公开(公告)号：CN115995262A

公开(公告)日：2023-04-21

申请号：CN202310278072.1

申请日：2023-03-21

Applicant: 济南大学

Inventor： 李慧 ,  周辉 ,  付佳 ,  王哲

IPC: G16B5/20 ,  G16B20/20 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明属于系统生物学\遗传学领域，具体涉及基于随机森林及LASSO回归解析玉米遗传机理的方法。本发明对玉米预处理后的基因型数据进行连锁不平衡分析，删除r2值大于0.2的SNP位点后，剩余位点构成新的特征子集；确定重要影响因子，这些影响因子构成新的特征子集；通过上述特征子集和脂质组数据建立LASSO分析模型，对每一种脂质代谢物表型进行预测；使用预测的脂质代谢物数据值结合表型数据建立LASSO分析模型，对表型数据进行预测，使用决定系数R2评估模型。本发明通过筛选有代表性的特征子集进行多组学数据联合分析解析玉米脂质组的遗传机理，为玉米高产自交系的遗传改良提供了理论基础。

公开(公告)号：CN115995262B

公开(公告)日：2023-05-23

申请号：CN202310278072.1

申请日：2023-03-21

Applicant: 济南大学

Inventor： 李慧 ,  周辉 ,  付佳 ,  王哲

IPC: G16B5/20 ,  G16B20/20 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明属于系统生物学\遗传学领域，具体涉及基于随机森林及LASSO回归解析玉米遗传机理的方法。本发明对玉米预处理后的基因型数据进行连锁不平衡分析，删除r2值大于0.2的SNP位点后，剩余位点构成新的特征子集；确定重要影响因子，这些影响因子构成新的特征子集；通过上述特征子集和脂质组数据建立LASSO分析模型，对每一种脂质代谢物表型进行预测；使用预测的脂质代谢物数据值结合表型数据建立LASSO分析模型，对表型数据进行预测，使用决定系数R2评估模型。本发明通过筛选有代表性的特征子集进行多组学数据联合分析解析玉米脂质组的遗传机理，为玉米高产自交系的遗传改良提供了理论基础。