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公开(公告)号:CN115449545A
公开(公告)日:2022-12-09
申请号:CN202211137466.7
申请日:2022-09-19
Applicant: 河南大学
Inventor: 宋纯鹏 , 李浩 , 周云 , 刘一帆 , 朱乐乐 , 聂芳 , 范芮晓 , 李政 , 李灿 , 李园园 , 刘文娟 , 刘栩沁 , 李成琳 , 布梦晨 , 杨迎盈 , 朱雨 , 郭兔兔
IPC: C12Q1/6874 , G16B20/20
Abstract: 本发明涉及一种利用麦类作物D基因组外显子捕获测序芯片鉴定节节麦衍生种质片段的方法。包括以下步骤:使用麦类D基因组泛基因外显子捕获测序芯片对衍生渐渗系材料、衍生渐渗系材料的双亲进行捕获测序;将衍生渐渗系材料、衍生渐渗系材料的双亲的捕获测序数据比对到小麦参考基因组上,得到衍生渐渗系材料差异位点文件、亲本差异位点文件;对亲本差异位点文件对渐渗系材料差异位点文件进行过滤,保留两个差异位点文件的交集;使用交集文件和亲本差异位点文件统计窗口内衍生渐渗系材料的外源渗入比例;使用渗入比例文件绘制点图,连续高渗入比例的区域界定为外源片段。本发明能准确的用于节节麦衍生的渐渗系或者人工合成材料的外源片段鉴定。