一种在染色体悬浮液中进行基因组原位杂交的方法

    公开(公告)号:CN109735603A

    公开(公告)日:2019-05-10

    申请号:CN201910205574.5

    申请日:2019-03-19

    Abstract: 本发明涉及一种在染色体悬浮液中进行基因组原位杂交(Genome in situ hybridization in suspension,GISHIS)的方法,包括细胞周期同步化、染色体悬浮液制备、基因组探针制备、样品与基因组探针变性、悬浮液中进行基因组原位杂交。滴片镜检,若悬浮液中产生绿色荧光信号,则判定为斑茅染色体,说明成功将绿色荧光标记到斑茅染色体上了。利用流式细胞仪,可以对染色体悬浮液中特异标记绿色荧光信号的斑茅染色体实现分选并进行相关测序研究,为研究复杂多倍体斑茅基因组提供了新的、有效可行的方法。本发明可应用于各种作物中属间杂交后代的染色体悬浮液中进行基因组原位杂交。

    一种利用亚端粒序列鉴定甘蔗中包含斑茅血缘的方法

    公开(公告)号:CN108315462B

    公开(公告)日:2021-03-26

    申请号:CN201810167833.5

    申请日:2018-02-28

    Abstract: 本发明涉及一种利用亚端粒序列鉴定甘蔗中包含斑茅血缘的方法,包括根尖细胞玻片制备、标记探针制备、根尖玻片预处理、配制变性杂交混合液、变性杂交混合液与预处理根尖玻片的杂交。若杂交玻片上产生绿色荧光信号,则判定该待测样品包含斑茅血缘,为甘蔗与斑茅真实杂交后代。所述产生绿色荧光信号探针的核苷酸序列为序列表中SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列。本发明结合荧光原位杂交技术,利用斑茅相对甘蔗特异的亚端粒序列探针来鉴别甘蔗与斑茅的真实杂交后代,具有效率高,灵敏性好,稳定性好,可靠性高的特点,只需获得蔗苗的根尖就能够检测较高杂交世代的真实性,为在甘蔗遗传育种改良过程中斑茅的杂交利用提供稳定有效的鉴别方法。

    一种利用亚端粒序列鉴定甘蔗中包含斑茅血缘的方法

    公开(公告)号:CN108315462A

    公开(公告)日:2018-07-24

    申请号:CN201810167833.5

    申请日:2018-02-28

    Abstract: 本发明涉及一种利用亚端粒序列鉴定甘蔗中包含斑茅血缘的方法,包括根尖细胞玻片制备、标记探针制备、根尖玻片预处理、配制变性杂交混合液、变性杂交混合液与预处理根尖玻片的杂交。若杂交玻片上产生绿色荧光信号,则判定该待测样品包含斑茅血缘,为甘蔗与斑茅真实杂交后代。所述产生绿色荧光信号探针的核苷酸序列为序列表中SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列。本发明结合荧光原位杂交技术,利用斑茅相对甘蔗特异的亚端粒序列探针来鉴别甘蔗与斑茅的真实杂交后代,具有效率高,灵敏性好,稳定性好,可靠性高的特点,只需获得蔗苗的根尖就能够检测较高杂交世代的真实性,为在甘蔗遗传育种改良过程中斑茅的杂交利用提供稳定有效的鉴别方法。

    一套甘蔗品种真实性检测SNP标记及应用

    公开(公告)号:CN118360431A

    公开(公告)日:2024-07-19

    申请号:CN202410647596.8

    申请日:2024-05-23

    Abstract: 本发明公开了一套甘蔗品种真实性检测SNP标记及应用,包括177个核心SNP标记,SNP标记符合下述条件:F_MISSING≤0.3||MAF≥0.05,QUAL≥30.0||QD≥2.0||FS≤60.0||MQ≥40.0||SOR≤4.0条件;hwe平衡常数p≥0.01;均匀分布在甘蔗各染色体上且该位点上下100bp没有其他变异位点;采用LDR多重SNP分型试剂盒进行标记开发,能够转化成果的位点。本发明的优点:该套SNP标记组合建立DNA指纹图谱库,从而可以对甘蔗品种进行聚类分析和品种鉴定,使得检测结果更精准、高效;该套SNP标记稳定性好,均匀分布在甘蔗的80条染色体上,具有较好的可重复性;基于LDR技术的SNP引物组合在DNA质量满足常规PCR反应需求的情况下,对甘蔗品种检测的准确度和分辨率均很高,检测效率是SSR标记的10‑20倍,检测成本与SSR标记相当,检测过程更加快速、通量更高,同时检测过程中无需使用丙烯酰胺等有毒化学试剂,安全性高、环境友好。

    一种利用散布序列鉴定甘蔗中包含斑茅血缘的方法

    公开(公告)号:CN108103062B

    公开(公告)日:2021-03-02

    申请号:CN201810169070.8

    申请日:2018-02-28

    Abstract: 本发明涉及一种利用散布序列鉴定甘蔗中包含斑茅血缘的方法,包括根尖细胞玻片制备、标记探针制备、根尖玻片预处理、配制变性杂交混合液、变性杂交混合液与预处理根尖玻片的杂交。若杂交玻片上产生绿色荧光信号,则判定该待测样品包含斑茅血缘,为甘蔗与斑茅真实杂交后代。所述产生绿色荧光信号的是探针,其核苷酸序列为序列表中SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列。本发明结合荧光原位杂交技术,利用斑茅相对甘蔗特异的散布序列探针来鉴别甘蔗与斑茅的真实杂交后代,具有效率高,灵敏性好,稳定性好,可靠性高的特点,只需获得蔗苗的根尖就能够检测任何杂交世代的真实性,为在甘蔗遗传育种改良过程中斑茅的杂交利用提供高效稳定的鉴别方法。

Patent Agency Ranking