公开(公告)号：CN108959854B

公开(公告)日：2021-08-03

申请号：CN201810638833.9

申请日：2018-06-20

Applicant: 湘潭大学

Inventor： 匡林爱 ,  赵皓晨 ,  王雷 ,  轩占伟 ,  喻景雯 ,  裴廷瑞

IPC: G16B40/00 ,  G16H50/70

Abstract: 本发明公开了一种生物信息领域的基于点割集的LncRNA与疾病关联关系的预测方法，包括以下步骤：构建LncRNA与疾病的相互作用网络；基于所述相互作用网络构建邻接矩阵；基于所述邻接矩阵构建最短跳矩阵；根据所述邻接矩阵与所述最短跳矩阵收集所述相互作用网络中节点的点割集；根据所述点割集构建距离相关系数矩阵；根据所述距离相关系数矩阵、疾病节点之间的欧氏距离、疾病节点的数据差异、LncRNA节点之间的欧氏距离、LncRNA节点的数据差异和疾病节点与LncRNA节点的关联强相关值构建距离差异矩阵；根据距离差异矩阵计算节点对的相关度，并根据节点对的相关度构建节点关联度矩阵；分解所述节点关联度矩阵得到供LncRNA与疾病关联关系预测的预测子矩阵。

公开(公告)号：CN108920903B

公开(公告)日：2022-04-01

申请号：CN201810747052.3

申请日：2018-07-09

Applicant: 湘潭大学

Inventor： 王雷 ,  喻景雯 ,  匡林爱 ,  冯湘 ,  轩占伟

IPC: G16B30/00 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明公开了一种基于朴素贝叶斯的LncRNA与疾病的关联关系预测方法，包括：根据已知的MiRNA与疾病关联关系、MiRNA与LncRNA关联关系以及LncRNA与疾病关联关系的数据集构建基于三者关联关系的复杂网络；在复杂网络中找出LncRNA节点与疾病节点的共同邻居节点；基于朴素贝叶斯的概率模型计算有共同邻居节点的LncRNA节点与疾病节点相连的概率，得到LncRNA节点与疾病节点对的相似度值。本发明整合多个数据库的多个关联关系，从而在构建的复杂网络中给待预测的LncRNA节点与疾病节点建立了更多的连接，从而提高LncRNA与疾病关联关系的预测效果。

公开(公告)号：CN108959854A

公开(公告)日：2018-12-07

申请号：CN201810638833.9

申请日：2018-06-20

Applicant: 湘潭大学

Inventor： 匡林爱 ,  赵皓晨 ,  王雷 ,  轩占伟 ,  喻景雯 ,  裴廷瑞

IPC: G06F19/24 ,  G16H50/70

CPC classification number: G16H50/70

Abstract: 本发明公开了一种生物信息领域的基于点割集的LncRNA与疾病关联关系的预测方法，包括以下步骤：构建LncRNA与疾病的相互作用网络；基于所述相互作用网络构建邻接矩阵；基于所述邻接矩阵构建最短跳矩阵；根据所述邻接矩阵与所述最短跳矩阵收集所述相互作用网络中节点的点割集；根据所述点割集构建距离相关系数矩阵；根据所述距离相关系数矩阵、疾病节点之间的欧氏距离、疾病节点的数据差异、LncRNA节点之间的欧氏距离、LncRNA节点的数据差异和疾病节点与LncRNA节点的关联强相关值构建距离差异矩阵；根据距离差异矩阵计算节点对的相关度，并根据节点对的相关度构建节点关联度矩阵；分解所述节点关联度矩阵得到供LncRNA与疾病关联关系预测的预测子矩阵。

公开(公告)号：CN108920903A

公开(公告)日：2018-11-30

申请号：CN201810747052.3

申请日：2018-07-09

Applicant: 湘潭大学

Inventor： 王雷 ,  喻景雯 ,  匡林爱 ,  冯湘 ,  轩占伟

IPC: G06F19/22 ,  G06F19/24

Abstract: 本发明公开了一种基于朴素贝叶斯的LncRNA与疾病的关联关系预测方法，包括：根据已知的MiRNA与疾病关联关系、MiRNA与LncRNA关联关系以及LncRNA与疾病关联关系的数据集构建基于三者关联关系的复杂网络；在复杂网络中找出LncRNA节点与疾病节点的共同邻居节点；基于朴素贝叶斯的概率模型计算有共同邻居节点的LncRNA节点与疾病节点相连的概率，得到LncRNA节点与疾病节点对的相似度值。本发明整合多个数据库的多个关联关系，从而在构建的复杂网络中给待预测的LncRNA节点与疾病节点建立了更多的连接，从而提高LncRNA与疾病关联关系的预测效果。