一种高光谱成像鉴定微生物的方法

    公开(公告)号:CN109187385A

    公开(公告)日:2019-01-11

    申请号:CN201810962962.3

    申请日:2018-08-22

    Abstract: 本发明涉及一种高光谱成像鉴定微生物的方法。该方法包括以下步骤:1)获得已知微生物纯培养样品和待鉴定未知菌的高光谱图像;2)对高光谱图像进行校正处理,得到高光谱校正图像;3)建立高光谱反射率曲线;4)对高光谱反射率曲线进行去噪平滑处理,得到高光谱吸收曲线;5)分析已知微生物的高光谱吸收曲线的特征差异,确定反映该特征差异的种属鉴定波段;6)确定用于菌种鉴定的残差平方和阈值;7)在种属鉴定波段下,计算待鉴定未知菌与已知微生物的高光谱吸收曲线的残差平方和,与阈值比较,完成鉴定。该方法主要是利用微生物纯培养样品的表型及内部特征在特定波段上的特征吸收差异,实现微生物种属关系的鉴定,提高鉴定效率。

    一种高光谱成像鉴定微生物的方法

    公开(公告)号:CN109187385B

    公开(公告)日:2022-03-04

    申请号:CN201810962962.3

    申请日:2018-08-22

    Abstract: 本发明涉及一种高光谱成像鉴定微生物的方法。该方法包括以下步骤:1)获得已知微生物纯培养样品和待鉴定未知菌的高光谱图像;2)对高光谱图像进行校正处理,得到高光谱校正图像;3)建立高光谱反射率曲线;4)对高光谱反射率曲线进行去噪平滑处理,得到高光谱吸收曲线;5)分析已知微生物的高光谱吸收曲线的特征差异,确定反映该特征差异的种属鉴定波段;6)确定用于菌种鉴定的残差平方和阈值;7)在种属鉴定波段下,计算待鉴定未知菌与已知微生物的高光谱吸收曲线的残差平方和,与阈值比较,完成鉴定。该方法主要是利用微生物纯培养样品的表型及内部特征在特定波段上的特征吸收差异,实现微生物种属关系的鉴定,提高鉴定效率。

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