药物高效应答候选标记的挖掘方法及系统

    公开(公告)号:CN115458188A

    公开(公告)日:2022-12-09

    申请号:CN202211408979.7

    申请日:2022-11-11

    Abstract: 本发明涉及基因分析技术领域,具体涉及一种药物高效应答候选标记的挖掘方法及系统,本方法包括根据癌种群体样本的基因数据、对应的药物疗效敏感性数据以及对应的基因表达量数据,建立权重分析模型,得出药物高效应答的候选基因及对应的药物,根据相似疗效反应模式将对应的药物进行聚类,得到不同类别的药物,分析同一类别的药物之间的作用机理,计算同一类别药物中相关性靠前基因,形成药物类别特性高相关的基因组合,并针对所述药物类别特性高相关的基因组合与所述对应的所有药物中每一种药物的相关性进行分析,并确定药物疗效反应的分子标记,基于分子标记,确定用药;实现基于现有数据库数据,挖掘药物高效应答候选标记。

    基于数据集成的肿瘤跨适应症联合用药推荐方法和系统

    公开(公告)号:CN115472216B

    公开(公告)日:2023-03-24

    申请号:CN202211417378.2

    申请日:2022-11-14

    Abstract: 本申请公开了一种基于数据集成的肿瘤跨适应症联合用药推荐方法和系统,涉及生物信息学领域,首先获取肿瘤的靶向蛋白列表,基于靶向蛋白列表生成候选药物列表,构建并优化药物响应预测模型,最后基于药物响应预测模型推荐所述候选药物列表中的最佳药物组合。本申请公开的基于数据集成的肿瘤跨适应症联合用药方法及系统,通过集成多种数据,以及开发新颖的生物信息学流程,将基于网络的模型应用到生信分析流程中,识别肿瘤潜在的多靶点疗法以及实现其跨适应症联合用药的推荐。

    基于肿瘤样本的多组学联合分析方法和系统

    公开(公告)号:CN115064213B

    公开(公告)日:2022-11-01

    申请号:CN202210989837.8

    申请日:2022-08-18

    Abstract: 本申请公开了基于肿瘤样本的多组学联合分析方法和系统,涉及肿瘤致病机制分析领域,根据肿瘤样本的转录组学数据构建共表达基因模块;基于肿瘤样本的基因组数据获取SCNV基因列表;对共表达基因模块中的基因和SCNV基因列表中的基因进行相关性分析,生成SCNV基因列表中基因的评分结果,进而利用GO注释和快速功能注释从SCNV基因列表中获取肿瘤的致病新发基因;基于肿瘤核心通路变化因子构建肿瘤致病新发基因调控网络;最后验证肿瘤的致病新发基因。本申请通过基因组数据和转录组数据的联合分析,挖掘了肿瘤致病驱动的候选调控因子,对由转录调控影响变化而造成的疾病进展,疾病发病机制的调控关系,揭示肿瘤的肿瘤新发基因。

    基于肿瘤样本的多组学联合分析方法和系统

    公开(公告)号:CN115064213A

    公开(公告)日:2022-09-16

    申请号:CN202210989837.8

    申请日:2022-08-18

    Abstract: 本申请公开了基于肿瘤样本的多组学联合分析方法和系统,涉及肿瘤致病机制分析领域,根据肿瘤样本的转录组学数据构建共表达基因模块;基于肿瘤样本的基因组数据获取SCNV基因列表;对共表达基因模块中的基因和SCNV基因列表中的基因进行相关性分析,生成SCNV基因列表中基因的评分结果,进而利用GO注释和快速功能注释从SCNV基因列表中获取肿瘤的致病新发基因;基于肿瘤核心通路变化因子构建肿瘤致病新发基因调控网络;最后验证肿瘤的致病新发基因。本申请通过基因组数据和转录组数据的联合分析,挖掘了肿瘤致病驱动的候选调控因子,对由转录调控影响变化而造成的疾病进展,疾病发病机制的调控关系,揭示肿瘤的肿瘤新发基因。

    药物高效应答候选标记的挖掘方法及系统

    公开(公告)号:CN115458188B

    公开(公告)日:2023-03-14

    申请号:CN202211408979.7

    申请日:2022-11-11

    Abstract: 本发明涉及基因分析技术领域,具体涉及一种药物高效应答候选标记的挖掘方法及系统,本方法包括根据癌种群体样本的基因数据、对应的药物疗效敏感性数据以及对应的基因表达量数据,建立权重分析模型,得出药物高效应答的候选基因及对应的药物,根据相似疗效反应模式将对应的药物进行聚类,得到不同类别的药物,分析同一类别的药物之间的作用机理,计算同一类别药物中相关性靠前基因,形成药物类别特性高相关的基因组合,并针对所述药物类别特性高相关的基因组合与所述对应的所有药物中每一种药物的相关性进行分析,并确定药物疗效反应的分子标记,基于分子标记,确定用药;实现基于现有数据库数据,挖掘药物高效应答候选标记。

    基于数据集成的肿瘤跨适应症联合用药推荐方法和系统

    公开(公告)号:CN115472216A

    公开(公告)日:2022-12-13

    申请号:CN202211417378.2

    申请日:2022-11-14

    Abstract: 本申请公开了一种基于数据集成的肿瘤跨适应症联合用药推荐方法和系统,涉及生物信息学领域,首先获取肿瘤的靶向蛋白列表,基于靶向蛋白列表生成候选药物列表,构建并优化药物响应预测模型,最后基于药物响应预测模型推荐所述候选药物列表中的最佳药物组合。本申请公开的基于数据集成的肿瘤跨适应症联合用药方法及系统,通过集成多种数据,以及开发新颖的生物信息学流程,将基于网络的模型应用到生信分析流程中,识别肿瘤潜在的多靶点疗法以及实现其跨适应症联合用药的推荐。

Patent Agency Ranking