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公开(公告)号：CN115810392A
公开(公告)日：2023-03-17
申请号：CN202211615708.9
申请日：2022-12-15
Applicant: 浙江大学
IPC: G16B20/30 , G06F16/36 , G06F18/214
Abstract: 本发明公开了一种融合知识图谱的基因序列预训练方法和装置，通过考虑基因之间调控关系构建基因调控图谱，并在基因调控图谱中增加motif和bin来构建基于基因调控网络的知识图谱，进而学习基因在知识图谱中的基因表示，并将知识图谱中的基因表示作为特殊token引入基因的基因序列中，提升了MLM模型对mask的预测准确性，并得到准确性的基因表示，将序列中学到的基因表示作为扩充基因调控图谱中基因的初始向量，再次经过可插拔表示模型提取基因表示，这样交替过程实现了知识图谱信息和基因序列信息的交互，利用交互训练的MLM模型提取基因表示，能够提升进而提升基因相关性质预测的准确性。
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