公开(公告)号：CN116486917A

公开(公告)日：2023-07-25

申请号：CN202310446344.4

申请日：2023-04-24

Applicant: 湖南大学

Inventor： 王奕蓉 ,  蔡子欣

IPC: G16B35/20 ,  G16B25/10 ,  G16B30/10 ,  G16B40/00 ,  G16B50/30 ,  G16B50/40

Abstract: 本发明具体公开了一种抑制肿瘤异常增殖的uORF的筛选方法，所述方法包括以下步骤：S1、基于人类全基因组文件和人类基因组注释文件识别全基因组的uORF；S2、根据肿瘤的翻译组数据获取有翻译信号的uORF；S3、设定肿瘤异常增殖uORF的筛选标准，并基于所设定的筛选标准获取抑制肿瘤异常增殖的uORF。本发明能够从全基因组中筛选出抑制肿瘤异常增殖的uORF，为以后科研和临床医学提供了可能的肿瘤药物靶点，为uORF在肿瘤中作用的研究提供参考方向。

公开(公告)号：CN119876146A

公开(公告)日：2025-04-25

申请号：CN202510087814.1

申请日：2025-01-20

Applicant: 湖南大学

Inventor： 王奕蓉 ,  舒淙瑶 ,  蔡子欣

IPC: C12N15/113 ,  C12Q1/6869

Abstract: 本发明属于高通量测序技术领域，具体涉及一种富集全长tRNA的双链接头及其在tRNA测序中的应用。双链接头包含3’接头和5’接头，其中3’接头和5’接头碱基互补配对；所述3’接头的核苷酸序列如SEQ ID NO.1‑4中至少一种以上：所述5’接头的核苷酸序列如SEQ ID NO.5‑8所示。本发明利用双链接头中5’接头尾部的“NGGU‑”序列，可富集全长tRNA进行测序；同时在接头的5’端添加1个随机碱基，降低接头连接过程对某种tRNA分子偏好性。利用一步法连接双链接头，减少实验操作中的样品损耗；18h连接双链接头，可提升连接效率。利用双链接头对不同样本进行区分，可以实现混样测序，减少起始投入量，大大降低测序成本，提高数据产量，能够更好地对tRNA的表达动态进行深入分析。

公开(公告)号：CN119220570A

公开(公告)日：2024-12-31

申请号：CN202411365241.6

申请日：2024-09-29

Applicant: 湖南大学

Inventor： 王奕蓉 ,  于峰 ,  程慧敏 ,  蔡子欣 ,  舒淙瑶

IPC: C12N15/67 ,  C12N15/85 ,  C12Q1/6806 ,  C40B50/06 ,  G16B30/00

Abstract: 本发明属于生物技术技术领域，具体涉及一种根据tRNA表达特征提升蛋白质生物合成效率的方法。本发明提供一种根据tRNA表达特征提升蛋白质生物合成效率的方法，所述方法包含以下步骤：(1)构建样本的tRNA‑seq文库(2)选取将同一同型tRNA中表达量最高的同工受体tRNA相应的密码子定义为高RSAU密码子；(3)将高RSAU密码子替换待表达基因序列中低RSAU密码子。本发明的有益效果：(1)优化密码子偏好性，提高同工tRNA使用效率，平衡密码子和tRNA浓度，提高翻译效率；(2)考虑不同宿主的同工tRNA的表达量，使密码子更适应宿主细胞环境；(3)不仅替换稀有密码子，还考虑tRNA丰度，实现更全面的密码子优化。