公开(公告)号：CN111462833A

公开(公告)日：2020-07-28

申请号：CN201910050902.9

申请日：2019-01-20

Applicant: 深圳智药信息科技有限公司

Inventor： 黄韬 ,  杨晨

IPC: G16C20/30 ,  G16C20/50 ,  G16C20/10 ,  G16C20/60

Abstract: 公开了一种虚拟药物筛选方法、装置、计算设备、存储介质。所述方法包括：对配体化合物和靶标蛋白质进行分子对接；以对接后的化合物分子所含的每一个原子为参考原子，确定每一参考原子的化合物邻近原子和蛋白质邻近原子，记录相应的预定结构信息并映射为结构信息矩阵组；利用神经网络对结构信息矩阵组进行嵌入操作，由嵌入后的结构信息矩阵组得到化合物-蛋白质复合物的表示矩阵；对所述表示矩阵进行卷积、偏置、池化，得到结构向量；将所述结构向量与表示所述化合物的物理化学性质和分子指纹的理化性质向量拼接，并经神经网络加权和偏置后进行全连接操作，得到用于表示所述化合物对所述靶标蛋白质呈非活性和活性的2维向量，以此进行药物筛选。

公开(公告)号：CN111462833B

公开(公告)日：2023-05-23

申请号：CN201910050902.9

申请日：2019-01-20

Applicant: 深圳智药信息科技有限公司

Inventor： 黄韬 ,  杨晨

IPC: G16C20/30 ,  G16C20/50 ,  G16C20/10 ,  G16C20/60

Abstract: 公开了一种虚拟药物筛选方法、装置、计算设备、存储介质。所述方法包括：对配体化合物和靶标蛋白质进行分子对接；以对接后的化合物分子所含的每一个原子为参考原子，确定每一参考原子的化合物邻近原子和蛋白质邻近原子，记录相应的预定结构信息并映射为结构信息矩阵组；利用神经网络对结构信息矩阵组进行嵌入操作，由嵌入后的结构信息矩阵组得到化合物‑蛋白质复合物的表示矩阵；对所述表示矩阵进行卷积、偏置、池化，得到结构向量；将所述结构向量与表示所述化合物的物理化学性质和分子指纹的理化性质向量拼接，并经神经网络加权和偏置后进行全连接操作，得到用于表示所述化合物对所述靶标蛋白质呈非活性和活性的2维向量，以此进行药物筛选。