一种玉米微生物标记物筛选及表型预测方法

    公开(公告)号:CN119252335A

    公开(公告)日:2025-01-03

    申请号:CN202411773964.X

    申请日:2024-12-05

    Applicant: 济南大学

    Inventor: 李慧 王哲 武杨柳

    Abstract: 本发明涉及一种玉米微生物标记物筛选及表型预测方法,属于玉米育种技术领域。其包括以下步骤:微生物样本预处理:获取玉米微生物样本数据,并进行数据清理和标准化操作,生成标准化的微生物丰度表;LEfSe分析筛选差异微生物,最终得到显著差异微生物特征集;基于LightGBM的特征重要性评估:将LEfSe筛选的显著差异微生物特征集划分为训练集和测试集;构建LightGBM模型;LightGBM模型对微生物特征重要性进行计算评估;筛选重要特征得到微生物标记物,用于深入解析玉米表型变化的关键微生物群落特征;模型验证和性能评估:通过模型训练、模型验证及模型性能评估验证筛选出的微生物特征的预测有效性。本发明能够在保留重要生物学特征的同时提升模型的预测效果。

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