一种利用eQTL构建基因调控网络的方法及应用

    公开(公告)号:CN119517156A

    公开(公告)日:2025-02-25

    申请号:CN202411652148.3

    申请日:2024-11-19

    Applicant: 浙江大学

    Abstract: 本发明公开了一种利用eQTL构建基因调控网络的方法及应用,方法具体为:利用eQTL数据,通过eQTL2GRN程序,计算每个eQTL中eSNP与其所在染色体1百万碱基对范围内所有其他SNP之间的连锁不平衡程度,根据连锁不平衡程度进行归类,利用eSNP和eGene的物理坐标位置,判断调控的类型为cis或trans;最后构建基因调控网络,并进行可视化。通过本发明所述的方法,可以识别和分析基因之间的调控关系,进而更深入地理解遗传变异如何影响基因表达和表型特征。

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