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公开(公告)号：CN119785922A
公开(公告)日：2025-04-08
申请号：CN202510281618.8
申请日：2025-03-11
Applicant: 浙江大学
Abstract: 本公开提供了一种小分子生成方法、装置、电子设备及存储介质，涉及小分子生成技术领域，其中方法包括：获取小分子安全知识图谱，在该图谱中，每一节点内存储有一个现有小分子的属性数据，每一第一枝叶内存储有位于该第一枝叶两端的节点对应的现有小分子之间的化学关系数据；对于每一现有小分子，从相应节点内提取与该现有小分子的毒性类型和功能类型相关的属性数据，构建嵌入向量；基于嵌入向量筛选出重要节点；以及，基于重要节点对小分子生成模型进行生成偏好的调整，使其生成符合设定毒性、功能要求的新小分子。该方法通过结合小分子安全知识图谱与知识偏好优化技术，确保生成的新分子符合药效标准，并具备高度的生物安全性。
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公开(公告)号：CN118737287A
公开(公告)日：2024-10-01
申请号：CN202410858983.6
申请日：2024-06-28
Applicant: 浙江大学
Abstract: 本发明公开了一种基于蛋白质安全知识图谱的对抗强化学习的蛋白质安全可控生成方法和装置，包括：构建蛋白质安全知识图谱；提取有害蛋白质序列的初始嵌入表示和外部知识的嵌入向量；基于有害蛋白质序列的初始嵌入表示和外部知识的嵌入向量并结合蛋白质安全知识图谱进行知识嵌入，得到增强嵌入表示；构建包含生成器和惩罚模型的生成式对抗网络，并进行一阶段的对抗惩罚学习；固定一阶段对抗惩罚学习后的惩罚模型的参数，进行二阶段的强化学习；利用二阶段参数优化后的生成器生成安全可控的新蛋白质，该方法和装置以基于语言模型为基础的，将知识图谱作为外部知识，利用对抗强化学习引导蛋白质安全可控生成。
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公开(公告)号：CN118737287B
公开(公告)日：2025-04-11
申请号：CN202410858983.6
申请日：2024-06-28
Applicant: 浙江大学
Abstract: 本发明公开了一种基于蛋白质安全知识图谱的对抗强化学习的蛋白质安全可控生成方法和装置，包括：构建蛋白质安全知识图谱；提取有害蛋白质序列的初始嵌入表示和外部知识的嵌入向量；基于有害蛋白质序列的初始嵌入表示和外部知识的嵌入向量并结合蛋白质安全知识图谱进行知识嵌入，得到增强嵌入表示；构建包含生成器和惩罚模型的生成式对抗网络，并进行一阶段的对抗惩罚学习；固定一阶段对抗惩罚学习后的惩罚模型的参数，进行二阶段的强化学习；利用二阶段参数优化后的生成器生成安全可控的新蛋白质，该方法和装置以基于语言模型为基础的，将知识图谱作为外部知识，利用对抗强化学习引导蛋白质安全可控生成。
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