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公开(公告)号:CN117253550A
公开(公告)日:2023-12-19
申请号:CN202311159405.5
申请日:2023-09-08
Applicant: 湖南工业大学
IPC: G16B40/30 , G06F18/2323 , G06F18/214 , G06N3/0895 , G06N3/0455 , G06N3/042
Abstract: 本发明公开了一种空间转录组数据聚类方法,包括:先对原始数据进行预处理,同时构建spot空间邻居网络;其次,通过图注意力自动编码器进一步学习空间信息和基因表达的低维潜在表示,通过多尺度自表达模块学习编码器中不同层的自表达系数矩阵并融合在一起,在深度子空间聚类模块中,采用谱聚类,并将聚类标签反馈给自监督模块;自监督模块通过构建返回编码器的自监督路径来指导潜在表示的学习;最后,进行生物学分析;本发明通过集成空间信息和基因表达谱学习低维潜在嵌入,利用STMSGAL提高空间分辨转录组的聚类性能。