公开(公告)号：CN107557486A

公开(公告)日：2018-01-09

申请号：CN201710773330.8

申请日：2017-08-31

Applicant: 河南工业大学

Inventor： 杨艳会 ,  王金水 ,  崔柳青 ,  李明杰 ,  伊艳杰 ,  李瑞芳 ,  李桂玲 ,  张慧茹 ,  董臣 ,  张亚林 ,  常莹 ,  张姣姣

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/686 ,  C12Q1/6858

Abstract: 本发明公开了一种基于牛膝转录组开发的EST-SSR引物组，共23对引物，其核苷酸序列如序列表所示。本发明还涉及基于牛膝转录组开发的EST-SSR引物组的获取方法。本发明利用牛膝转录组的EST序列，首次批量开发了牛膝的EST-SSR序列，所获得的SSR重复序列信息直接来源于mRNA，检测的是不同种质材料间基因表达差异的信息，与表现型直接联系；为牛膝种质资源的准确评价、特异性状基因的定位、遗传图谱的构建等研究提供了重要的信息平台；通过PCR反应体系及其程序的优化，建立了一种适合鉴定牛膝EST-SSR标记的PCR扩增体系，为从牛膝中鉴定出新型的EST-SSR标记提供了有力的工具。

公开(公告)号：CN107338242B

公开(公告)日：2020-07-31

申请号：CN201710442784.7

申请日：2017-06-13

Applicant: 河南工业大学

Inventor： 杨艳会 ,  王金水 ,  崔柳青 ,  李明杰 ,  李桂玲 ,  伊艳杰 ,  李瑞芳 ,  张慧茹 ,  董臣 ,  张姣姣 ,  李盈颖

IPC: C12N15/10

Abstract: 本发明涉及一种用于怀牛膝根系基因组DNA甲基化分析的DNA提取方法。本发明基于CTAB法主要进行以下改进，CTAB、PVP、NaCl的浓度分别提高至4%、5%、2mol/L，同时添加1%SDS，并以氯仿与异戊醇混合液为抽提液，且裂解和抽提步骤的离心温度控制为25～35℃，再以无水乙醇沉淀DNA，并加高盐溶液离析多糖等杂质，再次沉淀DNA。本发明方法提取的怀牛膝根系DNA纯度高，酶切完全，甲基化基因筛选的多态性高、重复性好，提取获得的DNA可有效地应用于怀牛膝根系基因组DNA甲基化分析，为从表观遗观学水平研究怀牛膝生长发育、逆境胁迫、药效成分的积累等过程中的分子调控机制奠定物质基础。

公开(公告)号：CN107338242A

公开(公告)日：2017-11-10

申请号：CN201710442784.7

申请日：2017-06-13

Applicant: 河南工业大学

Inventor： 杨艳会 ,  王金水 ,  崔柳青 ,  李明杰 ,  李桂玲 ,  伊艳杰 ,  李瑞芳 ,  张慧茹 ,  董臣 ,  张姣姣 ,  李盈颖

IPC: C12N15/10

Abstract: 本发明涉及一种用于怀牛膝根系基因组DNA甲基化分析的DNA提取方法。本发明基于CTAB法主要进行以下改进，CTAB、PVP、NaCl的浓度分别提高至4%、5%、2mol/L，同时添加1%SDS，并以氯仿与异戊醇混合液为抽提液，且裂解和抽提步骤的离心温度控制为25～35℃，再以无水乙醇沉淀DNA，并加高盐溶液离析多糖等杂质，再次沉淀DNA。本发明方法提取的怀牛膝根系DNA纯度高，酶切完全，甲基化基因筛选的多态性高、重复性好，提取获得的DNA可有效地应用于怀牛膝根系基因组DNA甲基化分析，为从表观遗观学水平研究怀牛膝生长发育、逆境胁迫、药效成分的积累等过程中的分子调控机制奠定物质基础。