公开(公告)号：CN112941151B

公开(公告)日：2022-07-01

申请号：CN202110347759.7

申请日：2021-03-31

Applicant: 西北农林科技大学 ,  陕西省农产品质量安全中心

Inventor： 聂小军 ,  崔立操 ,  佘奎军 ,  马红战 ,  宋卫宁

IPC: C12Q1/6809 ,  C12Q1/6895

Abstract: 本发明涉及分子标记技术领域，尤其涉及一种利用RNA‑seq技术构建EST‑SSR标记的方法与应用，包括如下步骤：利用RNA‑seq技术，构建RNA‑seq序列文库；将RNA‑seq序列文库中获得的片段进行组装，得到转录本；利用Misa软件对原生地样本转录本进行SSR预测和鉴定，得到SSR位点；设计SSR位点的引物，得到SSR引物对；利用blast软件将SSR引物对分别与入侵地样本转录本和原生地样本转录本进行序列相似比对，得到电子模拟PCR扩增片段，筛选片段大小不一致的标记，为EST‑SSR标记，最后进行PCR实验验证，分析这些标记在紫茎泽兰群体中的遗传多态性。

公开(公告)号：CN113151535A

公开(公告)日：2021-07-23

申请号：CN202110181512.2

申请日：2021-02-08

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 聂小军 ,  宋卫宁 ,  杨光 ,  崔立操 ,  佘奎军

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6809 ,  C12N15/11 ,  G16B20/30

Abstract: 本发明属于分子生物学技术领域，涉及一组菊科植物分子鉴定的叶绿体SSR标记引物及其获取方法。该叶绿体SSR标记引物为SSR1、SSR2或SSR3中的一种或几种，其获取方法包括：1.检索并获取菊科叶绿体基因组；2.预测并获得鉴定的菊科叶绿体基因组SSR位点，开发SSR标记；3.电子PCR扩增菊科叶绿体SSR标记，并筛选多态性SSR标记；4.验证和获得用于菊科物种分子鉴定的叶绿体SSR标记。该叶绿体SSR标记引物及其获取方法，建立了菊科叶绿体SSR位点的鉴定和多态性分析的方法，提高了多态性SSR标记的筛选效率，减轻了试验工作量、提高了试验效率、节约了成本。

公开(公告)号：CN113151535B

公开(公告)日：2022-06-28

申请号：CN202110181512.2

申请日：2021-02-08

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 聂小军 ,  宋卫宁 ,  杨光 ,  崔立操 ,  佘奎军

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6809 ,  C12N15/11 ,  G16B20/30

Abstract: 本发明属于分子生物学技术领域，涉及一组菊科植物分子鉴定的叶绿体SSR标记引物及其获取方法。该叶绿体SSR标记引物为SSR1、SSR2或SSR3中的一种或几种，其获取方法包括：1.检索并获取菊科叶绿体基因组；2.预测并获得鉴定的菊科叶绿体基因组SSR位点，开发SSR标记；3.电子PCR扩增菊科叶绿体SSR标记，并筛选多态性SSR标记；4.验证和获得用于菊科物种分子鉴定的叶绿体SSR标记。该叶绿体SSR标记引物及其获取方法，建立了菊科叶绿体SSR位点的鉴定和多态性分析的方法，提高了多态性SSR标记的筛选效率，减轻了试验工作量、提高了试验效率、节约了成本。

公开(公告)号：CN112941151A

公开(公告)日：2021-06-11

申请号：CN202110347759.7

申请日：2021-03-31

Applicant: 西北农林科技大学 ,  陕西省农产品质量安全中心

Inventor： 聂小军 ,  崔立操 ,  佘奎军 ,  马红战 ,  宋卫宁

IPC: C12Q1/6809 ,  C12Q1/6895

Abstract: 本发明涉及分子标记技术领域，尤其涉及一种利用RNA‑seq技术构建EST‑SSR标记的方法与应用，包括如下步骤：利用RNA‑seq技术，构建RNA‑seq序列文库；将RNA‑seq序列文库中获得的片段进行组装，得到转录本；利用Misa软件对原生地样本转录本进行SSR预测和鉴定，得到SSR位点；设计SSR位点的引物，得到SSR引物对；利用blast软件将SSR引物对分别与入侵地样本转录本和原生地样本转录本进行序列相似比对，得到电子模拟PCR扩增片段，筛选片段大小不一致的标记，为EST‑SSR标记，最后进行PCR实验验证，分析这些标记在紫茎泽兰群体中的遗传多态性。

公开(公告)号：CN114807410A

公开(公告)日：2022-07-29

申请号：CN202210273846.7

申请日：2022-03-19

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 聂小军 ,  杨光 ,  魏新雨 ,  宋卫宁 ,  佘奎军 ,  潘文秋 ,  艾琪

IPC: C12Q1/6895 ,  C40B40/06 ,  C40B50/06 ,  G16B20/30 ,  G16B30/10

Abstract: 本发明属于植物分子标记技术领域，涉及一种大麦40K SNP液相芯片。该大麦40K SNP液相芯片通过下述方法获得：1.选取大麦及青稞为种质材料进行重测序，再对测序结果进行质控、与参考基因组映射，鉴定与筛选出SNP位点；2.根据SNP位点的指标，结合位点在染色体上的位置，分析其上下游序列并设计测序引物，挑选能够用于芯片开发的SNP位点；3.运用靶向测序基因分型技术开发该大麦40K SNP液相芯片。该大麦40K SNP液相芯片，属于DNA检测用SNP芯片，是基于靶向捕获高通量测序技术开发的包含有40519个SNP标记位点的大麦全基因组液相芯片，为大麦高密度遗传图谱构建、大麦种质鉴定、高通量基因分型、QTL定位、全基因组关联分析等提供重要的工具。

公开(公告)号：CN216701062U

公开(公告)日：2022-06-10

申请号：CN202220166587.3

申请日：2022-01-21

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 佘奎军 ,  聂小军 ,  宋卫宁 ,  潘文秋 ,  刘艳妮

IPC: A01G9/02

Abstract: 本实用新型属于植物培养技术领域，涉及一种农作物根系生长角度的观察装置。该观察装置，包括容纳盒、卡扣机构；容纳盒为顶部开口的方形扁盒，容纳盒包括容仓以及覆盖于容仓上的盖板，容仓和盖板通过卡扣机构固定；容纳盒为透明材质加工而成。该观察装置，可对农作物根系生长状态进行直接观察，结构简单、成本低廉、操作便捷。