公开(公告)号：CN108841983A

公开(公告)日：2018-11-20

申请号：CN201810650240.4

申请日：2018-06-22

Applicant: 福建农林大学

Inventor： 王恒波 ,  肖乃衍 ,  张华 ,  陈平华 ,  卢运海

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供一种甘蔗全长转录组数据大规模开发的SSR标记引物，基于22甘蔗栽培种的不同组织和生长阶段的混合转录组数据，开发的SSR标记引物，序列如SEQ ID NO.1-40所示，开发的引物应具有扩增结果稳定、电泳条带清晰可辨、多态性位点高的优点，可以用于甘蔗遗传多样性分析、品种鉴定和保护、DNA指纹图谱及遗传连锁图谱的构建。

公开(公告)号：CN108504771A

公开(公告)日：2018-09-07

申请号：CN201810650238.7

申请日：2018-06-22

Applicant: 福建农林大学

Inventor： 王恒波 ,  肖乃衍 ,  张华 ,  陈平华 ,  卢运海

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供一种基于甘蔗基因组序列开发的SSR核心引物，含有28对引物，序列如SEQ ID NO.1-56所示。开发的引物具有扩增结果稳定、电泳条带清晰可辨、多态性位点高的优点，可以用于甘蔗遗传多样性分析、品种鉴定和保护、DNA指纹图谱及遗传连锁图谱的构建。

公开(公告)号：CN105713989A

公开(公告)日：2016-06-29

申请号：CN201610271692.2

申请日：2016-04-28

Applicant: 福建农林大学

Inventor： 郭晋隆 ,  卢运海 ,  许莉萍 ,  王恒波 ,  阙友雄 ,  刘迪 ,  肖乃衍 ,  陈平华

IPC: C12Q1/68 ,  C12N15/11

CPC classification number: C12Q1/6895 ,  C12Q1/686 ,  C12Q2600/13 ,  C12Q2521/301 ,  C12Q2565/125

Abstract: 本发明提供了一种鉴定甘蔗抗褐锈病基因位点紧密连锁的分子标记方法，分别以待鉴定甘蔗和“POJ2878”的基因组DNA为模板，利用引物1和引物2进行扩增，将扩增的PCR产物利用限制性核酸内切酶HaeIII进行酶切，通过琼脂糖凝胶电泳检测酶切产物，与抗褐锈病甘蔗品种POJ2878的酶切产物进行比较，来判断所待鉴定甘蔗的抗病性。本发明方法可用于甘蔗抗褐锈病基因的图位克隆和分子标记辅助选择，通过检测抗褐锈病基因位点来预测待鉴定甘蔗对褐锈病的抗性，不仅节约生产成本而且大大提高选择效率，进而加速甘蔗抗褐锈病育种进程。

公开(公告)号：CN105713989B

公开(公告)日：2019-03-22

申请号：CN201610271692.2

申请日：2016-04-28

Applicant: 福建农林大学

Inventor： 郭晋隆 ,  卢运海 ,  许莉萍 ,  王恒波 ,  阙友雄 ,  刘迪 ,  肖乃衍 ,  陈平华

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/686 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供了一种鉴定甘蔗抗褐锈病基因位点紧密连锁的分子标记方法，分别以待鉴定甘蔗和“POJ2878”的基因组DNA为模板，利用引物1和引物2进行扩增，将扩增的PCR产物利用限制性核酸内切酶HaeIII进行酶切，通过琼脂糖凝胶电泳检测酶切产物，与抗褐锈病甘蔗品种POJ2878的酶切产物进行比较，来判断所待鉴定甘蔗的抗病性。本发明方法可用于甘蔗抗褐锈病基因的图位克隆和分子标记辅助选择，通过检测抗褐锈病基因位点来预测待鉴定甘蔗对褐锈病的抗性，不仅节约生产成本而且大大提高选择效率，进而加速甘蔗抗褐锈病育种进程。

公开(公告)号：CN105713988B

公开(公告)日：2019-03-22

申请号：CN201610271677.8

申请日：2016-04-28

Applicant: 福建农林大学

Inventor： 郭晋隆 ,  卢运海 ,  王恒波 ,  许莉萍 ,  阙友雄 ,  刘迪 ,  肖乃衍 ,  陈平华

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供了一种快速鉴定甘蔗抗褐锈病基因位点的分子标记引物及应用，分别以待鉴定甘蔗和“POJ2878”的基因组DNA为模板，利用引物1、引物2、引物3、引物4进行扩增，将扩增的PCR产物利用限制性核酸内切酶HaeIII进行酶切，通过琼脂糖凝胶电泳检测酶切产物，与抗褐锈病甘蔗品种POJ2878的酶切产物（分别为389bp和606bp）进行比较，来判断所待鉴定甘蔗的抗病性。本发明方法可用于甘蔗抗褐锈病基因的图位克隆和分子标记辅助选择，通过检测抗褐锈病基因位点来预测待鉴定甘蔗对褐锈病的抗性，不仅节约生产成本而且大大提高选择效率，进而加速甘蔗抗褐锈病育种进程。

公开(公告)号：CN105713988A

公开(公告)日：2016-06-29

申请号：CN201610271677.8

申请日：2016-04-28

Applicant: 福建农林大学

Inventor： 郭晋隆 ,  卢运海 ,  王恒波 ,  许莉萍 ,  阙友雄 ,  刘迪 ,  肖乃衍 ,  陈平华

IPC: C12Q1/68 ,  C12N15/11

CPC classification number: C12Q1/6895 ,  C12Q2600/13

Abstract: 本发明提供了一种快速鉴定甘蔗抗褐锈病基因位点的分子标记引物及应用，分别以待鉴定甘蔗和“POJ2878”的基因组DNA为模板，利用引物1、引物2、引物3、引物4进行扩增，将扩增的PCR产物利用限制性核酸内切酶HaeIII进行酶切，通过琼脂糖凝胶电泳检测酶切产物，与抗褐锈病甘蔗品种POJ2878的酶切产物（分别为389bp和606bp）进行比较，来判断所待鉴定甘蔗的抗病性。本发明方法可用于甘蔗抗褐锈病基因的图位克隆和分子标记辅助选择，通过检测抗褐锈病基因位点来预测待鉴定甘蔗对褐锈病的抗性，不仅节约生产成本而且大大提高选择效率，进而加速甘蔗抗褐锈病育种进程。