公开(公告)号：CN118430645A

公开(公告)日：2024-08-02

申请号：CN202410880242.8

申请日：2024-07-02

Applicant: 海南大学三亚南繁研究院 ,  海南大学三亚研究院

Inventor： 夏志强 ,  罗璇 ,  田阳阳 ,  江思容 ,  赵龙 ,  夏成材 ,  李子璇 ,  邹枚伶

IPC: G16B20/20 ,  G16B30/10 ,  G16B40/20 ,  C12Q1/6895

Abstract: 本发明涉及基因组数据分析技术领域，尤其涉及一种全基因DNA数据再定义方法。包括：获取待测物种的基因组区域文件、参考基因组文件和基因组变异位点文件；基因组变异位点文件通过比对参考基因组文件确定；在基因组区域文件中提取待测物种的基因所在位置的数据信息；通过基因组变异位点文件确定突变位点；对基因组区域文件中的数据信息进行分类；以基因编码区为权重，其他区域按照在所述待测物种的生物过程中发挥的作用和距离所述突变位点的距离由高到低依次打分，距离所述突变位点最近的位置信息的区域记为10分，其他区域内依次递减打分；根据得分对所述待测物种进行定义。优点在于：计算简单、节约时间、应用广泛。

公开(公告)号：CN118430645B

公开(公告)日：2024-11-22

申请号：CN202410880242.8

申请日：2024-07-02

Applicant: 海南大学三亚南繁研究院 ,  海南大学三亚研究院

Inventor： 夏志强 ,  罗璇 ,  田阳阳 ,  江思容 ,  赵龙 ,  夏成材 ,  李子璇 ,  邹枚伶

IPC: G16B20/20 ,  G16B30/10 ,  G16B40/20 ,  C12Q1/6895

Abstract: 本发明涉及基因组数据分析技术领域，尤其涉及一种全基因DNA数据再定义方法。包括：获取待测物种的基因组区域文件、参考基因组文件和基因组变异位点文件；基因组变异位点文件通过比对参考基因组文件确定；在基因组区域文件中提取待测物种的基因所在位置的数据信息；通过基因组变异位点文件确定突变位点；对基因组区域文件中的数据信息进行分类；以基因编码区为权重，其他区域按照在所述待测物种的生物过程中发挥的作用和距离所述突变位点的距离由高到低依次打分，距离所述突变位点最近的位置信息的区域记为10分，其他区域内依次递减打分；根据得分对所述待测物种进行定义。优点在于：计算简单、节约时间、应用广泛。

公开(公告)号：CN119061128B

公开(公告)日：2025-04-18

申请号：CN202411575754.X

申请日：2024-11-06

Applicant: 海南大学三亚南繁研究院 ,  三亚海古纪生物科技有限公司

Inventor： 夏志强 ,  许睿 ,  陈建元 ,  罗璇

IPC: C12Q1/6876 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6869 ,  C40B50/06 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明涉及生物基因工程领域，尤其涉及一种微卫星DNA扩增引物对及二代测序方法；引物对包括左引物和右引物，引物包括TA[barcode]区域和保守序列结合区域，所述左引物保守序列结合区域为AAAAGAGAGAGAGAGT，对应的右引物保守序列结合区域为TCTCTCTCTCTCTCA，所述TA[barcode]区域连接于左引物或右引物5’端，所述测序方法成本低但速率增加，其是在PCR扩增后混样测序，能使测序产出的数据量较均一。

公开(公告)号：CN119061128A

公开(公告)日：2024-12-03

申请号：CN202411575754.X

申请日：2024-11-06

Applicant: 海南大学三亚南繁研究院 ,  三亚海古纪生物科技有限公司

Inventor： 夏志强 ,  许睿 ,  陈建元 ,  罗璇

IPC: C12Q1/6876 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6869 ,  C40B50/06 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明涉及生物基因工程领域，尤其涉及一种微卫星DNA扩增引物对及二代测序方法；引物对包括左引物和右引物，引物包括TA[barcode]区域和保守序列结合区域，所述左引物保守序列结合区域为AAAAGAGAGAGAGAGT，对应的右引物保守序列结合区域为TCTCTCTCTCTCTCA，所述TA[barcode]区域连接于左引物或右引物5’端，所述测序方法成本低但速率增加，其是在PCR扩增后混样测序，能使测序产出的数据量较均一。