一种高效加尾快速扩增植物dsRNA病毒基因组末端序列的方法及其应用

    公开(公告)号:CN114457142B

    公开(公告)日:2024-07-26

    申请号:CN202210176147.0

    申请日:2022-02-25

    Abstract: 本发明提供一种高效加尾快速扩增植物dsRNA病毒基因组末端序列的方法及其应用。该方法通过加热总RNA变性成单链RNA;对单链RNA的3'端加A尾;使用oligo(dT)10‑RT将RNA逆转录成cDNA;以cDNA为模板将病毒基因组各分段的两端划分为5'端区域和3'端区域进行Multiplex PCR;跑胶回收目的条带并将其连接至克隆载体后进行测序,获得基因组的全部末端序列。该方法对样品的RNA质量要求低,oligo(dT)10‑RT与Anchor24‑F引物在dsRNA病毒基因组末端序列鉴定上可通同,适用于批量获得dsRNA病毒基因组末端序列,将有助于未知的dsRNA基因组全长序列的获得。

    一种高效加尾快速扩增植物dsRNA病毒基因组末端序列的方法及其应用

    公开(公告)号:CN114457142A

    公开(公告)日:2022-05-10

    申请号:CN202210176147.0

    申请日:2022-02-25

    Abstract: 本发明提供一种高效加尾快速扩增植物dsRNA病毒基因组末端序列的方法及其应用。该方法通过加热总RNA变性成单链RNA;对单链RNA的3'端加A尾;使用oligo(dT)10‑RT将RNA逆转录成cDNA;以cDNA为模板将病毒基因组各分段的两端划分为5'端区域和3'端区域进行Multiplex PCR;跑胶回收目的条带并将其连接至克隆载体后进行测序,获得基因组的全部末端序列。该方法对样品的RNA质量要求低,oligo(dT)10‑RT与Anchor24‑F引物在dsRNA病毒基因组末端序列鉴定上可通同,适用于批量获得dsRNA病毒基因组末端序列,将有助于未知的dsRNA基因组全长序列的获得。

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