同时避免了反复培养、冗长的一系列生化反应,节约时间、劳动力和成本。

    齐口裂腹鱼细菌性败血症关联的SNP标记及其应用

    公开(公告)号:CN106967831A

    公开(公告)日:2017-07-21

    申请号:CN201710356150.X

    申请日:2017-05-19

    Applicant: 西南大学

    CPC classification number: C12Q1/6888 C12Q2600/124 C12Q2600/156

    Abstract: 本发明提供了一种齐口裂腹鱼细菌性败血症关联的SNP标记及其应用,所述SNP标记核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,序列自5’端起第779位碱基为C或T。在本发明所述SNP位点处,基因型为CT的齐口裂腹鱼感染细菌性败血症的概率显著高于纯合CC型个体。因此,通过检测齐口裂腹鱼上述SNP,能够有效地确定其是否易患染细菌性败血症。在亲本选育中淘汰CT基因型个体利于提高后代抗细菌性败血症感染的能力,利用本发明标记进行辅助育种,进而加快齐口裂腹鱼抗病优良品种培养进程。

    齐口裂腹鱼生长速度相关的SNP标记及其应用

    公开(公告)号:CN106435006B

    公开(公告)日:2019-07-26

    申请号:CN201611187467.7

    申请日:2016-12-21

    Applicant: 西南大学

    Abstract: 本发明提供了一种齐口裂腹鱼生长速度相关的SNP标记及其应用,所述SNP标记包括SNP1标记和SNP2标记,核苷酸序列依次如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示。当SNP1和SNP2两个位点的基因型均为纯合CC时,待测齐口裂腹鱼个体生长速度更快。选择在SNP1和SNP2位点处基因型都为CC的个体杂交,则后代个体在SNP1和SNP2位点处基因型都为纯合CC,后代个体都为快速生长类型。本发明的SNP标记与齐口裂腹鱼的生长速度紧密相关,能够在鱼苗培养早期根据育种需要选择亲本,利用本发明标记进行辅助育种,进而加快齐口裂腹鱼优良品种培养进程。

    齐口裂腹鱼生长速度相关的SNP标记及其应用

    公开(公告)号:CN106435006A

    公开(公告)日:2017-02-22

    申请号:CN201611187467.7

    申请日:2016-12-21

    Applicant: 西南大学

    Abstract: 本发明提供了一种齐口裂腹鱼生长速度相关的SNP标记及其应用,所述SNP标记包括SNP1标记和SNP2标记,核苷酸序列依次如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示。当SNP1和SNP2两个位点的基因型均为纯合CC时,待测齐口裂腹鱼个体生长速度更快。选择在SNP1和SNP2位点处基因型都为CC的个体杂交,则后代个体在SNP1和SNP2位点处基因型都为纯合CC,后代个体都为快速生长类型。本发明的SNP标记与齐口裂腹鱼的生长速度紧密相关,能够在鱼苗培养早期根据育种需要选择亲本,利用本发明标记进行辅助育种,进而加快齐口裂腹鱼优良品种培养进程。

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