公开(公告)号：CN119400252A

公开(公告)日：2025-02-07

申请号：CN202510012421.4

申请日：2025-01-06

Applicant: 电子科技大学长三角研究院(衢州)

Inventor： 邹权 ,  张雪 ,  王春宇 ,  牛梦婷

IPC: G16B40/20 ,  G06N3/045 ,  G06N3/09

Abstract: 本发明公开了一种基于共享单元的环状RNA和疾病关联预测模型的构建方法、预测系统和预测方法，通过构建的环状RNA和疾病关联预测模型实现关联预测，包括：基于已知关联数据集构建环状RNA元路径网络、环状RNA相似性网络、疾病元路径网络和疾病相似性网络，对前述网络分别进行特征提取得到环状RNA相似性特征、环状RNA元路径特征、疾病相似性特征和疾病元路径特征；相似性特征和元路径特征被同时输入至共享单元；共享单元输出的相似性特征被输入至多层感知机进行环状RNA与疾病的关联预测并更新模型参数。为模型设计共享单元，通过构建环状RNA和疾病的相似性网络及元路径网络，通过在多视图特征融合过程中捕获潜在的跨视图信息，从而提升模型的预测性能。

公开(公告)号：CN119993283A

公开(公告)日：2025-05-13

申请号：CN202510464934.9

申请日：2025-04-15

Applicant: 电子科技大学长三角研究院(衢州)

Inventor： 邹权 ,  张梓童 ,  牛梦婷 ,  王春宇

IPC: G16B40/00 ,  G06N3/042 ,  G06N3/045 ,  G06N3/096

Abstract: 本发明公开了一种基于知识增强语言模型的蛋白质相互作用调节剂预测方法，包括，调节剂模型构建：预训练文本编码器，引入基于指纹的结构编码器，拼接文本编码器输出的文本嵌入和结构编码器输出的多种指纹嵌入生成调节剂特征；蛋白质模型构建：收集GO图和GO注释，基于GO图训练图嵌入模型，使用训练后的图嵌入模型为每个GO术语节点生成结构特征，结合GO术语的结构特征输出GO术语嵌入向量，基于多个GO术语嵌入向量生成蛋白质特征；预测模型构建：以调节剂特征和蛋白质特征为输入，输出相互作用特征，并基于相互作用特征输出预测结果。本方案通过自然语言的细微表达与生物分子结构属性的融合实现了蛋白质相互作用调节剂预测性能的有效提升。

公开(公告)号：CN117649885A

公开(公告)日：2024-03-05

申请号：CN202311532360.1

申请日：2023-11-16

Applicant: 电子科技大学长三角研究院(衢州)

Inventor： 邹权 ,  曹超 ,  王春宇 ,  丁漪杰 ,  周通

IPC: G16B40/20 ,  G16B40/30 ,  G06N3/0464 ,  G06N3/088 ,  G06N3/09 ,  G06F18/213 ,  G06F18/25

Abstract: 本方案公开了一种识别c ircRNA蛋白结合位点的新方法，该方法提出利用三种特征提取技术实现针对序列的多种编码特征，由跨视图预测和微调两部分构成预测模型，利用其中两种编码特征对预测模型进行无监督的跨视图预测以训练预测模型的上下文提取能力，同时进一步利用全部三种特征提取技术基于有标签样本得到的融合编码特征对预测模型进行微调，最终实现通过少量带标签样本实现具有c ircRNA蛋白结合位点识别能力且具有更佳的综合能力、更高的预测性能的预测模型。